Medical Biotechnology

Academic program

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Course
Internship 2
Course ID
MS0496
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
CFU
6
Individual study time
150
SSD
NN -
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
F
Year
2
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
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Course
Molecular diagnostics
Course ID
MS0461
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
BOLDORINI Renzo Luciano
CFU
11
Teaching duration (hours)
66
SSD
MED/08 - ANATOMIA PATOLOGICA, BIO/12 - BIOCHIMICA CLINICA E BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA, MED/05 - PATOLOGIA CLINICA
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
2
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS0462Pathologic basis of diseases MED/08 - ANATOMIA PATOLOGICA Mahmoud Abdurraouf Mokhtar Saleh
MS0463Clinical applications of Molecular Biology BIO/12 - BIOCHIMICA CLINICA E BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA Capello Daniela
MS0464Clinical Pathology MED/05 - PATOLOGIA CLINICA Cappellano Giuseppe
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Course
Molecular diagnostics: Pathologic basis of diseases
Course ID
MS0462
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
MAHMOUD ABDURRAOUF MOKHTAR SALEH
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
105
SSD
MED/08 - ANATOMIA PATOLOGICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
2
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso si concentrerà sulla patologia molecolare dei principali tumori solidi in oncologia, con una particolare enfasi sugli argomenti rilevanti per il campo della Biotecnologia Medica. Durante il corso, saranno fornite attività di autovalutazione, materiali supplementari per approfondimenti e presentazioni di gruppo su argomenti di particolare interesse.
The course will focus on the molecular pathology of the primary solid tumors in oncology, with a special emphasis on topics relevant to the field of Medical Biotechnology. Throughout the course, self-assessment activities will be provided, along with supplementary materials for further study and group presentations on topics of particular interest.
Testi di riferimento/Textbooks
Il materiale didattico, incluso le slides, fornito dal professore; i paper scientifici discussi durante le lezioni; e le risorse dei database pubblici online saranno tutte risorse utilizzate in questo corso.
The didactic material, including slides, provided by the Professor; scientific papers covered in class; and online public databases are all resources will be used in this course.
Obiettivi formativi/Mission
Lo scopo del corso è quello di rendere lo studente in grado di conoscere, interpretare e analizzare i principali argomenti dei tumori solidi del corso, che sono rilevanti per un Biotechnologo Medico, con un atteggiamento critico.
The aim of the course is to render the student able to know, interpret and analyse the main solid tumours topics of the course, that are relevant for a Medical Biotechnologist, with a critical attitude.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze avanzate di biologia cellulare e molecolare
Advance knowledge of cell and molecular biology
Metodi didattici/Teaching methods
A) Lezioni frontali con presentazioni in PowerPoint disponibili sul sito web del DIR dell'UPO (https://www.dir.uniupo.it/); B) Test di autovalutazione dopo ogni lezione; C) Presentazioni di gruppo degli studenti su argomenti concordati con il professore.
A) Taught (frontal) classes with slide presentations available on the UPO DIR website (https://www.dir.uniupo.it/); B) Self-assessment tests after each class; C) Group presentations by the students on topics agreed upon with the professor
Altre informazioni/Further information
La partecipazione alle attività di autovalutazione dopo ogni lezione è fortemente consigliata.
Participation in the self-assessment activitities after each class is strongly recommended
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Il test di Pathologic basis of diseases sarà incluso come parte dell'esame del corso integrato. Il test di Pathologic basis of diseases consisterà in quattro domande, e ai candidati sarà richiesto di: i) indicare se l'affermazione è vera o falsa; ii) fornire una spiegazione di 5-10 righe giustificando la loro scelta, e una prova orale finale. Test di autovalutazione saranno disponibili durante il corso, per servire come esempi per le domande d'esame.
The Pathologic basis of diseases exam will be included as part of the integrated course exam. The Pathologic basis of diseases exam will consist of four statements, and candidates will be required to: i) indicate whether the statement is true or false; ii) provide a 5-10 line explanation justifying their choice, and a final oral test. Self-assessment tests will be available throughout the course to serve as examples for these exam questions.
Programma esteso/Content
A. Concetti generali sui tumori solidi in oncologia: concetti generali, patologia molecolare, diagnostica molecolare e trattamento mirato. B. Carcinoma del colon-retto: concetti generali, patologia molecolare, diagnostica molecolare e trattamento mirato. C. Cancro al seno: concetti generali, patologia molecolare, diagnostica molecolare e trattamento mirato. D. Carcinoma della prostata: concetti generali, patologia molecolare, diagnostica molecolare e trattamento mirato. E. Cancro ai polmoni: concetti generali, patologia molecolare, diagnostica molecolare e trattamento mirato. F. Sarcoma dei tessuti molli: concetti generali, patologia molecolare, diagnostica molecolare e trattamento mirato. G. Sarcoma del tessuto osseo: concetti generali, patologia molecolare, diagnostica molecolare e trattamento mirato. H. Tumore del sistema nervoso centrale: concetti generali, patologia molecolare, diagnostica molecolare e trattamento mirato. I. Linfoma diffuso a grandi cellule B (DLBCL): concetti generali, patologia molecolare, diagnostica molecolare e trattamento mirato. J. Approcci di biopsia liquida per catturare l'evoluzione del tumore durante il trattamento del cancro. K. Medicina di precisione in oncologia; nuovi approcci di immunoterapia nelle neoplasie. L. Il ruolo degli studi clinici e della condivisione dei benefici in oncologia.
A. General concepts of solid tumours in onclology: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment. B. Colorectal cancer: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment. C. Breast cancer: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment. D. Prostate cancer: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment. E. Lung cancer: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment. F. Soft tissue sarcoma: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment. G. Bone tissue sarcoma: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment. H. Central nervous system (CNS) tumor: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment. I. Diffuse large B cell lymphoma (DLBCL): general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment. J. Liquid biopsy approaches to capture tumor evolution during cancer treatment. K. Precision Medicine in oncology; Novel immunotherapy approaches in neoplastic disorders. L. The role of clinical trials and Benefit Sharing in oncology
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Alla fine del corso, gli studenti saranno in grado di: i) analizzare criticamente la patologia molecolare di vari modelli di tumori solidi; ii) riconoscere l'importanza della patologia molecolare nel migliorare la medicina di precisione, la diagnosi molecolare e il trattamento mirato nei neoplasmi solidi.
At the end of the course, students will be able to: i) critically analyze the molecular pathology of various models of solid tumors; ii) recognize the significance of molecular pathology in enhancing precision medicine, molecular diagnosis, and targeted treatment in solid neoplasms.
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Course
Molecular diagnostics: Clinical applications of Molecular Biology
Course ID
MS0463
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
BOLDORINI Renzo Luciano
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
105
SSD
BIO/12 - BIOCHIMICA CLINICA E BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
2
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Panoramica sui segni distintivi dell'invecchiamento e approfondimento dei seguenti argomenti: 1) le principali vie molecolari coinvolte nella stabilità genomica, nella proteostasi e nello stress ossidativo; 2) il ruolo della senescenza nell'invecchiamento e nelle malattie associate all'età; 3) le vie metaboliche coinvolte nell'omeostasi energetica; 4) i biomarcatori dell'invecchiamento biologico; 5) le principali alterazioni metaboliche associate all'invecchiamento accelerato.
Overview on hallmarks of aging and in-depth study of the following topics: 1) the main molecular pathways involved in genomic stability, proteostasis and oxidative stress; 2) the role of senescence in aging and age-associated diseases; 3) the metabolic pathways involved in energy homeostasis; 4) the biomarkers of biological aging; 5) the main metabolic alterations associated with accelerated aging.
Testi di riferimento/Textbooks
Diapositive proiettate a lezione e altro materiale didattico fornito dal docente, articoli scientifici discussi durante le lezioni, risorse online.
Slides and other didactic material provided by the teacher; scientific papers discussed during the classes; online public database resources.
Obiettivi formativi/Mission
La crescita della popolazione anziana aumenta i tassi di prevalenza delle malattie non trasmissibili e della disabilità della vecchiaia, creando richieste che molti sistemi sanitari non sono attualmente attrezzati per soddisfare. L'obiettivo principale del corso è fornire le conoscenze di base sulle vie molecolari coinvolte nell'invecchiamento per l'identificazione di determinanti molecolari predittivi di invecchiamento sano o non sano e biomarcatori con implicazioni predittive, diagnostiche o terapeutiche per le malattie associate all'età.
The growth of the older population increases prevalence rates of non-communicable diseases and of old-age disability, creating demands that many health systems are currently not equipped to meet. The main objective of the course is providing the basic knowledge about the molecular pathways involved in aging for the identification of molecular determinants predictive of healthy or unhealthy aging and biomarkers with predictive, diagnostic or therapeutic implications for age-associated diseases.
Prerequisiti/Required background knowledge
Agli studenti è richiesta una conoscenza generale di biochimica, biologia molecolare e genetica e delle principali tecnologie utilizzate nelle indagini genetiche
The students are expected to have a general knowledge of biochemistry, molecular biology and genetics and of the main technologies used in genomic investigations
Metodi didattici/Teaching methods
Diapositive presentate durante il corso, discussione di articoli scientifici interattivi; Copia PDF di articoli scientifici
Slides presented during the course, interactive scientific papers discussion; PDF copy of scientific papers
Altre informazioni/Further information
Tutto il materiale didattico e le informazioni relative al corso saranno disponibili su DIR (https://www.dir.uniupo.it/)
All the teaching material and information regarding the course will be available on DIR (https://www.dir.uniupo.it/)
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
La valutazione consisterà in una prova scritta che comprende domande a risposta multipla e domande aperte che consentiranno di valutare l'apprendimento sugli argomenti trattati durante il corso. Il programma dettagliato del corso e le informazioni relative alla prova finale saranno disponibili su moodle DIR (https://www.dir.uniupo.it/)
Evaluation will consist in a written test which includes multiple choice questions and open questions that will allow to evaluate learning about the topics covered during the course. Detailed program of the course and information regarding the final exam will be available on moodle DIR (https://www.dir.uniupo.it/)
Programma esteso/Content
1_Statistiche sull'invecchiamento. Invecchiamento della popolazione nel mondo. La transizione demografica. La velocità dell'invecchiamento della popolazione. Il peso sociale e sanitario delle malattie croniche non trasmissibili. L'approccio del corso di vita alla salute. Determinanti chiave dell'OMS per l'invecchiamento attivo/in buona salute. 2_I segni distintivi dell'invecchiamento. Definizione molecolare di invecchiamento. Definizione di “hallmarks dell'invecchiamento” e loro interconnessioni funzionali. Breve descrizione degli hallmarks dell'invecchiamento: instabilità del DNA genomico e mitocondriale; accorciamento dei telomeri; modificazioni epigenetiche; alterazione del nutrient sensing; senescenza cellulare; esaurimento delle cellule staminali; comunicazione intercellulare alterata, infiammazione; disfunzione mitocondriale 3_Instabilità genomica: Conseguenze della mutazione sui geni e sulle funzioni proteiche. Conseguenze funzionali delle alterazioni genomiche: vantaggio proliferativo, mosaicismo somatico ed espansione clonale aberrante, cancro e malattie neurodegenerative. Alterazioni del DNA mitocondriale. 4_Modifiche epigenetiche. L'orologio epigenetico. Profilo di metilazione del DNA per prevedere la durata della vita e la durata della salute. 5_Senescenza. Tipi di senescenza; cause della senescenza; vie molecolari associate alla senescenza; effetti paracrini ed endocrini del SASP; senolitici e invecchiamento 6_Proteostasi. Definizione di rete di proteostasi. Gli chaperon HSP70, HSP90, chaperonine: principali caratteristiche e funzioni. La risposta dell'HSF1. La degradazione delle proteine da parte del proteosoma e dell'autofagia, l'autofagia mediata dagli chaperon. ER stress e UPR. Gli aggregati proteici e le fibrille amiloidi 7_Stress ossidativo. Il concetto di stress ossidativo, eustress e distress. Il concetto di ormesi nello stress ossidativo. Le principali specie reattive, radicali e non radicali, struttura e caratteristiche: ROS, RNS, specie carboniliche reattive. Il ruolo fondamentale dei sistemi NAD/NADH e NADP/NADPH nell'omeostasi redox. Il ruolo della della nicotinammide-nucleotide transidrogenasi (NNT). Le principali fonti di ROS. La reazione di Haber-Weiss/Fenton. Il sistema di eliminazione dei ROS: sistema perossiredossina/tioredossina, sistema glutatione, SOD, catalasi. Eustress. Il codice redox. I sistemi tiolo/disolfuro. Ruolo di H2O2 nella segnalazione redox: perossiporine. Le vie ROS/Keap1-NRF2 e NF-kB. La famiglia NOX di ROS che genera NADPH ossidasi. Cenni di segnalazione redox Alterazioni molecolari e cellulari promosse dallo stress ossidativo. Perossidazione lipidica. Aldeidi reattive: struttura e attività. Danno proteico da stress ossidativo. Danno proteico da stress ossidativo: carbonilazione proteica e ossidazione del gruppo tiolico. Danno al DNA e vie DDR (DNA Damage Repair); struttura dell'ossoguanina; pirimidine ossidate comuni. Suscettibilità dei telomeri al danno ossidativo. Il percorso OGG1-BER. Ruolo di PARP1 nella riparazione del DNA a valle dello stress ossidativo. Gli antiossidanti non enzimatici: vit. C, vit E, vit. A, bioflavonoidi, carotenoidi. Antiossidanti fisiologici. 8_Comunicazione intercellulare alterata: infiammazione. Infiammazione e immunosenescenza, cause di infiammazione; rilevamento dei nutrienti e infiammazione; matainflammation; tessuto adiposo e infiammazione; stress e infiammazione; insulino-resistenza e infiammazione. 9_Rilevamento di nutrienti ed energia. Segnalazione dell'insulina ed effetti metabolici dell'insulina, alterazione della segnalazione dell'insulina, obesità e diabete di tipo 2. Vie AMPK e mTOR nella regolazione dei processi catabolici e anabolici; restrizione calorica e invecchiamento
1_Aging statistics. Population aging in different countries. The demographic transition. The speed of population aging. The burden of chronic non communicable diseases. The life course approach to health. WHO key determinants for active/healthy aging. 2_The hallmarks of aging. Molecular definition of aging. Definition of “hallmark of aging” and their functional interconnections. Brief description of the hallmarks of aging: genomic and mitochondrial DNA instability; telomers attrition; epigenetic modifications; deregulation of nutrient sensing; cellular senescence; stem cell exhaustion; altered intercellular communication, inflammaging; mitochondrial disfunction 3_Genomic instability: Consequences of mutation on genes and protein functions. Functional consequences of genomic alterations: proliferative advantage, somatic mosaicism and aberrant clonal expansion, cancer and neurodegenerative disorders. Mitochondrial DNA alterations. 4_Epigenetic modifications. The epigenetic clock. DNA methylation profiling to prdict lifespan and healthspan. 5_Senescence. Types of senescence; causes of senescence; molecular pathways associated with senescence; paracrine and endocrine effects of SASP; senolitics and aging 6_Proteostasis. Definition of proteostasis network. The chaperones HSP70, HSP90, chaperonins: main characteristics and functions. The HSF1 response. Protein degradation by proteasome and autophagy, the chaperons mediated autophagy. ER stress and Unfolded Protein Response (UPR). The proteins aggregates and amyloid fibrils 7_Oxidative stress. The concept of oxidative stress, eustress and distress. The concept of hormesis in oxidative stress. The main reactive species, radicals and nonradicals, structure and characteristics: ROS, RNS, reactive carbonyl species. The backbone role of NAD/NADH and NADP/NADPH systems in redox homeostasis. The role of the energy-linked nicotinamide nucleotide transhydrogenase (NNT). The main sources of ROS. The Haber-Weiss / Fenton reaction. The ROS scavenging system: peroxiredoxin/thioredoxin system, the glutathione system, SOD, catalase. Eustress. The redox code. The thiol/disulfide systems. Role of H2O2 in redox signalling: peroxiporins. The ROS/Keap1-NRF2 and NF-kB pathways. The NOX family of ROS generating NADPH oxidases. Hints of redox signalling Molecular and cellular alterations promoted by oxidative stress. Lipid peroxidation. Reactive aldehydes: structure and activity. Protein damage by oxidative distress. Protein damage by oxidative distress: protein carbonylation and thiol group oxidation. DNA damage and DDR (DNA damage Repair) pathways; structure of oxoguanine; common oxidized pyrimidines. Susceptibility of telomeres to oxidative damage. The OGG1-BER pathway. Role of PARP1 in DNA repair downstream oxidative stress. The nonenzymatic antioxidants: vit. C, vit E, vit. A, bioflavonoids, carotenoids. Physiological antioxidants. 8_Altered intercellular communication: inflammaging. Inflammaging and immunosenescence, causes of inflammaging; nutrient sensing and inflammaging; mataflammation; adipose tissue and inflammaging; ER stress and inflammaging; insulin resistance and inflammaging. 9_Nutrient and energy sensing. Insulin signaling and metabolic effects of insulin, alteration in insulin signaling, obesity and T2D. AMPK and mTOR pathways in the regulation of catabolic and anabolic processes; caloric restriction and aging
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine del corso gli studenti acquisiranno una più profonda comprensione dei segni distintivi dell'invecchiamento e del loro ruolo nel processo di invecchiamento e nella patogenesi delle più frequenti malattie associate all'invecchiamento, come i disturbi metabolici del cancro. Gli studenti saranno in grado di valutare i percorsi molecolari alla base dell'invecchiamento e identificare potenziali biomarcatori dell'invecchiamento biologico da tradurre in opportunità predittive, diagnostiche o terapeutiche, sia in un contesto di ricerca di base e traslazionale, sia in un contesto assistenziale. Le conoscenze acquisite potranno anche essere impiegate in ambiti di studi epidemiologici e di prevenzione
At the end of the course students will gain a deeper understanding of the hallmarks of aging and their role in the aging process and in the pathogenesis of the most frequent aging-associated diseases, such as cancer metabolic disorders. Students will be able to evaluate the molecular pathways underlying aging and identify potential biomarkers of biological aging to translate into predictive, diagnostic or therapeutic opportunity both in basic and translational research and in a care setting. The acquired knowledge can also be used in epidemiological studies and prevention interventions
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Course
Molecular diagnostics: Clinical Pathology
Course ID
MS0464
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
BOLDORINI Renzo Luciano
CFU
1
Teaching duration (hours)
6
Individual study time
21
SSD
MED/05 - PATOLOGIA CLINICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
2
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Inglese
English
Contenuti/Content Summary
Questo corso fornisce una panoramica sulle attuali conoscenze in farmacogenetica e sulle importanti ricadute delle stesse in ambito clinico.
This course provides an overview of the current knowledge in pharmacogenetics.
Testi di riferimento/Textbooks
Materiale didattico fornito dal Docente sulla piattaforma DIR (diapositive in PPT) (Didattica in rete).
Teaching Material (ppt slide) provided by the lecturer.
Obiettivi formativi/Mission
Lo scopo del presente corso è quello di fornire conoscenze sulla farmacogenetica e sulla validità e utilità dei test di farmacogenomica in ambito clinico.
The aim of the present course is to provide knowledge about the influence of genetics on drug therapy and about the validity and utility of pharmacogenomic tests in the clinical setting.
Prerequisiti/Required background knowledge
Buona conoscenza di genetica, biologia molecolare e farmacologia.
Thorough knowledge of Molecular Biology and Genetics (basics of genomics as well as methods to identify mutations).
Metodi didattici/Teaching methods
Presentazioni in PowerPoint. Didattica in rete (piattaforma DIR). Lezioni frontali.
PowePoint presentation. Teaching Network on DIR Website. Frontal lessons.
Altre informazioni/Further information
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Prova scritta. Domande a risposta multipla.
Written exam. Multiple choice test
Programma esteso/Content
La variabilità individuale nella risposta al trattamento farmacologico costituisce da sempre uno dei problemi più rilevanti nella pratica clinica. Soggetti diversi rispondono in modo diverso allo stesso farmaco somministrato alla stessa dose. Questa variabilità si riscontra non solo negli effetti benefici (desiderati) ai farmaci (efficacia terapeutica), ma anche negli effetti collaterali non desiderati (tossicità). I progressi delle conoscenze genetiche, ottenute attraverso il sequenziamento dell’intero genoma umano, hanno identificato varianti genetiche ereditarie che influenzano la risposta ai farmaci. La farmacogenetica è proprio la scienza che studia le differenze genetiche ereditarie che possono influenzare le risposte individuali ai farmaci, sia in termini di effetto terapeutico che di tossicità. L'uso di queste informazioni genetiche può svolgere un ruolo importante nella pratica clinica al fine di individuare il farmaco giusto alla dose giusta, fornendo in tal modo una base scientifica alla "medicina personalizzata". Questo è particolarmente importante nelle maalttie autoimmuni dove vengono impiegati farmaci immunosoppressori o anti- infiammatori non steroidei; tuttavia questi farmaci possono avere gravi effetti collaterali e non sono sempre efficaci per soggetti con malattie refrattarie. Questo ha portato all'suo dei farmaci biologici (anticorpi monoclonali)che prendono di mira bersagli più specifici. L'efficacia/tossicità degli agenti biologici e persino dei farmaci immunosoppressori convenzionali potrebbe essere prevista in base ai profili genetici dei pazienti. In particolare, il corso approfondisce l'utilità clinica della farmacogenetica nelle seguenti malattie autoimmuni: - artrite reumatoide - lupus - sclerosi multipla - psoriasi - morbo di Crohn
One of the great challenges in drug development and therapy is maximizing therapeutic response while avoiding adverse effects. Advances in genetic knowledge, gained through sequencing, have identified heritable genetic variants that predict drug response. Pharmacogenetics is the study of inherited genetic differences in drug metabolic pathways which can affect individual responses to drugs, both in terms of therapeutic effect as well as adverse effects/ toxicity. The use of these genetic informations can play a major role in clinical practice to predict the right choice and dose of medications for individuals, thus providing a scientific basic for “personalized medicine”. This is particularly important in autoimmune diseases where conventional immunosuppressive or non-steroidal anti-inflammatory drugs are used; however, these drugs can have serious side effects and are not always effective for people with refractory diseases. This has led to use of "biologics" drug (monoclonal antibodies) that have more specific targets. The efficacy/toxicity of biological agents and even conventional immunosuppressive drugs could be predicted on the basis of patients' genetic profile. In particular, the course will explore the clinical usefulness of pharmacogenetics in the following autoimmune diseases: - rheumatoid arthritis - Lupus - multiple sclerosis - psoriasis - Crohn's disease
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Alla fine del corso gli studenti saranno in grado di: -descrivere i meccanismi alla base della risposta inter-individuale ai farmaci -presentare gli argomenti del corso in modo chiaro e comprensibile utilizzando la corretta terminologia scientifica.
At the end of the course students will be able to: -describe the mechanisms underlying the inter-individual response to drugs - present the topics of the course in a clear and understandable way using the correct scientific terminology.
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Course
Transplantation and Biocompatibility
Course ID
MS0480
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
CFU
7
Teaching duration (hours)
46
SSD
MED/15 - MALATTIE DEL SANGUE, MED/14 - NEFROLOGIA, MED/04 - PATOLOGIA GENERALE, BIO/16 - ANATOMIA UMANA, MED/28 - MALATTIE ODONTOSTOMATOLOGICHE, BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS0481Hematopoietic stem cell biology and transplantation MED/15 - MALATTIE DEL SANGUE Patriarca Andrea
MS0482Biotechnology in kidney transplantation MED/14 - NEFROLOGIA Cantaluppi Vincenzo
MS0483Transplant immunology MED/04 - PATOLOGIA GENERALE Chiocchetti Annalisa
MS0484Materials Biocompatibility BIO/16 - ANATOMIA UMANA Boccafoschi Francesca
MS0485Nanomaterials MED/28 - MALATTIE ODONTOSTOMATOLOGICHE Rimondini Lia
MS0493Molecular strategies for improving materials biocompatibility BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE Mantovani Diego
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Course
Transplantation and Biocompatibility: Hematopoietic stem cell biology and transplantation
Course ID
MS0481
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teachers
CFU
1
Teaching duration (hours)
8
Individual study time
17
SSD
MED/15 - MALATTIE DEL SANGUE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Scopi del corso: 1.apprendere le nozioni della biologia della cellula staminale 2. conoscere le metodiche di raccolta delle cellule staminali e le procedure di processazione delle stesse cellule 3. conoscere la fisiologia ed immunologia dei differenti tipi di trapianti (autologo, allogenico e da sangue cordonale) 4. conoscere la fisiopatologia della Graft versus host disease acuta e cronica 5. Conoscere le nozioni biotecnologiche applicate al trapianto (tipizzazione tissutale, monitoraggio dell'attecchimento, immunoricostituzione e ingegnierizzazione)
The aims of the course are as follows: 1. To know the biology of hematopoietic stem cell and of hemopoiesis 2. To know the sources of hematopoietic stem cells, the biology of stem cell mobilization, and the procedures of processing hematopoietic stem cells 3. To know the physiology of autologous, allogeneic and cord blood stem cell transplantation 4. To know the pathogenesis of graft versus host disease 5. To know the biotechnological procedures applied to hematopoietic stem cell transplantation (HLA typing, monitoring of engraftment and hematopoietic reconstitution, terapeutic manipulation and engineering of the graft)
Testi di riferimento/Textbooks
Materiali didattici forniti durante le lezioni, depositatiti su DIR, articoli scientifici presentati durante le lezioni o nel contesto di Journal clubs.
Slides presented during the course; materials deposited on the DIR website; scientific papers presented in class and/or at journal clubs
Obiettivi formativi/Mission
Condivisione delle conoscenze sulla biologia della cellula staminale e applicazioni nell'ambito terapeutico.
Expand the knowledge on stem cell biology and its application in clinics
Prerequisiti/Required background knowledge
Necessarie conoscenze di base di fisiologia, fisiopatologia ed immunologia.
The student is expected to have a good knowledge of basic biology principles of cellular cross-talking between cells and basic notions of histology.
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali interattive. Sono resi disponibili durante le lezioni dei questionari di autoapprendimento per testare le proprie conoscenze.
Lectures and interaction in class. A periodic self assessment of the knowledge will be planned during the classes.
Altre informazioni/Further information
Materiali aggiuntivi: Williams Hematology, 9e Author(s): Kenneth Kaushansky, Marshall A. Lichtman, Josef T. Prchal, Marcel M. Levi, Oliver W. Press, Linda J. Burns and Michael Caligiuri (available on su UPO off campus library through AccessMedicine)
Additional materials Williams Hematology, 9e Author(s): Kenneth Kaushansky, Marshall A. Lichtman, Josef T. Prchal, Marcel M. Levi, Oliver W. Press, Linda J. Burns and Michael Caligiuri (available on su UPO off campus library through AccessMedicine)
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L'esame è parte di un corso integrato. L'esame finale è scritto e consiste di domande a risposta aperta. Alle domande viene data una risposta iniziale come vero/falso ma è richiesto sempre un breve commento per motivare la scelta.
The exams is part of an integrated course. The final test will be written and it consists of 3 different statement which must be addressed as true or false by the applicant. A brief comment explaining the choice is needed. Examples of the written exam will be presented at the end of every class.
Programma esteso/Content
Programma del corso: Cellula staminale ed emopoiesi - La biologia della cellula staminale - Organizzazione del midollo osseo Sorgenti delle cellule staminali - Raccolta da midollo osseo - Raccolta da sangue periferico - Raccolta del sangue cordonale - Mobilizzazione e raccolta delle cellule staminali - Processazione e manipolazione Trapianto di cellule staminali - Trapianto autologo - Trapianto allogenico - Trapianto da cordone Regimi di condizionamento pre-trapianto - Regimi di condizionamento - Regimi mieloablativi - Regimi non mieloablativi Terapie cellulari - GVHD - Manipolazioni del trapianto - Utilizzo delle terapie cellulari
Course program: Hematopoietic stem cell and hemopoiesis - Hematopoietic stem cell biology - Bone marrow microenvironment Hematopoietic stem cells sources - Bone marrow stem cells - Peripheral blood stem cells - Cord blood stem cells - Stem cell mobilization and collection - Stem cell processing and cryopreservation Hematoietic stem cell transplantation - Autologous hematopoietic stem cell transplantation - Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation - Cord clod hematopoietic stem cell transplantation Hematopoietic stem cell transplantation conditioning regimens - Condistioning regimens for autologous hematopoietic stem cell transplantation - Myeloablative conditioning regimens for allogeneic hematopoietic stem cell transplantation - Non-myeloablative conditioning regimens for allogeneic hematopoietic stem cell transplantation Cell Therapy - Graft versus tumor reaction - Therapeutic manipulations of the graft - Therapeutic utilization of cellular populations
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Condivisione delle conoscenze sulla biologia della cellula staminale e applicazioni nell'ambito terapeutico.
The aims of the course are as follows: 1. To know the biology of hematopoietic stem cell and of hemopoiesis 2. To know the sources of hematopoietic stem cells, the biology of stem cell mobilization, and the procedures of processing hematopoietic stem cells 3. To know the physiology of autologous, allogeneic and cord blood stem cell transplantation 4. To know the pathogenesis of graft versus host disease 5. To know the biotechnological procedures applied to hematopoietic stem cell transplantation (HLA typing, monitoring of engraftment and hematopoietic reconstitution, terapeutic manipulation and engineering of the graft)
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Course
Transplantation and Biocompatibility: Biotechnology in kidney transplantation
Course ID
MS0482
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
CFU
1
Teaching duration (hours)
6
Individual study time
19
SSD
MED/14 - NEFROLOGIA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Basic knowledge of immune system activation and mechanisms of tissue injury in native and transplanted kidneys. Basic aspects of bio/hemocompatibility during hemodialysis for acute and chronic kidney diseases.
Testi di riferimento/Textbooks
Slides presented during lessons on the main topics of biotechnology applications in different fields of nephrology, dialysis and kidney transplantation
Obiettivi formativi/Mission
The main aims of this module are based on the acquirement of knowledge on the potential biotechnology applications in different fields of Nephrology as follows: -Role of immune system activation, autoimmunity, inflammation and complement activation in glomerular diseases focusing on glomerulonephritis characterized by high incidence of relapse after kidney transplantation; -Main aspects of biocompatibility and hemocompatibility in hemodialysis studying the interaction between blood and artificial membranes; -Immunobiology of kidney transplantation and mechanisms of immune-mediated graft injury (T cell- and antibody-mediated rejection).
Prerequisiti/Required background knowledge
The student is expected to have a good knowledge of basic biology principles and some notions of anatomy, histology and physiology
Metodi didattici/Teaching methods
Lectures and interaction during lessons. Didactic materials will be also archived in the DIR website. Scientific papers presented during lessons and/or at journal clubs. Self-assessment of the knowledge during lessons.
Altre informazioni/Further information
Other didactic material and selected papers/presentations on renal replacement therapies in sepsis-associated acute kidney injury. Simulation models of dialysis in this context (SIMNOVA)
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Written test based on 3 different statements which should be described as true or false by the student with the addition of a short but exhaustive comment on this choice. Nephrology final test is integrated with the other modules of the course in the path "Molecular basis of diseases".
Programma esteso/Content
-Autoimmunity, inflammation and complement cascade activation in glomerular diseases of native and transplanted kidneys (focusing on glomerulonephritis characterized by high incidence of relapse after kidney transplantation) Mechanisms of immune-mediated glomerular injury (Immunocomplex glomerular deposition, complement activation, pathways of endothelial, mesangial and podocyte cell injury); Production of autoantigens directed to podocyte PLA2R receptor in membranous nephritis; Mechanisms of glomerular injury in the course of System Lupus Erythematosous (SLE); Mechanisms of glomerular injury in the course of ANCA-associated vasculitis -Main aspects of biocompatibility and hemocompatibility in hemodialysis studying the interaction between blood and artificial membranes; Basics aspects of Acute Kidney Injury (AKI) and Chronic Kidney Disease (CKD) requiring renal replacement therapy (RRT); Physical and biological properties of dialysis membranes; Biocompatibility: role of cellular and humoral mediators including uremic toxins in tissue inflammation; Hemocompatibility: mechanisms of circuit clotting and endothelial dysfunction; Short- and long-term effects of bio/hemocompatibility -Immunobiology of kidney transplantation and mechanisms of immune-mediated graft injury (T cell- and antibody-mediated rejection). Basics aspects of kidney transplantation Complications of kidney transplantation: immune-mediated graft injury Mechanisms of T cell-mediated rejection: focus on tubular epithelial cell injury Mechanisms of antibody-mediated rejection: focus on anti-HLA antibodies and microvascular endothelial cell injury
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Knowledge and understanding of the main aspects of immune system activation in the determination of glomerular and tubular injury in both native and transplanted kidney. Application of this knowledge to explore new biotechnology-based approach for diagnosis and therapeutic treatment of these diseases. Knowledge and understanding of the mechanisms of biocompatibility and hemocompatibility during renal replacement therapies for acute kidney injury and chronic kidney disease. Application of this knowledge to evaluate biotechnology advancements and new applications of bioartificial membranes in these settings.
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Course
Transplantation and Biocompatibility: Transplant immunology
Course ID
MS0483
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
CFU
2
Teaching duration (hours)
12
Individual study time
42
SSD
MED/04 - PATOLOGIA GENERALE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il Corso descrive diversi tipi di trapianto e di rigetto del trapianto, con particolare attenzione ai meccanismi immunologici alla base. La compatibilità e i trattamenti sono descritti con attenzione agli aspetti immunologici.
The course describes different types of graft and graft rejection and their immunological mechanisms HLA typing and treatments are also briefly treated
Testi di riferimento/Textbooks
Nessuno
no reference book
Obiettivi formativi/Mission
Gli studenti acquisiranno competenze sui meccanismi immunologici alla base del rigetto di trapianto d’organo, della GVHD e delle strategie immunologiche per prevenire il rigetto
Students will understand the immunological mechanisms underlying graft rejection, GVHD and immunological strategies to prevent rejection
Prerequisiti/Required background knowledge
Sono necessarie conoscenze di base sui meccanismi di risposta immunologica
Basic knowledge of immunology are required
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali e studio attivo
Frontal lessons with slides and active learning
Altre informazioni/Further information
Nessuna
none
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L’esame consiste in untest composto da 3 affermazioni cui va risposto vero/falso fornendo poi una breve spiegazione che giustifichi la scelta. Ogni risposta può valere un massimo di 11 punti, garantendo il raggiungimento del 30 lode (33 punti)
The exam consists of 3 statements (true or false) + the explanation. Each statements accounts for a maximum of 11 points, so that the student can reach 33 corresponding to 30 cum laude.
Programma esteso/Content
Tipi di trapianto d’organo alloreattività rigetto iperacuto, acuto e cronico trattamenti per prevenire il rigetto tipizzazione HLA (test di microtossicità e reazione mista linfocitaria) Graft versus host disease tumori nel post-trapianto approcci terapeutici innovativi e/o sperimentali per prevenire il rigetto
types of graft - alloreactivity - hyperacute rejection - acute rejection - chronic rejection treatments to prevent rejection - compatibility typing (Microtoxicity test and MLC) - Graft versus host disease - malignencies post-transplantation -innovative therapeutic approaches to prevent rejection
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Gli studenti devo acquisire conoscenze sull’alloreattività ed essere in grado di descrivere i meccanismi con cui il sistema immunitario aggredisce i tessuti trapiantati
Students should understand alloreactivity and be able to describe why the immune system aggresses the graft
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Course
Transplantation and Biocompatibility: Materials Biocompatibility
Course ID
MS0484
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
BOCCAFOSCHI FRANCESCA
CFU
1
Teaching duration (hours)
6
Individual study time
21
SSD
BIO/16 - ANATOMIA UMANA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Corso di base sulla biocompatibilità dei materiali ad uso biomedicale
Basic course on the biocompatibility of materials for biomedical use
Testi di riferimento/Textbooks
Materiale didattico fornito su DIR
powerpoint presentations and videos furnished on DIR platform
Obiettivi formativi/Mission
Fornire le basi per la comprensione della biocompatibilità dei materiali ad uso biomedicale
Provide the basis for understanding the biocompatibility of materials for biomedical use
Prerequisiti/Required background knowledge
Biologia cellulare, Immunologia, biologia molecolare
Cell biology, immunology, molecular biology
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali
Frontal lectures
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Esame scritto con domande vero/falso e breve argomentazione della risposta
Written exam with true/false questions and short explanation of the answer
Programma esteso/Content
1. Concetti base di biocompatibilità 2. Polimeri: caratteristiche biomeccaniche e applicazioni in campo biomedico
1.Biocompatibility: basic concepts 2.Polymers: biomechanical characteristics and applications in the biomedical field
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Lo studente avrà appreso le conoscenze di base relative ai biomateriali (tradizionali ed innovativi) e al loro utilizzo nell'ambito della medicina rigenerativa e dell'ingegneria tissutale.
The student will have learned the basic knowledge of biomaterials (traditional and innovative) and their use in regenerative medicine and tissue engineering.
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Course
Transplantation and Biocompatibility: Nanomaterials
Course ID
MS0485
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
RIMONDINI Lia
Teachers
CFU
1
Teaching duration (hours)
6
Individual study time
21
SSD
MED/28 - MALATTIE ODONTOSTOMATOLOGICHE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso si focalizza sulle opportunità che le biotecnologie offrono per le applicazioni biomediche. Il corso si focalizza sulle proprietà e le potenziali applicazioni dei materiali alla nano dimensione in medicina.
The course focuses on the opportunities that biotechnologies offer for biomedical applications. The course focuses on the properties and potential applications of materials to the nano dimension in medicine.
Testi di riferimento/Textbooks
Articoli scientifici, capitoli di testo
Papers, reviews, chapters provided during classes
Obiettivi formativi/Mission
Conoscenza e comprensione delle principali proprietà della materia su scala nanometrica e loro caratterizzazione. Conoscenza e comprensione delle principali proprietà dei nanomateriali utilizzati in Medicina e delle loro applicazioni. Sviluppo di competenze finalizzate alla progettazione di R&D su nanomateriali per applicazioni mediche.
Knowledge and understanding of the main properties of the matter at the nanoscale and their characterization. Knowledge and understanding of the main properties of the nanomaterials used in Medicine and their applications. Development of skills addressed to plan R&D on nanomaterials for Medical applications.
Prerequisiti/Required background knowledge
Fondamenti di chimica e fisica
Fundamentals of chimics and physics
Metodi didattici/Teaching methods
Lezione in aula
Lectures
Altre informazioni/Further information
Nessuna
None
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Test scritto: enunciato, sua valutazione e commenti
Written test: Statments assessment and comments
Programma esteso/Content
Definizione di nanomateriali; proprietà dei materiali su scala nanometrica; metodi per caratterizzare i nanomateriali; metodi per la produzione di nanomateriali; esempio di nanomateriali utilizzati per la diagnosi e il trattamento di varie malattie (compreso il cancro); nanovettori per farmaci, nanomateriali per la rigenerazione dei tessuti, tossicologia dei nanomateriali.
Definition of nanomaterials; properties of the materials at the nanoscale; methods to characterize nanomaterials; methods for nanomaterials manufacturing; esample of nanomaterials used for diagnosis and treatment of various diseases (including cancer); nanocarriers for drugs, nanomaterials for tissue regeneration, toxicology of nanomaterials.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine del corso, lo studente deve conoscere le principali proprietà della materia alla nanodimensione. Lo studente deve conoscere meccanismi attraverso i quqli la materia alla nanodimensione interagisce con i tessuti e le cellule sia normali sia patologici
At the end of the course, the student must know the main properties of nanodimensional matter. The student must know the mechanisms through which nano-sized matter interacts with both normal and pathological tissues and cells.
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Course
Transplantation and Biocompatibility: Molecular strategies for improving materials biocompatibility
Course ID
MS0493
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teachers
CFU
1
Teaching duration (hours)
8
Individual study time
17
SSD
BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
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Course
Synthetic Biology and Proteomics
Course ID
MS1871
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
CFU
10
Teaching duration (hours)
60
SSD
BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA, BIO/10 - BIOCHIMICA
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS1872Synthetic biology BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA Cotella Diego
MS1873Proteomics and Metabolomics BIO/10 - BIOCHIMICA Manfredi Marcello
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Course
Synthetic Biology and Proteomics: Synthetic biology
Course ID
MS1872
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
COTELLA DIEGO
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
120
SSD
BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Inglese
English
Contenuti/Content Summary
La biologia sintetica è una disciplina emergente che abbraccia i confini della biologia, dell'ingegneria e delle scienze fisiche con l'obiettivo di progettare sistemi biomolecolari e capacità cellulari per una varietà di applicazioni. Questo corso si propone di offrire un'introduzione a questo campo in rapida evoluzione e fornire agli studenti competenze fondamentali e mentalità critiche necessarie per la ricerca in biologia sintetica. Nel corso verranno esaminati strumenti avanzati di biologia molecolare per l'assemblaggio del DNA, la costruzione di percorsi e circuiti biologici, l'editing del genoma e le strategie per il controllo trascrizionale.
Synthetic biology is an emerging field that spans the boundary of biology, engineering, and physical sciences with its goal of engineering biomolecular systems and cellular capabilities for a variety of applications. This course aims to offer an introduction to this rapidly evolving field and equip students with foundational skills and critical mindsets that are required for synthetic biology research. Advanced molecular biology tools for DNA assembly, the construction of biological pathways and circuits, genome editing, and strategies for transcriptional control will be examined in the course.
Testi di riferimento/Textbooks
Fu P, Panke S. Systems Biology and Synthetic Biology (2009). John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, New Jersey ISBN: 978-0-470-43797-1 Liljeruhm J, Gullberg E, Forster AC. (2014). Synthetic Biology – a lab manual. World Scientific Publishing Co, Singapore Smolke C, Lee SY, Nielsen J, Stephanopoulos G. Synthetic Biology: Parts, Devices and Applications. Wiley-Blackwell. ISBN: 978-3-527-33075-1 Zhao H. Synthetic Biology: Tools and Applications. Academic Press. ISBN 978-0-12-394430-6. DOI https://doi.org/10.1016/C2011-0-06857-6
Fu P, Panke S. Systems Biology and Synthetic Biology (2009). John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, New Jersey ISBN: 978-0-470-43797-1 Liljeruhm J, Gullberg E, Forster AC. (2014). Synthetic Biology – a lab manual. World Scientific Publishing Co, Singapore Smolke C, Lee SY, Nielsen J, Stephanopoulos G. Synthetic Biology: Parts, Devices and Applications. Wiley-Blackwell. ISBN: 978-3-527-33075-1 Zhao H. Synthetic Biology: Tools and Applications. Academic Press. ISBN 978-0-12-394430-6. DOI https://doi.org/10.1016/C2011-0-06857-6
Obiettivi formativi/Mission
Il corso si propone di fornire agli studenti una panoramica degli strumenti molecolari recentemente sviluppati che vengono utilizzati per il monitoraggio in vivo di eventi cellulari e / o perturbazioni di sistemi biologici. In particolare, il corso fornirà una panoramica approfondita delle metodologie e tecniche all'avanguardia utilizzate per la progettazione e fabbricazione di componenti e sistemi biologici che non esistono già nel mondo naturale, e la riprogettazione dei sistemi biologici esistenti.
The course aims to provide students with an overview of the recently developed molecular tools that are used for the in vivo monitoring of cellular events and/or perturbation of biological systems. In particular, the course will provide an in-depth overview of the state-of-the-art methodologies and techniques used for the design and fabrication of biological components and systems that do not already exist in the natural world, and the re-design of existing biological systems.
Prerequisiti/Required background knowledge
Buona conoscenza di Biologia Cellulare e Molecolare di Eucarioti e Procarioti
Good knowledge of molecular and cellular biology of Eukaryotes and Prokaryotes
Metodi didattici/Teaching methods
Le modalità di insegnamento comprendono: lezioni frontali, active learning in aula e a distanza. Lezioni frontali e attività in aula: o Lezioni magistrali supportate da presentazioni (PowerPoint) con illustrazioni grafiche, mappe mentali, filmati di animazioni dei processi cellulari o Attività in aula con partecipazione attiva degli studenti (rappresentazione di processi cellulari, instant polls, risoluzione di esercizi). Attività e materiale online (Moodle): o Materiale didattico presentato a lezione. o Videoregistrazioni sostitutive delle lezioni frontali o Quiz, forum e workshop per l'apprendimento e l'autovaluazione o Materiale opzionale per approfondimento
Teaching methods include lectures, active learning in the classroom and at distance. Classroom activities: o Lectures supported by presentations (PowerPoint) with graphic illustrations, mind maps, animation films of cellular processes o Classroom activities with active student participation (representation of cellular processes, instant polls, termination of exercises). Activities and online material (moodle): o Educational material presented in class. o Video recordings replacing the lectures o Quiz, forums and workshops for learning and self-assessment
Altre informazioni/Further information
Attività di supporto (tutorato/studenti disabili/studenti lavoratori) • Gi studenti possono porre domande e trovare un sostegno allo studio attraverso il forum dell'insegnamento su moodle • Esempi di prove di esame sono forniti nelle attività online su moodle. • Studenti con disturbi che possono condizionare l'apprendimento (ad esempio studenti daltonici, ipovedenti, ipoudenti, dislessici o con disabilità fisica) sono invitati a prendere contatto con il docente in modo da adeguare il materiale didattico, le attività in presenza e online e le loro modalità di verifica.
Support activity (tutoring/students with disabilities/working students) • Students can ask questions and find study support through the moodle teaching forum. • Examples of exam tests are provided in online activities on moodle. • Students with disorders that can affect learning (for example, colorblind, visually impaired, hearing-impaired, dyslexic or physically disabled students) are invited to contact the lecturer in order to adapt the teaching material, face-to-face and online activities and their method of verification.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Valutazione dell'apprendimento / voti Discussione, quiz, compiti a casa - 20% Proposta scritta - 50% Esame finale - 30% Discussione, quiz, compiti a casa Durante il semestre ci saranno quiz, discussioni e compiti a casa assegnati per i voti che rappresenteranno il 20% del voto finale. Progetto Ogni studente sarà responsabile della stesura di un progetto di ricerca che mira a indagare una nuova idea nel campo della biologia sintetica che sia di interesse scientifico o industriale. La proposta dovrebbe essere strutturata secondo un modello fornito dall'insegnante. Ad ogni studente verranno inoltre assegnate due proposte preparate da altri compagni di classe e redigerà una relazione scritta che rivedrà criticamente le proposte. La proposta scritta + revisione critica rappresenterà il 50% del voto finale. Esame finale È previsto un esame finale somministrato nelle sessioni ordinarie (febbraio, giugno-luglio e settembre). Tutto il materiale trattato durante la lezione sarà soggetto a test. I test sono concettualmente cumulativi perché la comprensione degli argomenti trattati all'inizio del corso sarà necessaria per comprendere i materiali trattati successivamente nel corso. L'esame finale rappresenterà il 30% del voto finale.
Evaluation of Learning/Grades Discussion, Quizzes, Homework – 20% Written Proposal – 50% Final Exam – 30% Discussion, Quizzes, Homework Throughout the semester there will be quizzes, discussions, and homework assigned for grades that will represent 20% of the final grade. Proposals Each student will be responsible for writing a research proposal that aims to investigate a novel idea in the field of synthetic biology that is of scientific or industrial interest. The proposal should be structured according to a template provided by the teacher. Each student will also be assigned two proposals prepared by other classmates and will draw up a written report that critically review the proposals. The written proposal + critical review will represent 50% of the final grade. Final Exam There will be a final exam administered at the ordinary sessions (February, June-July, and September). All material covered during class will be subject to testing. Tests are conceptually cumulative because understanding of topics covered early in the course will be required to understand materials covered later in the course. The final exam will represent 30% of the final grade.
Programma esteso/Content
Introduzione alla biologia sintetica (SynBio): la rivoluzione "Biologia 4.0". Pietre miliari della tecnologia del DNA ricombinante: batteri, plasmidi, fagi, endonucleasi di restrizione, DNA polimerasi, DNA ligasi, reazione a catena della polimerasi (PCR), sequenziamento del DNA. Parti biologiche: geni, promotori, regolatori, terminatori, open reading frames. Strumenti bioinformatici. Progettazione di oligonucleotidi, analisi di restrizione, ottimizzazione del codone, clonaggio virtuale. Tecniche e strategie di clonaggio. La clonazione del DNA "senza cicatrici": assemblaggio di Gibson, clonazione del Golden Gate, clonazione indipendente dalla legatura (LIC). Strategie SynBio: l'approccio “dal basso verso l'alto” e “dall'alto verso il basso”. Il ciclo "progettazione-costruzione-prova-apprendimento". Dai sistemi cell-free alla cellula artificiale. Clonaggio del DNA senza uno stampo: la sintesi chimica e l'assemblaggio del DNA. Riprogrammazione cellulare mediante DNA sintetico: JCVI syn1-3.0 e E. coli “ricodificato”. Il "progetto genoma minimo" e il "Progetto genoma-Scrivi". Tecnologie di ingegneria genomica: trasposoni, ricombinasi, dita di zinco, TALEN, CRISPR / Cas9 Circuiti sintetici e ingegneria metabolica. Applicazioni di SynBio nel campo delle Biotecnologie Mediche: - Biosensori: batteri intestinali geneticamente modificati per rilevare il cancro in vivo - Terapie geniche e cellulari: cellule CAR-T - Fabbriche cellulari per la produzione di proteine ​​ricombinanti - Prodotti farmaceutici: artemisinina semisintetica, cannabinoidi. - Alimenti sostenibili: Golden rice, carne coltivata in laboratorio - Probiotici geneticamente modificati - Biomateriali e ingegneria dei tessuti - Diagnostica, terapia e vaccini: lezioni da SARS-CoV-2 Questioni etiche: biosicurezza e biocontenimento, ricerca di interesse a duplice uso (DURC), biologia "fai da te" (fai da te) Brevettabilità e imprenditorialità di SynBio
Introduction to Synthetic Biology (SynBio): The “Biology 4.0” revolution. Milestones of Recombinant DNA technology: bacteria, plasmids, phages, restriction endonucleases, DNA polymerases, DNA ligases, Polymerase chain reaction (PCR), DNA sequencing. Biological Parts: genes, promoters, regulators, terminators, open reading frames. Bioinformatic tools. Oligonucleotide design, restriction analyses, codon optimization, virtual cloning. Cloning techniques and strategies. The “scar-less” DNA Cloning: Gibson assembly, Golden gate cloning, Ligation-independent cloning (LIC). SynBio strategies: the “bottom-up” and the “top-down” approaches. The “design-build-test-learn” cycle. From cell-free systems to the artificial cell. Cloning DNA without a template: the chemical synthesis and assembly of DNA. Cell reprogramming by synthetic DNA: JCVI syn1-3.0 and the “recoded” E. coli. The “minimal genome project” and the “Genome Project-Write”. Genome Engineering Technologies: Transposons, Recombinases, Zinc Fingers, TALEN’s, CRISPR/Cas9 Synthetic circuits and Metabolic Engineering. Applications of SynBio in the field of Medical Biotechnologies: Biosensors: genetically engineered gut bacteria to detect cancer in vivo Gene and cell therapies: CAR-T cells Cell factories to produce recombinant proteins Pharmaceuticals: semi-synthetic artemisinin, cannabinoids. Sustainable Foods: Golden rice, lab-grown meat Genetically engineered probiotics Biomaterials and tissue engineering Diagnostics, therapeutics, and vaccines: lessons from SARS-CoV-2 Ethical issues: Biosafety and biocontainment, Dual Use Research of Concern (DURC), “Do-it-yourself” (DIY) Biology Patentability and entrepreneurship of SynBio
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Gli studenti iscritti a questo corso potranno: 1. Definire la biologia sintetica e comprenderne l'importanza nel 21 ° secolo 2. Comprendere e descrivere le parti biologiche e la loro funzione a livello di sistema. 3. Comprendere le tecniche avanzate di biologia molecolare che facilitano la costruzione di parti e sistemi biologici. 4. Applicare un approccio scientifico alla pianificazione, esecuzione, reporting e interpretazione di progetti avanzati con l'obiettivo di creare sistemi biologici con nuove proprietà che possono essere regolate, e di analizzare criticamente i risultati e generare ipotesi verificabili da questi esperimenti 5. analizzare criticamente, presentare e difendere la letteratura scientifica in biologia sintetica, comprese le applicazioni pratiche come l'ingegneria cellulare e metabolica 6. Considerare decisioni etiche e strategie di contenimento nella biologia sintetica
Students enrolled in this course will be able to: 1. Define synthetic biology and understand its importance in the 21st century 2. Understand and describe biological parts and their function on the systems level. 3. Understand advanced molecular biology techniques that facilitate the building of biological parts and systems. 4. Apply a scientific approach to the planning, execution, reporting and interpretation of advanced projects with the aim at creating replicating systems with new properties that can be regulated, and to critically analyze the results and generate testable hypotheses from these experiments 5. critically analyze, present, and defend scientific literature in synthetic biology, including practical applications such as cell and metabolic engineering 6. Consider ethical decisions and containment strategies in synthetic biology
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Course
Synthetic Biology and Proteomics: Proteomics and Metabolomics
Course ID
MS1873
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
MANFREDI MARCELLO
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
120
SSD
BIO/10 - BIOCHIMICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso sarà svolto sia in classe che in laboratorio. Il corso prevede lo studio e l’applicazione delle più avanzate tecniche di analisi proteomica usate nel campo delle applicazioni biomediche e biotecnologiche. Saranno fornite le competenze sulle metodologie e gli strumenti impiegati nei laboratori chimici e biologici per la soluzione dei problemi proteomici e metabolomici. Le potenzialità e le criticità delle varie metodologie saranno illustrate attraverso approfondimenti ed esempi su matrici complesse. Saranno trattati gli sviluppi tecnologici più aggiornati e utili ai fini professionali e della ricerca. Saranno allestiti numerosi esperimenti proteomici e metabolomici con analisi dei campioni in spettrometria di massa, elaborazione dei dati e analisi bioinformatica.
The course will be held both in class and in the laboratory. The course includes the study and application of the most advanced proteomics and metabolomics techniques employed in biomedical and biotechnological fields. Skills on methodologies and tools used in chemical and biological laboratories, for solving biomedical and biotechnological problems will be provided. The potential and weaknesses of the various methods will be illustrated through examples on complex biological matrices. The latest technological developments will be also treated. Several proteomics and metabolomics experiment will be prepared, including mass spectrometry analysis, data elaboration and bioinformatics.
Testi di riferimento/Textbooks
Dispense e articoli forniti dal docente. Libri suggeriti per approfondimenti: - Mirzaei Hamid, Carrasco Martin (Eds.): “Modern Proteomics – Sample Preparation, Analysis and Practical Applications”, Springer International Publishing - Sanjoy K. Bhattacharya: “Metabolomics “, Humana Press
There is no required textbook. Scientific papers and slides, provided during the lessons, will represent the main teaching materials. Further suggested books: - Mirzaei Hamid, Carrasco Martin (Eds.): “Modern Proteomics – Sample Preparation, Analysis and Practical Applications”, Springer International Publishing - Sanjoy K. Bhattacharya: “Metabolomics “, Humana Press
Obiettivi formativi/Mission
Il corso fornisce allo studente un approfondimento delle più avanzate tecniche proteomiche che gli permetteranno di risolvere problemi biologici e interpretare i risultati ottenuti. Lo studente acquisirà competenze interdisciplinari che gli permetteranno di collaborare con i colleghi di area biologica, chimica e medica.
The course provides to the students a deepening of the most advanced proteomics and metabolomics techniques that will allow them to solve biological problems and interpret the results. The students will acquire interdisciplinary skills that will allow them to collaborate with colleagues from biological, chemical and medical areas.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base di biochimica, biologia e tecniche di laboratorio.
Basic biochemistry, biology and laboratory techniques.
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali ed esercitazioni in laboratorio per l'apprendimento pratico delle tecniche descritte.
Frontal lessons and laboratory experiences.
Altre informazioni/Further information
Controllo dell'apprendimento: Discussione degli argomenti durante le lezioni.
Learning control: Discussion of topics during class.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Relazione e discussione orale. Esame orale. La prova prevede un numero variabile di domande riguardante l'intero programma e la discussione di una Presentazione/Relazione preparata dallo studente su un argomento concordato precedentemente con il docente. La valutazione complessiva terrà conto della Presentazione/Relazione preparata dallo studente e del punteggio conseguito nelle singole domande.
Oral examination. The test consists of a variable number of questions regarding the whole program and the discussion of a presentation / report prepared by the student on a topic previously agreed with the teacher. The overall assessment will take account of the Presentation / Report prepared by the student and of the marks obtained in individual applications.
Programma esteso/Content
Introduzione al corso, apprendimento dei principi di funzionamento della moderna strumentazione per analisi proteomica, metabolomica e delle prestazioni analitiche. Proteomica e metabolomica targeted e untargeted. Parte pratica: esperienze di laboratorio con estrazione di proteine e piccolle molecule da diversi tipi di matrici (fluidi biologici, colture cellulari, etc.) e analisi dei campioni con spettrometria di massa. Analisi statistica di grandi dataset e interpretazione dei risultati. Analisi bioinformatica
Introduction to the course, learning of the principles of operation of the modern scientific instrumentation and laboratory testing. Targeted and untargeted proteomics and metabolomics. Lab experience: Sample preparation from different matrixes (biological fluids, cells, etc.) and analysis with mass spectrometry. Statistical analysis of large datasets and interpretation of results. Bioinformatics analysis
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al fine di raggiungere le conoscenze e le competenze corrispondenti al livello minimo di sufficienza, allo studente si chiede di dimostrare: Conoscenza e comprensione: - conoscere i principi base di funzionamento teorico-pratico delle tecniche e metodologie affrontate durante il corso; - conoscere i principi teorico-pratici per poter utilizzare le tecniche proteomiche e metabolomiche adeguate per l'analisi di campioni biologici. Capacità di applicare conoscenza e comprensione: - capacità di scegliere, in funzione della problematica posta, quale sia l'approccio più adatto alla soluzione; Abilità comunicative: Capacità di comunicare in modo chiaro ed esauriente le metodiche di analisi Per il conseguimento di un livello avanzato, lo studente deve dimostrare di: - essere in grado di risolvere un problema biomedico o biotecnologico con la tecnica più adatta.
In order to reach the knowledge and skills corresponding to the minimum level of sufficiency, the student should demonstrate: Knowledge and understanding: - to know the basic principles of theoretical-practical operation of the techniques and methodologies presented during the course; - know the theoretical-practical principles in order to use the appropriate techniques for the analysis of biological samples. Ability to apply knowledge and understanding: - ability to choose, depending on the problem proposed, what is the best approach to the solution; Communication skills: Ability to communicate clear and exhaustive methods of analysis To achieve an advanced level, the student must: - be able to solve a biomedical problem with the most suitable technique.
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Course
Internship 2
Course ID
MS1880
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
CFU
3
Individual study time
75
SSD
NN -
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
F
Year
2
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
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Course
Clinical Omics
Course ID
MS1874
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
Gennari Alessandra
CFU
11
Teaching duration (hours)
80
SSD
MED/06 - ONCOLOGIA MEDICA, MED/14 - NEFROLOGIA, MED/15 - MALATTIE DEL SANGUE, MED/04 - PATOLOGIA GENERALE
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
2
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS1875Omics in Oncology MED/06 - ONCOLOGIA MEDICA Gennari Alessandra
MS1876Omics in Nephrology MED/14 - NEFROLOGIA Cantaluppi Vincenzo
MS1877Omics in Hematology MED/15 - MALATTIE DEL SANGUE Gaidano Gianluca
MS1878Cytomics MED/04 - PATOLOGIA GENERALE Chiocchetti Annalisa
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Course
Clinical Omics: Omics in Oncology
Course ID
MS1875
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
Gennari Alessandra
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
95
SSD
MED/06 - ONCOLOGIA MEDICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
2
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
The course is focused on a comprehensive overview of the clinical utility of multi-omics in tumor classifications, prognostications, diagnostics, and the role of data integration in the search for novel biomarkers and therapeutic opportunities. Extensive analysis of the currently used classificators will be detailed.
Testi di riferimento/Textbooks
Powerpoint slide presentation Scientific articles
Obiettivi formativi/Mission
To provide the students with elements of knowledge relating to the most important oncological pathologies with particular reference to the themes of the multiomics approach in the diagnosis and treatment and also according to currently available targeted agents.
Metodi didattici/Teaching methods
Powerpoint slide presentation Scientific articles
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Multiple choice quiz
Programma esteso/Content
The principles of personalised medicine in oncology will be presented, including also the different therapeutic opportunities by tumor type and different subtypes of the same tumors. The development of the most used targeted agents will be discussed. The different “omic” techniques will be explained.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
The student is expected to be able to identify the best molecula approach for the different tumor types and to understand the impact of the personalised "omic" approach in cancer medicine.
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Course
Clinical Omics: Omics in Nephrology
Course ID
MS1876
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
Gennari Alessandra
CFU
1
Teaching duration (hours)
8
Individual study time
17
SSD
MED/14 - NEFROLOGIA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
2
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Basic knowledge of potential Omics application in different fields of nephrology, dialysis and kidney transplantation. Evaluation of Omics technology for biomarker discovery in body fluids mainly focus on urine (liquid biopsy).
Testi di riferimento/Textbooks
Slides presented during lessons on the main topics of Omics applications in different fields of nephrology, dialysis and kidney transplantation
Obiettivi formativi/Mission
The main aims of this module are based on the acquirement of knowledge on the state of the art and potential applications of Omics in different fields of Nephrology as follows: -Biomarkers of glomerular diseases and progressive loss of kidney function; -Genetic and rare diseases affecting the kidney; -Acute Kidney Injury (AKI) including particular settings such as sepsis and progressive loss of kidney function; -Chronic Kidney Disease (CKD)-associated organ dysfunction (cardiovascular, neurological and immunologic alterations) -Kidney Transplantation: biomarkers of acute and chronic graft dysfunction focusing on Delayed Graft Function (DGF) due to ischemia-reperfusion injury and immune-mediated graft rejection.
Prerequisiti/Required background knowledge
The student is expected to have a good knowledge of basic principles of cellular and molecular biology and some notions of anatomy, histology and physiology.
Metodi didattici/Teaching methods
Lectures and interaction during lessons. Didactic materials will be also archived in the DIR website. Scientific papers presented during lessons and/or at journal clubs. Self-assessment of the knowledge during lessons.
Altre informazioni/Further information
Other didactic material and selected papers/presentations on Omics technology application to study extracellular vesicles as biomarkers of disease state in body fluids (liquid biopsy) will be discussed.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Written test based on 3 different statements which should be described as true or false by the student with the addition of a short but exhaustive comment on this choice. Nephrology final test is integrated with the other modules of the course in the path "Systems biomedicine".
Programma esteso/Content
Omics technology will be exploited in the following different nephrological settings with the aim of biomarker discovery through liquid biopsy and histological/molecular biology evaluation of injured tissues: -Glomerulonephritis: primary glomerulonephritis (IgA nephropathy, membranous nephropathy) and secondary glomerulonephritis (ANCA-associated vasculitis, lupus nephritis) -Genetic and rare diseases: Omics application in glomerular diseases leading to nephrotic syndrome and tubulo-cystic diseases -Acute kidney Injury (AKI): mechanisms of endothelial and tubular epithelial injury during AKI, distant organ dysfunction and progression from AKI to Chronic Kidney Disease (CKD) due to the development of tissue fibrosis; -Chronic Kidney Disease (CKD): role of Omics in CKD-associated organ dysfunction (cardiovascular, neurological and immunologic alterations) -Kidney Transplantation: tissue-derived biomarkers of Delayed Graft Function (DGF) due to ischemia-reperfusion injury and of T cell-mediated or antibody-mediated kidney graft rejection. Polymorphisms involved in kidney graft rejection and in other transplant complications such as development of diabetes, cardiovascular disease, infections, tumors. A part of the module will be dedicated to Omics application to study Extracellular Vesicles (EVs) isolated from different body fluids, in particular urine: -Isolation of EVs (ultracentrifugation) -Phenotypic characterization of EVs including size and concentration (Nanotrack analysis-Nanosight), proteomic, transcriptomic and microRNA analysis.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Knowledge and understanding of the main aspects of Omics application in different fields of nephrology, dialysis and kidney transplantation. Application of this knowledge to explore the state of the art as well as new potential biomarkers and therapeutic targets in specific clinical settings such as primary and secondary glomerulonephritis, rare and genetic kidney diseases, Acute Kidney Injury (AKI), Chronic Kidney Disease (CKD), kidney transplantation. A section of the module will be dedicated to the study of extracellular vesicles (EVs) isolated from body fluids in the above-mentioned clinical settings and to the methodology useful for their phenotypic characterization.
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Course
Clinical Omics: Omics in Hematology
Course ID
MS1877
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
Gennari Alessandra
CFU
3
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
51
SSD
MED/15 - MALATTIE DEL SANGUE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
2
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso tratterà l'approccio "omics", con particolare riguardo alla genomica, applicato ad alcuni modelli rappresentativi di neoplasie oncoematologiche, analizzando in particolar modo i punti rilevanti per la professione di Biotecnologo Medico. Durante il corso verranno anche proposti esercizi di autovalutazione, materiale aggiuntivo per approfondimenti e presentazioni di gruppo su argomenti di particolare interesse.
The course will deal with the omics approach, with a particular focus on genomics, applied to representative models of haematological neoplasms, especially by analysing the topics relevant for the profession of Medical Biotechnologist. During the course, self-evaluation exercises will also be proposed, as well as additional material for in-depth study and group presentations on topics of particular interest.
Testi di riferimento/Textbooks
Testo per la consultazione: Williams Hematology, 9e Author(s): Kenneth Kaushansky, Marshall A. Lichtman, Josef T. Prchal, Marcel M. Levi, Oliver W. Press, Linda J. Burns and Michael Caligiuri (disponibile su UPO off campus library via AccessMedicine)
Reference textbook: Williams Hematology, 9e Author(s): Kenneth Kaushansky, Marshall A. Lichtman, Josef T. Prchal, Marcel M. Levi, Oliver W. Press, Linda J. Burns and Michael Caligiuri (available on UPO off campus library via AccessMedicine)
Obiettivi formativi/Mission
L'obiettivo del corso e' di rendere lo studente capace di conoscere, interpretare ed analizzare le principali applicazioni e implicazioni cliniche delle tecnologie "omics" negli argomenti inerenti al corso e rilevanti per un Biotecnologo Medico, in maniera critica, come richiesto dal descrittore di Dublino 3.
The aim of the course is to render the student able to know, interpret and analyse the main applications and clinical implications of comics technologies for the topics of the course, that are are relevant for a Medical Biotechnologist, with a critical attitude, as requested by the Dublin descriptor 3.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di Ematologia molecolare applicata alle malattie oncoematologiche e conoscenze di genomica
Knowledge of molecular Hematology applied to oncohematological diseases and knowledge of genomics
Metodi didattici/Teaching methods
A) Lezioni frontali con presentazioni di diapositive disponibili sul sito DIR dell'universita' (https://www.dir.uniupo.it/); B) Test di autovalutazione dopo ogni lezione; C) Presentazioni a gruppo da parte degli studenti su argomenti concordati con il docente
A) Taught (frontal) classes with slide presentations available on the UPO DIR website (https://www.dir.uniupo.it/); B) Self-assessment tests after each class; C) Group presentations by the students on topics agreed upon with the professor
Altre informazioni/Further information
La partecipazione ai test di autovalutazione dopo ogni lezione è fortemente raccomandata
Participation in the self-assessment activitities after each class is strongly recommended
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L'esame si svolge nell'ambito del corso integrato. L'esame di Omics in Hematology consiste in 3 affermazioni, per le quali il candidato deve: i) definire vero/falso; ii) scrivere 5-10 righe di commento per giustificare la scelta. Esempi di questi testsono forniti come test di autovalutazione dopo ogni lezione
The exam will be in the context of the exam of the integrated course. The exam of Omics in Hematology will be based on 4 statements, for which the candidate has to: i) assign true/false; ii) write 5-10 lines of comment to justify the choice. Examples of these tests are provided as self-assessment tests after each class.
Programma esteso/Content
A. "Clinical Omics" della leucemia linfatica cronica: implicazioni per la diagnosi e l'approccio di medicina di precisione B. "Clinical Omics" del linfoma diffuso a grandi cellule B: implicazioni per la prognosi e per la target therapy C. "Clinical Omics" della leucemia acuta linfoblastica: implicazioni per la diagnosi e l'approccio di medicina di precisione D. "Clinical Omics" della leucemia acuta mieloide: implicazioni per la classificazione della malattia, per la prognosi e per la target therapy E. "Clinical Omics" delle neoplasie mieloproliferative F. "Clinical Omics" del mieloma multiplo G. Omics e studi clinici per le neoplasie ematologiche
A. Clinical Omics of chronic lymphocytic leukemia: implications for diagnosis and management with a precision medicine approach B. Clinical Omics of diffuse large B cell lymphoma: implications for prognosis and target therapy C. Clinical Omics of acute lymphoblastic leukemia: implications for diagnosis and precision medicine management D. Clinical Omics of acute myeloid leukemia: implications for disease classification, prognosis and target therapy E. Clinical Omics of myeloproliferative neoplasms F. Clinical Omics of multiple myeloma G. Omics and clinical trials for hematological neoplasia
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Alla fine del corso, lo studente sarà in grado di: i) analizzare criticamente le implicazioni cliniche delle "omics" in vari modelli di neoplasie ematologiche; ii) apprezzare l'importanza delle tecnologie "comics" per migliorare la medicina di precisione, la diagnosi molecolare e la terapia mirata delle neoplasie ematologiche
At the end of the course, the student will be able to: i) critically analyse the clinical implications of omics for several models of hematologic malignancies; ii) appreciate the importance of omics technologies for improving precision medicine, molecular diagnosis and target treatment in hematologic neoplasia
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Course
Clinical Omics: Cytomics
Course ID
MS1878
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
Gennari Alessandra
CFU
2
Teaching duration (hours)
12
Individual study time
42
SSD
MED/04 - PATOLOGIA GENERALE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
2
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il Corso descrive diverse tecnologie e metodologie che analizzano, a livello di singola cellula, la complessitò cellulare al fine di comprendere l’architettura e le funzioni del sistema cellulare.
The course describes different technologies and systems analysing, at a single cell level, cellular complexity to understand the molecular architecture and functionality of the cell system.
Testi di riferimento/Textbooks
nessuno
none
Obiettivi formativi/Mission
Gli studenti apprenderanno le basi della citometria a flusso, del cell sorting, dell’analisi a singola cellula, e della citometria di massa applicata ai tessuti, abbinate alle scienze omiche applicate a queste tecnologie.
Students will gain insights in flow cytometry, cell sorting, single cell analysis, imaging mass cytometry and omic applications to these technologies.
Prerequisiti/Required background knowledge
Sono necessarie conoscenze di base di immunologia e biochimica
Basic knowledge of immunology and biochemistry are required
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali con l’ausilio di diapositive e ove possibile attività sugli strumenti
Frontal lessons with slides and active learning and when possible use of instrumentation
Altre informazioni/Further information
Nessuna
None
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L’esame consiste in untest composto da 3 affermazioni cui va risposto vero/falso fornendo poi una breve spiegazione che giustifichi la scelta. Ogni risposta può valere un massimo di 11 punti, garantendo il raggiungimento del 30 lode (33 punti)
The exam consists of 3 statements (true or false) + the explanation. Each statements accounts for a maximum of 11 points, so that the student can reach 33 corresponding to 30 cum laude.
Programma esteso/Content
1- citometria a flusso e le sue applicazioni 2- citometria multiparametrica 3- Cell Sorting e le sue applicazioni 4- Citomica a singola cellula 5- Vescicolomica 6- Citometria di massa applicato ai tessuti
1- Flow Cytometry and its application 2- multiparametric cell evaluation 3- Cell Sorting and its application 4- Single cell Cytomics 5- Vescicolomics 6- Imaging mass Cytomics
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Gli studenti impareranno come la citomica apra una prospettiva non solo nella comprensione della biologia nello spazio, ma soprattutto alla medicina specializzata.
Students should understand how cytomics not only provides a new framework for spatiotemporal systems biology but enriches personalized medicine
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Course
Experimental thesis
Course ID
MS0451
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
CFU
14
Individual study time
350
SSD
PROFIN_S -
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
E
Year
2
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
G
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Course
Public health and regulatory aspects
Course ID
MS0473
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
CFU
11
Teaching duration (hours)
68
SSD
MED/42 - IGIENE GENERALE E APPLICATA, SECS-P/07 - ECONOMIA AZIENDALE, MED/01 - STATISTICA MEDICA
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS0474Public Health MED/42 - IGIENE GENERALE E APPLICATA Faggiano Fabrizio, Ferrante Daniela
MS0475Innovation and Patents SECS-P/07 - ECONOMIA AZIENDALE Gattei Valter, Ferrante Daniela
MS0476Biomedical statistics MED/01 - STATISTICA MEDICA Ferrante Daniela
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Course
Public health and regulatory aspects: Public Health
Course ID
MS0474
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
FERRANTE Daniela
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
95
SSD
MED/42 - IGIENE GENERALE E APPLICATA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
- use of the basic statistics measures of association; - study designs for the establishment of a causal link; - study designs for the evaluation of effects of interventions; - main bias of scientific research; - synthesis of scientific literature, from systematic reviews to guidelines and clinical pathwaysa; - main databases of scientific literature, and systematic reviews; - critical appraisal of a scientific paper.
Testi di riferimento/Textbooks
Power point presentations Scientific papers given by teachers Othe materials available into the DIR platform
Obiettivi formativi/Mission
To be able to find, read and use scientific literature, in particular: - to build a search strategy in main medical literature databases; - to find relevant papers to answer specific researche questions; - to evaluate the quality of scientific reports; - to describe the components and the functioning of knowledge transfer, from research to practice.
Prerequisiti/Required background knowledge
Basic statistics
Metodi didattici/Teaching methods
Lessons, reading of scientific paper, discussions
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Reading of a recently published scientific paper (trial or systematic review), and filling in of an open ended questionnaire
Programma esteso/Content
- Introduction: benefits and pitfalls of the translation from research to practice; - On the concept of efficacy and effectiveness; - Studies for the evaluation of effects of health interventions; - Systematic reviews; - Guidelines and other instruments for the science transfer; - Evaluation and approval process for the medicines authorization; - The editorial process of scientific journals;
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Ability to undestand the different steps of the process of the scientific work
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Course
Public health and regulatory aspects: Innovation and Patents
Course ID
MS0475
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
FERRANTE Daniela
CFU
1
Teaching duration (hours)
8
Individual study time
17
SSD
SECS-P/07 - ECONOMIA AZIENDALE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
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Course
Public health and regulatory aspects: Biomedical statistics
Course ID
MS0476
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
FERRANTE Daniela
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
105
SSD
MED/01 - STATISTICA MEDICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
English
English
Contenuti/Content Summary
Il corso si articola in una prima parte dove saranno trattati gli argomenti relativi alla statistica descrittiva e in una seconda parte che riguarderà la statistica inferenziale
The course consists in a first part with topics related to descriptive statistics and in a second part that will concern the inferential statistics.
Testi di riferimento/Textbooks
W.W. Daniel, CL. Cross Biostatistics, Tenth edition. John Wiley & Sons Rosner B. Fundamentals of Biostatistics. Eighth edition. Brooks/Cole Pub Co
W.W. Daniel, CL. Cross Biostatistics, Tenth edition. John Wiley & Sons Rosner B. Fundamentals of Biostatistics. Eighth edition. Brooks/Cole Pub Co
Obiettivi formativi/Mission
Il corso si propone di: - fornire allo studente i fondamenti metodologici relativi alla statistica descrittiva ed inferenziale - saper applicare in modo appropriato le metodologie statistiche con l'obiettivo di essere in grado di sintetizzare le informazioni derivanti da ricerche scientifiche - saper interpretare i risultati ottenuti - select the appropriate statistical method to summarize study data - interpretation of the results
The course aims to: - provide methodological issues related to descriptive and inferential statistics - select the appropriate statistical method to summarize study data - interpretation of the results
Prerequisiti/Required background knowledge
Nozioni di matematica di base
Basic knowledge in mathematics
Metodi didattici/Teaching methods
Didattica frontale, Esercitazioni in aula
Lectures, Classroom exercises
Altre informazioni/Further information
Si invitano gli studenti ad iscriversi al corso sulla piattaforma Moodle per poter accedere al materiale didattico
The Course material is available in the Moodle platform.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Prova scritta. L’obiettivo della prova consiste nel verificare che lo studente sappia applicare le conoscenze acquisite durante il corso in modo opportuno tramite la soluzione di esercizi e domande aperte riguardanti gli argomenti indicati nel programma del corso
Written exam. The exam aims to verify knowledge and skills acquired by the student through the solution of exercises and open questions concerning the course programme
Programma esteso/Content
Distribuzioni di frequenza. Misure di tendenza centrale e di variabilità. I concetti base della probabilità. Indipendenza stocastica, probabilità condizionata. La distribuzione di probabilità: la distribuzione di Poisson e gaussiana. Le nozioni di campione e di spazio campionario. La distribuzione della media campionaria. I concetti di stima puntuale ed intervallare. I principali test di significatività: la verifica di ipotesi su una media, sulla differenza fra medie, su una proporzione. Il concetto di errore di prima e seconda specie e di potenza di un test statistico. Il test Chi-quadrato. L’odds ratio come misura di associazione. Correlazione e regressione lineare semplice. Analisi dati di sopravvivenza.
The frequency distribution. Measures of Central Tendency and dispersion. Properties of Probability. Probability distribution: the Poisson and normal distribution. Sampling distribution. Distribution of the sample mean. Confidence interval. Hypothesis testing: a single population mean, the difference between two population means, a single population proportion. Type I and type II error and the power of a test. Chi-square test. Odds ratio. The correlation coefficient and the regression model. Survival analysis.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Conoscenza e comprensione: conoscere in modo approfondito i metodi statistici necessari per l'analisi di dati di natura clinica. Capacità di applicare conoscenza e comprensione: tradurre in pratica le nozioni teoriche e metodologiche acquisite durante il corso operando concretamente nella soluzione di esercizi di analisi dati. Autonomia di giudizio: acquisizione di autonomia di giudizio nel condurre l’analisi dei dati ottenuti da indagini campionarie proponendo soluzioni adeguate. Abilità comunicative: capacità di comunicare con chiarezza, rigore scientifico e metodologico le conoscenze. Capacità di apprendimento: affrontare in modo autonomo le informazioni ottenute da studi clinici con l’obiettivi di raccogliere e organizzare i dati ed interpretare in modo corretto le informazioni rilevate.
Knowledge and understanding: to go in depth of statistical methods for the analysis of clinical data. Ability to apply knowledge and understanding: translating theory into practice by concretely working at the solutions to exercises. Decision-making autonomy: acquiring autonomy in decision to conduct the analysis of data obtained from surveys. Communication skills: ability to communicate knowledge with clarity, scientific and methodological rigour. Learning skills: dealing with the information obtained from clinical studies with the objective of collecting and organizing data and correctly interpreting the information.
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Course
Scientific English Course for the thesis
Course ID
MS2001
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2021/2022
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
KALININA IRINA
Teachers
SSD
NN -
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course category
D
Year
2
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso è progettato per fornire agli studenti l'opportunità di migliorare la loro conoscenza delle convenzioni dell'inglese accademico e scientifico. Il programma mira a trattare alcune delle aree della comunicazione scientifica che gli studenti devono padroneggiare per promuovere con successo la loro ricerca e scrivere la loro tesi. Gli studenti avranno anche la possibilità di migliorare il loro vocabolario e la grammatica dell'inglese accademico.
The course is designed to provide students with an oppurtunity to improve their knowledge of the conventions of academic and scientific English. The syllabus aims to cover some of the areas of scientific communication that students should master in order to successfully promote their research and write their thesis. Students will also get a chance to improve their academic English vocabulary and grammar.
Testi di riferimento/Textbooks
Il libro richiesto per il corso è "English for Writing Research Papers" di Wallwork, Adrian. Si può chiamare o scrivere ala LIBRERIA SCIENTIFICA UNIVERSITARIA RESCALLI (VIA DEI MILLE 1 D, 28100 Novara) allo 0321613113 / scientificarescalli@gmail.com Libri opzionali: R.E.Taylor (2011) Medical Writing. A Guide for Clinicians, Educators and Researchers, 2nd edition, Springer, Ney York R.A.Day, N.Sakaduski (2011) Scientific English. A Guide for Scientists and Other Professionals. 3rd edition, Greenwood, Oxford. J.D.Lester, J.D.Jester Jr (2015) Writing Research Papers. A Complete Guide. 15th edition. Pearson. H.Glasman-Deal (2010) Science Research Writing for Non-Native Speakers of English. Imperial College Press, London. A.Wallwork (2016) English for Academic Research: Grammar. Springer U.Eco (2015) How to Write a Thesis. The MIT Press. P.M.S. O’Brien, F.B. Pipkin (2017) Introduction to Research Methodology for Specialists and Trainees. 3rd edition. Cambridge University Press, Cambridge
The required book for the course is by Wallwork, Adrian, "English for Writing Research Papers". Please visit or call/write to LIBRERIA SCIENTIFICA UNIVERSITARIA RESCALLI (VIA DEI MILLE 1 D, 28100 Novara) at 0321613113/ scientificarescalli@gmail.com - the bookshop already has the books available. Optional books (it's not necessary to buy those unless you want to) R.E.Taylor (2011) Medical Writing. A Guide for Clinicians, Educators and Researchers, 2nd edition, Springer, Ney York R.A.Day, N.Sakaduski (2011) Scientific English. A Guide for Scientists and Other Professionals. 3rd edition, Greenwood, Oxford. J.D.Lester, J.D.Jester Jr (2015) Writing Research Papers. A Complete Guide. 15th edition. Pearson. H.Glasman-Deal (2010) Science Research Writing for Non-Native Speakers of English. Imperial College Press, London. A.Wallwork (2016) English for Academic Research: Grammar. Springer U.Eco (2015) How to Write a Thesis. The MIT Press. P.M.S. O’Brien, F.B. Pipkin (2017) Introduction to Research Methodology for Specialists and Trainees. 3rd edition. Cambridge University Press, Cambridge
Obiettivi formativi/Mission
L'apprendimento degli strumenti e delle convenzioni di comunicazione nelle scienze offre molteplici vantaggi agli studenti. Il corso si propone di insegnare i fondamenti di una scrittura scientifica efficace da molteplici prospettive. L'istruzione si concentrerà principalmente sul processo di scrittura della tesi.
Learning the tools and communication conventions in the sciences provides multiple benefits to students. The course aims to teach the fundamentals of effective scientific writing from multiple perspectives. Instruction will focus primarily on the process of writing the thesis.
Prerequisiti/Required background knowledge
Gli studenti devono avere almeno un livello B2 in inglese. La frequenza minima consigliata al corso è del 70%.
Students are expected to have at least a B2 level in English. The attendance recommendation for the course is 70% minimum.
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali: le lezioni forniranno linee guida e principi teorici nonché esempi pratici tratti da testi scientifici ed esercizi per insegnare agli studenti come applicare le linee guida al proprio lavoro.
Lectures: the lectures will provide theoretical guidelines and principles as well as practical examples from scientific texts and exercises to teach students how to apply the guidelines to their own work.
Altre informazioni/Further information
Collegarsi alla pagina DIR del corso: https://www.dir.uniupo.it/course/view.php?id=15668
Please connect to the DIR page of the course: https://www.dir.uniupo.it/course/view.php?id=15668
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Gli studenti che hanno frequentato almeno l'80% delle lezioni (con una partecipazione attiva) e che hanno fatto la loro presentazione finale (i dettagli saranno forniti durante il corso) ricevono un ‘idoneo' automatico. Coloro che non si qualificano per il ‘idoneo' automatico dovranno sostenere un esame.L'esame sarà computerizzato e consisterà in varie domande (scelta multipla, vero / falso, compilazione, ecc.). Le domande riguarderanno i contenuti del corso / lezione.
Students who have attended at least 80% of the classes (with active participation) and made their final presentation (details will be given during the course) receive an automatic ‘pass’. Those who do not qualify for the automatic ‘pass’ will need to take a test. The exam will be computer-based and consist of various questions (multiple choise, true/false, fill-in, etc.). The questions will pertain to the course/lecture contents.
Programma esteso/Content
Ogni lezione durerà 4 ore (2 lezioni universitari). Lezione 1 1 Introduzione alla scrittura scientifica. Scegli il tuo argomento. 2 Strutturare una frase: ordine delle parole 3 titoli Lezione 2 4 Estratto 5 Strutturare i paragrafi 6 Essere concisi e rimuovere la ridondanza Lezione 3 7 Introduzione e proposta di recerca 8 Spezzare frasi lunghe 9 Evitare ambiguità, ripetizioni e linguaggio vago Lezione 4 10 Revisione della letteratura 11 Chiarire chi ha fatto cosa 12 Plagio e parafrasi Lezione 5 13 metodi 14 Evidenzia i tuoi risultati 15 Discutere i propri limiti Lezione 6 16 Risultati 17 Discussione 17 'Copertura' e critica Lezione 7 19 Conclusioni 20 Il controllo finale
Each lesson will have the duration of 4 hours (2 university lessons). Lesson 1 1 Introduction into scientific writing. Choosing your topic. 2 Structuring a Sentence: Word Order 3 Titles Lesson 2 4 Abstracts 5 Structuring Paragraphs 6 Being Concise and Removing Redundancy Lesson 3 7 Introduction and research proposal 8 Breaking Up Long Sentences 9 Avoiding Ambiguity, Repetition, and Vague Language Lesson 4 10 Review of the Literature 11 Clarifying Who Did What 12 Plagiarism and Paraphrasing Lesson 5 13 Methods 14 Highlighting Your Findings 15 Discussing Your Limitations Lesson 6 16 Results 17 Discussion 17 Hedging and Criticising Lesson 7 19 Conclusions 20 The Final Check
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Entro la fine del corso, gli studenti dovrebbero aver acquisito una buona comprensione dei principi di scrittura scientifica applicati al lavoro sulla loro tesi.
By the end of the course, students are expected to have gained a good understand of the scientific writing principles applied to the work on their thesis.
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Course
Fertility, reproduction and endocrine system biotechnologies
Course ID
MS0452
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
MARZULLO Paolo
CFU
4
Teaching duration (hours)
24
SSD
MED/13 - ENDOCRINOLOGIA, MED/40 - GINECOLOGIA E OSTETRICIA
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS0453Endocrinology and Metabolism MED/13 - ENDOCRINOLOGIA Marzullo Paolo
MS0454Biotechnology of reproduction MED/40 - GINECOLOGIA E OSTETRICIA Remorgida Valentino
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Course
Fertility, reproduction and endocrine system biotechnologies: Endocrinology and Metabolism
Course ID
MS0453
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
MARZULLO Paolo
Teachers
CFU
2
Teaching duration (hours)
12
Individual study time
40
SSD
MED/13 - ENDOCRINOLOGIA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Inglese
English
Contenuti/Content Summary
I principali contenuti del corso sono la descrizione dei meccanismi biologici e molecolari, e del ruolo delle biotecnologie nella fase diagnostico-terapeutica delle principali malattie endocrinologiche e metaboliche. Verranno inoltre descritti aspetti biotecnologici emergenti dei farmaci innovativi utilizzati in endocrinologia e metabolismo.
The main contents of the course are the description of biological and molecular mechanisms, and of the role of biotechnologies in the diagnostic-therapeutic phase of the main endocrinological and metabolic diseases. Emerging biotechnological aspects of innovative drugs used in endocrinology and metabolism will also be described.
Testi di riferimento/Textbooks
Eric I. Felner, Guillermo E. Umpierrez. Endocrine pathophysiology. Lippincott Williams And Wilkins (12/2013)
Eric I. Felner, Guillermo E. Umpierrez. Endocrine pathophysiology. Lippincott Williams And Wilkins (12/2013)
Obiettivi formativi/Mission
Il modulo ha l'obiettivo di rendere preparati gli studenti relativamente agli aspetti delle biotecnologie nell'inquadramento e cura delle malattie endocrino-metaboliche più importanti e di comune riscontro nella pratica clinica. Di tali patologie verranno fornite alcune nozioni eziologiche, diagnostiche e terapeutiche di base, enfatizzando per ognuna il ruolo delle biotecnologie.
The module aims to prepare students for the aspects of biotechnology in the management and treatment of the most important endocrine-metabolic diseases commonly found in clinical practice. Some basic etiological, diagnostic and therapeutic notions of these pathologies will be provided, emphasizing for each the role of biotechnologies.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze fondamentali nelle aree di Anatomia, Fisiologia e Patologia Generale propedeutiche all'apprendimento dell'Endocrinologia.
Fundamental knowledge in the areas of Anatomy, Physiology and General Pathology preliminary to learning Endocrinology.
Metodi didattici/Teaching methods
Presentazioni power point. Articoli scientifici da riviste peer-reviewed.
Power-point presentations. Scientific articles from peer-reviewed journals.
Altre informazioni/Further information
Se necessario, saranno offerte sessioni di approfondimento propedeutiche all'esame da accordare direttamente con il docente.
If needed, in-depth sessions preparatory to the exam will be offered, to be agreed directly with the lecturer.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Al fine di valutare conoscenza e capacità di comprensione dei diversi topic della materia di insegnamento nonchè capacità di apprendimento, autonomia di giudizio e abilità comunicative, la verifica consisterà di una prova scritta. La prova è costituita da tre domande aperte, tutte attinenti al programma di studio. Ciascuna domanda richiederà una risposta, congrua, da 5 a 10 righe. Il giudizio del docente si baserà sulla precisione delle risposte offerte in relazione al corso di studi, e sulla capacità di espressione ragionata dei concetti appresi.
In order to evaluate the learning and understanding of the different topics of the subject, as well as to assess the learning skills, the independent judgment abilities, and communication skills, the test will consist of a written test containing three open questions spanning the subject and the study program. Each question will require a congruent response of 5-10 written lines. The teacher's judgment will be based on the accuracy of the answers offered in relation to the course of study, and on the ability to express the concepts learned in a reasonably understandable way.
Programma esteso/Content
Meccanismi generali del sistema endocrino. Ruolo delle delle biotecnologie per la classificazione, la caratterizzazione, la comprensione e il trattamento delle malattie endocrine. Meccanismi molecolari e genetici delle patologie ipotalamo-ipofisarie e dei tumori neuroendocrini come modello dell'uso delle biotecnologie ne targeting farmacologico singolo e di combinazione. Interferenti endocrini. Malattie dela funzione tiroide, tumori tiroidei sporadici e a trasmissione ereditaria, caratterizzazione dei target molecolari della terapia. Fisiopatologia surrenalica, malattie della corteccia e midollare del surrene, implicazioni genetiche. Basi poligeniche delle malattie metaboliche (obesità e diabete), target centrali e periferici delle malattie endocrino-metaboliche. Disfunzioni gonadiche, ipogonadismi, sindrome dell'ovaio policistico.
General mechanisms of the endocrine system. Role of biotechnology for the classification, characterization, understanding and treatment of endocrine diseases. Molecular and genetic mechanisms of hypothalamic-pituitary pathologies and neuroendocrine tumors as a model of the use of biotechnologies in single and combination pharmacological targeting. Endocrine disruptors. Diseases of thyroid function, sporadic and hereditary thyroid tumors, characterization of the molecular targets of therapy. Adrenal pathophysiology, diseases of the adrenal cortex and medulla, genetic implications. Polygenic basis of metabolic diseases) obesity and diabetes), target central and peripheral endocrine-metabolic diseases. Gonadal dysfunction, hypogonadism, polycystic ovary syndrome.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine del corso lo studente dovrà essere in grado di descrivere le basi molecolari della fisiopatologia endocrina e delle più comuni malattie endocrino-metaboliche inserite in un contesto di potenziali applicazioni biotecnologiche. L'obiettivo è accrescere le competenze biotecnologiche nelle metodologie diagnostiche e nella innovazione terapeutica delle più importanti patologie endocrino-metaboliche.
By the course end, the student shall be able to describe the molecular basis of endocrine pathophysiology and of the most common endocrine-metabolic diseases involved in the biotech context. The aim is to increase biotechnological skills in diagnostic methodologies and therapeutic innovations for the most relevant endocrine-metabolic diseases.
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Course
Fertility, reproduction and endocrine system biotechnologies: Biotechnology of reproduction
Course ID
MS0454
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
MARZULLO Paolo
CFU
2
Teaching duration (hours)
12
Individual study time
38
SSD
MED/40 - GINECOLOGIA E OSTETRICIA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
il corso verte su: 1)genesi della fertilità animale e umana 2) eziologia dell'infertilità 3) terapia dell'infertilità 4) ruolo del laboratorio pma
the course focuses on: 1) genesis of animal and human fertility 2) etiology of infertility 3) infertility therapy 4) role of the art laboratory
Testi di riferimento/Textbooks
tutto il materiale necessario verrà fornito durante le ore del corso
all the necessary material will be provided during the hours of the course
Obiettivi formativi/Mission
alla fine del corso lo studente avrà acquisito: 1) conoscenze sulla riproduzione umana 2) conoscenze sulla terapia dell'infertilità 3) approfondita conoscenza del laboratorio pma e delle tecniche di fecondazione in vitro
at the end of the course the student will have acquired: 1) knowledge on human reproduction 2) knowledge on infertility therapy 3) in-depth knowledge of the art laboratory and in vitro fertilization techniques
Prerequisiti/Required background knowledge
nessuno
none
Metodi didattici/Teaching methods
lezione frontale / materiali audiovisivi
frontal lesson / audiovisual materials
Altre informazioni/Further information
lo studente potrà svolgere periodi di stage presso centri pma
the student can carry out internships at art centers
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
esame scritto
written exam
Programma esteso/Content
1) evoluzione delle riproduzione (politocico, monotocico, altricialità, selezione del follicolo dominate, meiosi, mitosi ) 2)eziologia dell'infertilità (cause ovariche tubariche uterine inspiegate) 3) terapia medica dell'infertilità (citrato di clomifene, gonadotropine ) 4) tecniche pma ( preparazione liquido seminale , fivet, icsi, congelamento ovocitario, congelamento embrionale) 5) genetica preimpianto
1) evolution of reproduction (polytocic, monotocic, altricialiity, selection of the dominated follicle, meiosis, mitosis) 2) etiology of infertility (unexplained uterine tubal ovarian causes) 3) medical infertility therapy (clomiphene citrate, gonadotropins) 4) art techniques (seminal fluid preparation, IVF, icsi, oocyte freezing, embryonic freezing) 5) preimplantation genetics
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
alla fine del corso lo studente avrà una chiara visione sul ruolo delle biotecnologie nel campo della riproduzione umana
at the end of the course the student will have a clear vision on the role of biotechnologies in the field of human reproduction
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Course
Molecular virology
Course ID
MS0468
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
GARIGLIO Marisa
CFU
6
Teaching duration (hours)
36
Individual study time
122
SSD
MED/07 - MICROBIOLOGIA E MICROBIOLOGIA CLINICA
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
The general content of the course is the interplay between viruses and their host organisms
The general content of the course is the interplay between viruses and their host organisms
Testi di riferimento/Textbooks
The recommended textbooks are: Brooks “Jawetz, Melnick, & Adelberg's Medical Microbiology” Levinson “Review of Medical Microbiology and Immunology” Ryan “Sherris Medical Microbiology” ON ARRIVAL: David M Knipe,Peter Howley“Fields Virology” 6th edition Additional material can be found at: http://www.virology.ws/course/
The recommended textbooks are: Brooks “Jawetz, Melnick, & Adelberg's Medical Microbiology” Levinson “Review of Medical Microbiology and Immunology” Ryan “Sherris Medical Microbiology” ON ARRIVAL: David M Knipe,Peter Howley“Fields Virology” 6th edition Additional material can be found at: http://www.virology.ws/course/
Obiettivi formativi/Mission
Understanding the interplay between viruses and their host organisms giving to students a view of innate defenses and viral pathogenesis focusing on medically important viruses.
Understanding the interplay between viruses and their host organisms giving to students a view of innate defenses and viral pathogenesis focusing on medically important viruses.
Prerequisiti/Required background knowledge
The students are expected to know basic virology and fundamentals of molecular and cellular biology.
The students are expected to know basic virology and fundamentals of molecular and cellular biology.
Metodi didattici/Teaching methods
All the slides of each lesson will be available to the students.
All the slides of each lesson will be available to the students.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
6 questions with true or false answer and explanation An oral exam will be following in order to discuss and complete (if necessary) the written exam.
6 questions with true or false answer and explanation An oral exam will be following in order to discuss and complete (if necessary) the written exam.
Programma esteso/Content
The course deals with basic virology and virological terminology. The effect of virus infection at organism level is addressed. The focus of the course is on molecular virology, especially on virus replication in the infected cell and the molecular mechanisms of this. A selected set of relevant human viruses, differing in their genome structure (RNA versus DNA, circular versus linear) and in their virion architecture will be discussed, the content of the course being specialised with respect to molecular biology, molecular genetics, recombinational events, virus-host interactions and innate immunity. The focus is on medically important viruses, such as tumour viruses, hepatitis viruses, HIV and herpesviruses.
The course deals with basic virology and virological terminology. The effect of virus infection at organism level is addressed. The focus of the course is on molecular virology, especially on virus replication in the infected cell and the molecular mechanisms of this. A selected set of relevant human viruses, differing in their genome structure (RNA versus DNA, circular versus linear) and in their virion architecture will be discussed, the content of the course being specialised with respect to molecular biology, molecular genetics, recombinational events, virus-host interactions and innate immunity. The focus is on medically important viruses, such as tumour viruses, hepatitis viruses, HIV and herpesviruses.
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Course
Internal Medicine
Course ID
MS0459
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
BELLAN Mattia
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
105
SSD
MED/09 - MEDICINA INTERNA
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
The course will deal with some of the main topics in Internal Medicine, particularly focusing on those with the highest applicability of medical biotechnologies
Testi di riferimento/Textbooks
For consultation: Harrison’s Principles of Internal Medicine - 17th edition - New York: McGraw-Hill, 2009. References on specific topics will be provided during the course.
Obiettivi formativi/Mission
The aim of the course is to give notions of methodology relating to the main biotechnological applications in Internal Medicine. In particular, the course will transmit skills on the growing role of biotechnology applications both in the diagnostic and in the therapeutic approach to different acute and chronic diseases. The topics that will be object of the lessons have been selected to give examples of diseases characterized by educational relevance in the description of the diagnostic approach strategies, in the study of pathophysiology and in the therapeutic approach The course will also show some examples of the development of drugs obtained by recombinant DNA techniques and the development of innovative therapeutic strategies such as stem cell transplantation and gene therapy in different conditions.
Prerequisiti/Required background knowledge
The student should possess basic knowledge about the Human Anatomy, Biochemistry, Physiology, Pharmacology and General Pathology.
Metodi didattici/Teaching methods
The course will consist of frontal lessons, assisted by the supply of materials (slides, papers and reviews) dealing with the topic discussed during the frontal lesson.
Altre informazioni/Further information
The student may request to attend the laboratory of Internal Medicine, with targets to be agreed with the teacher.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
The final test will consist of multiple choice quiz: Multiple choice test will consist of 45 questions: 0.75 for each right answer. The minimum threshold for passing the exam is 18/30. In case of low number of candidates, the exam may be oral
Programma esteso/Content
- Introduction to the course - Physiology of immune system - Connective tissue diseases: general definitions, systemic sclerosis, Sjogren's syndrome, Systemic lupus Erythematosus, Overlap/UCTD/MCTD; PM/DM - immunodeficiencies - Rheumatoid Arthritis: general features, pathogenesis, basis of management, murine models; - General features of cardiovascular diseases; - Arterial hypertension; - Type 2 diabetes mellitus: pathogenesis and basis of treatment; - The pathophysiology of haemostasis and thrombosis; - Respiratory diseases: COPD, Pneumonias, lung cancers, cystic fibrosis; - Gastrointestinal diseases: GE bleeding, IBD; - Liver: anatomy and physiology; causes of acute and chronic liver damage; liver cirrhosis and its comlications; - infectious diseases: Covid-19, HIV and AIDS; TBC; sepsis
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
We expect that the students, at the end of the course, will be able to make easy clinical reasoning, particularly focusing on the potential application of medical biotechnologies to the clinical practice.
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Course
Molecular therapy
Course ID
MS0465
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
CFU
11
Teaching duration (hours)
66
SSD
BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA, BIO/14 - FARMACOLOGIA
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS0466Biotechnological applications BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA Ellis Steven Robert
MS0467Pharmacology BIO/14 - FARMACOLOGIA Cargnin Sarah
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Course
Molecular therapy: Biotechnological applications
Course ID
MS0466
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
CFU
6
Teaching duration (hours)
36
Individual study time
114
SSD
BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso indagherà applicazioni innovative delle biotecnologie alla medicina con particolare attenzione allo sviluppo di farmaci. Questo corso fornirà agli studenti una formazione nelle tecniche delle moderne biotecnologie per prepararli a lavorare nel campo delle biotecnologie o ad affrontare ulteriori studi universitari.
The course will investigate state-of-the-art applications of the biotechnology field to medicine will a focus on drug development. This course will provide students with a background in modern biotechnology techniques for work in the biotechnology field or further graduate studies.
Testi di riferimento/Textbooks
Il corso si basa sulla letteratura scientifica. Verranno forniti i riferimenti alla bibliografia essenziale. Tutti gli altri materiali saranno forniti su powerpoint del docente.
The course is based on primary scientific literature. Citations will be provided for key references. All other materials will be provided on instructor powerpoints.
Obiettivi formativi/Mission
Questo corso fornirà agli studenti una formazione nelle tecniche delle moderne biotecnologie per prepararli a lavorare nel campo delle biotecnologie o ad affrontare ulteriori studi universitari.
This course will provide students with a background in modern biotechnology techniques for work in the biotechnology field (academics or industry) or further graduate studies.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base in biochimica, genetica e immunologia sono utili ma non assolutamente necessarie.
A background knowledge of biochemistry, genetics, and immunology is helpful but now absolutely required.
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali ed esercitazioni in gruppo.
Lectures and team-based learning exercises.
Altre informazioni/Further information
Il corso si focalizza sulle applicazioni biotecnologiche nello sviluppo di farmaci, ma gli studenti saranno anche preparati sugli studi clinici di fase I, II e III e sull'analisi complessiva dell'efficacia dei farmaci nelle popolazioni umane.
The major focus is biotechnicaacl applications in drug development, but students will also be exposed to phase I, II, and III clinical trials and the overall analysis drug efficacy in human populations.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Autovalutazione dell'apprendimento durante il corso tramite esercitazioni in gruppo. Verifica dell'apprendimento complessivo tramite esame finale.
Formative assessments: team-based learning exercises. Summative assessments: final exam
Programma esteso/Content
Macromolecole biologiche usate come farmaci per cancro, disturbi infiammatori, malattie infettive e altre patologie. Le macromolecole biologiche studiate includono anticorpi monoclonali, cellule T ingegnerizzate e terapie immunomodulatorie.
Biological macromolecules as drugs for cancer, inflammatory disorders, infectious disease, and other diseases. Biological macromolecules studied include monoclonal antibodies, engineered T cells, and immunomodulatory therapies.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Gli obiettivi di apprendimento previsti includono: scoperta di nuove applicazioni biotecnologiche alle malattie umane, confronto di terapie biologiche con terapie classiche, indagine sui parametri di uno studio clinico controllato, analisi dei dati sull'efficacia a breve e lungo termine dei farmaci biologici.
Intended learning objectives include: discovery of novel biotechnology applications to human disease, compare and contract biologic therapies with classical therapies, investigate parameters of a well-controlled clinical trial, analysis data on short-term and long-term efficacy of biologic drugs.
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Course
Molecular therapy: Pharmacology
Course ID
MS0467
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
Teaching leader
CARGNIN Sarah
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
100
SSD
BIO/14 - FARMACOLOGIA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
The course integrates Pharmacology with Biotechnological applications. It will focus mainly on the rational bases for the development of target therapies. The course will also analyze relevant molecular and diagnostic properties useful for the preclinical development of new biotech drugs.
Testi di riferimento/Textbooks
Textbooks will be suggested during the course according to students’ needs. The lecturers will also provide additional learning material to students on their D.I.R pages.
Obiettivi formativi/Mission
The course is intended to provide knowledge of pharmacology and biotechnological applications of drugs developed with biotech methodologies.
Prerequisiti/Required background knowledge
Basic knowledge of Immunology, Biochemistry, Anatomy, Physiology and Pathology which is necessary to understand the rationale behind the development of drugs, their specific mechanisms of action as well as their benefit-risk profiles.
Metodi didattici/Teaching methods
Traditional lessons (ex cathedra teaching). Learning material will be uploaded on the DIR pages of the lecturers.
Altre informazioni/Further information
Student meetings with lecturers of the Course are subject to prior appointment agreed via e-mail.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Multiple-choice written exam. For the assessment of the student learning achievements, a score ranging from 18 (minimum) to 30 with laude (maximum) will be used. More precisely, with a score ranging from 18 to 23 the student will show a sufficient but limited knowledge; from 24 to 26 the student will show a satisfactory knowledge; from 27 to 28 the student will demonstrate to have achieved a good knowledge and sufficient ability to allocate the information learned in the scientific landscape. From 29 to 30 the student will demonstrate that he/she has acquired a very good knowledge and a good ability to allocate the information learned in the scientific landscape. Lastly, students achieving 30 cum laude will demonstrate to have an excellent knowledge.
Programma esteso/Content
The course will focus on the analysis of the rational bases for the development of targeted drugs, with a focus on specific drug classes. Furthermore, the course integrates basic pharmacology and biotech applications for preclinical development of new biotech drugs.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
The students are expected to acquire the knowledge, skills and competence on the basics of Pharmacology and Biotechnological applications. They will also understand the rationale underlying the conception and design of in vitro and in vivo experiments.
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Course
Internship 1
Course ID
MS0495
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
THE MOLECULAR BASIS OF DISEASE
CFU
4
Individual study time
100
SSD
NN -
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
F
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
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Course
Internship 1
Course ID
MS1879
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
CFU
3
Individual study time
75
SSD
NN -
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
F
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
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Course
Forensomics and biotechnological applications
Course ID
MS1868
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
GINO Sarah
CFU
11
Teaching duration (hours)
66
SSD
BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA, MED/43 - MEDICINA LEGALE
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Inglese
English
Contenuti/Content Summary
Consultare quanto descritto per i singoli corsi
Please see what is described for each course
Testi di riferimento/Textbooks
Consultare quanto descritto per i singoli corsi
Please see what is described for each course
Obiettivi formativi/Mission
Consultare quanto descritto per i singoli corsi
Please see what is described for each course
Prerequisiti/Required background knowledge
Consultare quanto descritto per i singoli corsi
Please see what is described for each course
Metodi didattici/Teaching methods
Consultare quanto descritto per i singoli corsi
Please see what is described for each course
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Esame scritto: quiz a scelta multipla per ciascun insegnamento sul programma svolto. Per Forensomics l'esito dell'esame scritto viene integrato con la presentazione orale svolta durante il corso. Il voto finale è la media dei voti dei due insegnamenti.
Written exam: multiple choice quiz for each course on the program carried out. For Forensomics the outcome of the written exam is integrated with the oral presentation carried out during the course. The final grade is the average of the grades of the two courses.
Programma esteso/Content
Consultare il programma dei singoli corsi
Please, consult the program of each course
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Consultare quanto descritto per i singoli corsi
Please see what is described for each course
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS1869Biotechnological applications BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA Ellis Steven Robert
MS1870Forensomics MED/43 - MEDICINA LEGALE Gino Sarah
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Course
Forensomics and biotechnological applications: Biotechnological applications
Course ID
MS1869
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
GINO Sarah
CFU
6
Teaching duration (hours)
36
Individual study time
114
SSD
BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Inglese
Contenuti/Content Summary
The course will investigate state-of-the-art applications of the biotechnology field to medicine will a focus on drug development. This course will provide students with a background in modern biotechnology techniques for work in the biotechnology field or further graduate studies.
Testi di riferimento/Textbooks
The course is based on primary scientific literature. Citations will be provided for key references. All other materials will be provided on instructor powerpoints.
Obiettivi formativi/Mission
This course will provide students with a background in modern biotechnology techniques for work in the biotechnology field (academics or industry) or further graduate studies.
Prerequisiti/Required background knowledge
A background knowledge of biochemistry, genetics, and immunology is helpful but now absolutely required.
Metodi didattici/Teaching methods
Lectures and team-based learning exercises.
Altre informazioni/Further information
The major focus is biotechnicaacl applications in drug development, but students will also be exposed to phase I, II, and III clinical trials and the overall analysis drug efficacy in human populations.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Formative assessments: team-based learning exercises. Summative assessments: final exam
Programma esteso/Content
Biological macromolecules as drugs for cancer, inflammatory disorders, infectious disease, and other diseases. Biological macromolecules studied include monoclonal antibodies, engineered T cells, and immunomodulatory therapies
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Intended learning objectives include: discovery of novel biotechnology applications to human disease, compare and contract biologic therapies with classical therapies, investigate parameters of a well-controlled clinical trial, analysis data on short-term and long-term efficacy of biologic drugs.
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Course
Forensomics and biotechnological applications: Forensomics
Course ID
MS1870
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
GINO Sarah
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
100
SSD
MED/43 - MEDICINA LEGALE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso si prefigge di dare agli studenti gli elementi utili per comprendere l’utilizzo delle omiche in ambito forense. Al tempo stesso l’insegnamento prevede anche la trattazione di problematiche medico-legali, giuridiche ed etiche quali il consenso informato, il segreto professionale, il segreto d’ufficio con uno sguardo alla legislazione italiana, europea ed extraeuropea.
The course aims to give students useful elements to understand the use of omics in forensic sciences. At the same time, the teaching also deals with medico-legal, legal and ethical issues such as informed consent, professional secrecy in Italian, European, and extra-European context.
Testi di riferimento/Textbooks
Nessun testo in particolare. Materiale fornito dalla docente
No specific text recommended. Material provided by the professor
Obiettivi formativi/Mission
Il corso si propone di fornire agli studenti elementi utili alla comprenisione delle applicazioni della genomica, metabolomica, lipidomica proteomica e trascrittomica in ambito forense. Al tempo stesso il corso ha l'obietti di far riflettere gli studenti su concetti giuridici, medico legali e bioetici utili per l’attività di ricerca e per la professione.
The course aims to provide students with useful elements for understanding the applications of genomics, metabolomics, lipidomics, proteomics and transcriptomics in the forensic field. At the same time, the course aims to make students reflect on legal, medico-legal and bioethical concepts useful for research and for the profession.
Prerequisiti/Required background knowledge
Fondamenti di biologia cellulare e molecolare e di genetica
Fundamentals of cellular and molecular biology, and genetic
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali e presentazioni orali degli studenti su argomenti trattati a lezione.
Frontal lesson and students’ oral presentation on issues discussed during the frontal lesson.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Esame scritto (domande chiuse e/o aperte). Presentazione orale durante il corso di un approfondimento su uno degli argomenti trattati a lezione.
Written exam (close and / or open questions). Oral presentation during the course of an in-depth study on one of the topics covered in class.
Programma esteso/Content
Consenso informato Segreto professionale- Segreto d’ufficio - Segreto industriale – Privacy Il ruolo del Comitato etico Genomica forense: scena del crimine (CSI), diagnosi di natura delle tracce, genetica forense (identificazione, ancestry, phenotyping, metilazione del DNA) Microbiome e scienze forensi: identificazione umana, stima del post mortem interval (PMI), cause della morte, predizione dell'età cronologica Metabolomica e lipidomica forense: strumenti e stima del PMI Proteomica forense: strumenti e stima del PMI, predizione dell'età cronologica, identificazione umana Transcrittomica forense: RNA and identificazione della natura delle tracce, RNA e stima del PMI
Informed consent Professional and industrial secrecy - Privacy The role of the ethics committee Forensic genomics: Crime Scene Investigation, characterization of evidence, forensic genetics (human identification, ancestry, phenotyping, DNA methylation) Microbiome and forensic sciences: human identification, estimation of PMI, causes of death, prediction of chronological age Forensic metabolomics and lipidomics: instruments and estimation of PMI Forensic proteomics: instruments and estimation of PMI, prediction of chronological age, human identification Forensic transcriptomics: RNA and body fluids identification, RNA and estimation of PMI
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al fine di raggiungere le conoscenze e le competenze corrispondenti al livello minimo di sufficienza, allo studente si chiede di dimostrare di : (CONOSCENZE) - conoscere i principi generali delle omiche applicate alle scienze forensi; - conoscere i principi generali etici, giuridici e medico legali utili per l'esercizio della professione in Italia; - conoscere i principi generali etici, giuridici e medico legali utili per la ricerca. (COMPETENZE) - saper identificare le migliori tecniche per ottenere il maggior numero di informazioni possibili a fini identificativi, per definire il post-mortem interval, le cause della morte - saper applicare i principi etici, giuridici e medico legali in ambito professionale e nell'ambito della ricerca. (ABILITÀ TRASVERSALI) - saper presentare e commentare materiale tecnico da articoli scientifici pubblicati sulle riviste scientifiche di settore; - saper presentare aspetti giuridici ed etici di interesse forense in vigore in Paesi diversi dall'Italia
In order to achieve the knowledge and skills corresponding to the minimum level of sufficiency, the student is asked to demonstrate: (KNOWLEDGE) - know the general principles of omics applied to forensic sciences; - know the general ethical, legal and medico-legal principles useful for exercising the profession in Italy; - know the general ethical, legal and medico-legal principles useful for research. (SKILLS) - know how to identify the best techniques to obtain the greatest possible amount of information for identification purposes, to define the post-mortem interval, the causes of death - know how to apply ethical, legal and medico-legal principles in the professional field and in the research field. (TRANSVERSAL SKILLS) - be able to present and comment on technical material from scientific articles published in sector scientific journals; - be able to present legal and ethical aspects of forensic interest in force in countries other than Italy
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Course
Big Data Analysis
Course ID
MS1864
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
CORA' Davide
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
95
SSD
BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
English
English
Contenuti/Content Summary
The course will provide an introduction to examples, concepts and instruments at the foundation of Big Data Analysis for bioinformatics and genomics, in the framework of human health and cancer in particular. Students will gain an introduction to the theory and practice of genomic and protein sequence databases along with tools for retrieving and interpreting functional and annotation data for the human genome. Basic knowledge on new generation sequencing and related bioinformatics data analysis tools will be introduced, focusing on transcriptomes and cancer genomics. Basics of the statistical language R will be discussed. In the final part, an introduction to the concepts of complex systems, network theory and system biology will be considered also through the discussion of research articles.
The course will provide an introduction to examples, concepts and instruments at the foundation of Big Data Analysis for bioinformatics and genomics, in the framework of human health and cancer in particular. Students will gain an introduction to the theory and practice of genomic and protein sequence databases along with tools for retrieving and interpreting functional and annotation data for the human genome. Basic knowledge on new generation sequencing and related bioinformatics data analysis tools will be introduced, focusing on transcriptomes and cancer genomics. Basics of the statistical language R will be discussed. In the final part, an introduction to the concepts of complex systems, network theory and system biology will be considered also through the discussion of research articles.
Testi di riferimento/Textbooks
Scientific papers and slides, provided during the lessons, will represent the main teaching materials. Further suggested books: Arthur Lesk, “Introduction to Bioinformatics”, Oxford University Press Arthur Lesk, “Introduction to Genomics”, Oxford University Press Deonier et al., “Computational Genome Analysis – An introduction”, ed Springer Andreas D. Baxevanis, Gary D. Bader, David S. Wishart, “Bioinformatics – fourth edition”, ed. John Wiley & Sons
Scientific papers and slides, provided during the lessons, will represent the main teaching materials. Further suggested books: Arthur Lesk, “Introduction to Bioinformatics”, Oxford University Press Arthur Lesk, “Introduction to Genomics”, Oxford University Press Deonier et al., “Computational Genome Analysis – An introduction”, ed Springer Andreas D. Baxevanis, Gary D. Bader, David S. Wishart, “Bioinformatics – fourth edition”, ed. John Wiley & Sons
Obiettivi formativi/Mission
Provide a basic view of the most commonly used bioinformatics and systems biology tools in the framework of “Big Data” analysis for human health, with a focus for cancer genomics. Provide basic skills for reading and interpreting articles including bioinformatics content.
Provide a basic view of the most commonly used bioinformatics and systems biology tools in the framework of “Big Data” analysis for human health, with a focus for cancer genomics. Provide basic skills for reading and interpreting articles including bioinformatics content.
Prerequisiti/Required background knowledge
Basic knowledge in molecular biology and genetics.
Basic knowledge in molecular biology and genetics.
Metodi didattici/Teaching methods
Lectures in classroom and computer classroom.
Lectures in classroom and computer classroom.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
In-itinere written reports for a series of assignments (computer homeworks) and a final written exam are planned. The final written exam will consist of a series of multiple choice questions, plus a series of open questions. The questions will cover all the topics covered during the course and the discussion of two focus papers. The aim of the exam is both to check the theoretical knowledge acquired by the students, and the practical knowledge of basic bioinformatics tools, together with the ability to analyze research articles in the field of omics technologies.
In-itinere written reports for a series of assignments (computer homeworks) and a final oral exam are planned. In-itinere written reports for a series of assignments (computer homeworks) and a final written exam are planned. The final written exam will consist of a series of multiple choice questions, plus a series of open questions. The questions will cover all the topics covered during the course and the discussion of two focus papers. The aim of the exam is both to check the theoretical knowledge acquired by the students, and the practical knowledge of basic bioinformatics tools, together with the ability to analyze research articles in the field of omics technologies.
Programma esteso/Content
Review of basic concepts on the structure, organization and functioning of the human genome. The Ensembl database, description and operation. Structure of a human gene in Ensembl, sequence information retrieval, protein structure, functional and clinical annotations. The UCSC browser genome, description and operation. UCSC structure and annotation of a human gene, retrieval of functional and expression information. Introduction to NGS Sequencing. Illumina sequencing methodology. Introduction to RNA-seq methodology. Design of an RNA-seq experiment and related bioinformatics data analysis. Cancer genomics and the TCGA project. Introduction to systems biology and network theory. Examples of networks in biology and genomics. Basic elements of the R statistical programming language. Examples of research articles available on Pubmed discussing topics related to arguments related to the course.
Review of basic concepts on the structure, organization and functioning of the human genome. The Ensembl database, description and operation. Structure of a human gene in Ensembl, sequence information retrieval, protein structure, functional and clinical annotations. The UCSC browser genome, description and operation. UCSC structure and annotation of a human gene, retrieval of functional and expression information. Introduction to NGS Sequencing. Illumina sequencing methodology. Introduction to RNA-seq methodology. Design of an RNA-seq experiment and related bioinformatics data analysis. Cancer genomics and the TCGA project. Introduction to systems biology and network theory. Examples of networks in biology and genomics. Basic elements of the R statistical programming language. Examples of research articles available on Pubmed discussing topics related to arguments related to the course.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
It is expected an increased knowledge-based and personalized judgement capability on basic applied bioinformatics, in particular concerning the human genome and biomedical applications. Being able to understand independently and critically the content of research articles concerning bioinformatics and systems biology topics and results.
It is expected an increased knowledge-based and personalized judgement capability on basic applied bioinformatics, in particular concerning the human genome and biomedical applications. Being able to understand independently and critically the content of research articles concerning bioinformatics and systems biology topics and results.
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Course
Structural genomics
Course ID
MS1865
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
SSD
BIO/18 - GENETICA
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS1866Human Genomics BIO/18 - GENETICA Giordano Mara
MS1867Metagenomics BIO/18 - GENETICA Persichetti Francesca, Favero Francesco
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Course
Structural genomics: Human Genomics
Course ID
MS1866
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
GIORDANO Mara
Teachers
CFU
3
Teaching duration (hours)
18
Individual study time
57
SSD
BIO/18 - GENETICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Studio delle malattie monogeniche e multifattoriali. Analisi di riarrangiamenti genomici e applicazioni delle tecniche di sequenziamento. Analisi multi-Omiche del Genoma Umano. Trascrittomica Genomica e studio Metiloma. L'Utilità della genomica nella medicina di precisione
Study of monogenic and multifactorial diseases. Analysis of genomic rearrangements and applications of sequencing techniques. Multi-Omics Analysis of the Human Genome. Transcriptomics Genomics and Methyloma study. The usefulness of Genomics in precision medicine
Testi di riferimento/Textbooks
Articoli su riviste scelti dal docente
Articles in Journals chosen by the Professor
Obiettivi formativi/Mission
Il corso mira ad illustrare i principali approcci di analisi multi-omiche e in particolare della genomica. Gli studenti impareranno ad applicare le loro conoscenze per l'analisi bionformatica di dati utilizzando i database pubblici.
The course aims to illustrate the main approaches to multi-omics analysis and in particular to genomics. Students will learn to apply their knowledge to bionformatic data analysis using public databases.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenza delle tecniche principali di Analisi del genoma Umano. Utilizzo dei database Pubblici per analisi del genoma
Knowledge of the main techniques of Human Genome Analysis. Use of Public databases for genome analysis
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali con diapositive . Seminari degli studenti come approfondimento di argomenti trattati a lezione.Esercitazioni mediante quiz interattivi. Esercitazioni in aula computer
Frontal lessons with slides. Student seminars as an in-depth study of topics covered in class. Exercises through interactive quizzes. Computer classroom exercises
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Esame orale Assegnazione di elaborati su problematiche da risolvere mediante l'uso di strumenti bioinformatici
Oral examination Assignment of papers on problems to be solved through the use of bioinformatics tools
Programma esteso/Content
Tecnologie di sequenziamento di terza generazione • Sequenziamento dell'intero genoma • Metodi di cattura mirati per pannelli di esoma e geni • Sequenziamento dell'RNA e analisi del metiloma Approcci mutiomici allo studio della funzione del genoma Interpretazione clinica del genoma • Genomica Clinica per le Malattie Costituzionali • Genomica clinica per le malattie somatiche (cancro) • Database di riferimento per lo studio di malattie Metodi per riportare i risultati dei test di genomica clinica
Third generation sequencing technologies • Whole genome sequencing • Targeted Capture Methods for exome and gene panels • RNA Sequencing and Methylome Analysis Muti-omics approaches to the study of genome Function Clinical Genome Interpretation • Clinical Genomics for Constitutional Diseases • Clinical Genomics for Somatic Diseases (Cancer) • Reference Databases for Disease Associations Reporting of Clinical Genomics Test Results
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Ampia conoscenza del genoma Umano e dei metodi di analisi genomica integrati con le altre discipline Omiche con particolare riferimento all'identificazione dei geni coinvolti in malattie e all'applicazione nella medicina di precisione
Extensive knowledge of the Human genome and of genomic analysis methods integrated with other Omics disciplines with particular reference to the identification of genes involved in diseases and to their application in precision medicine
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Course
Structural genomics: Metagenomics
Course ID
MS1867
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
FAVERO Francesco
CFU
2
Teaching duration (hours)
12
Individual study time
38
SSD
BIO/18 - GENETICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso fornisce agli studenti conoscenze sulla struttura e funzione delle comunità microbiche e in particolare sul microbiota intestinale umano. Verranno descritte le principali metodologie impiegate per lo studio e l’analisi del microbiota.
The course provides students with knowledge on the structure and function of microbial communities and in particular on the human gut microbiota. The main methodologies used in the study and analysis of the microbiota will be described
Testi di riferimento/Textbooks
Libro suggerito: Jacques Izard and Maria Rivera “Metagenomics for Microbiology”
Suggested book: Jacques Izard and Maria Rivera “Metagenomics for Microbiology”
Obiettivi formativi/Mission
Il corso si propone di insegnare allo studente il significato e l’importanza della metagenomica. Si forniranno agli studenti gli strumenti per la comprensione delle metodologie impiegate in questa disciplina, dal next generation sequencing (NGS) all’analisi bioinformatica dei dati.
The course aims to teach the student the meaning and the importance of the metagenomics. Students will be provided with the tools for understanding the methodologies used in this discipline, from next generation sequencing (NGS) to bioinformatics analysis of data.
Prerequisiti/Required background knowledge
Gli studenti devono avere una conoscenza di base della biologia molecolare e della genetica.
Basic knowledge of molecular biology and genetics.
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali mediante presentazioni PowerPoint su schermo
Class lectures with PowerPoint projections
Altre informazioni/Further information
Il controllo dell'apprendimento verrà effettuato mediante discussione collegiale degli argomenti trattati
Learning control will be carried out through collegial discussion of the topics covered
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Esame orale. La prova orale prevede alcune domande sui principali argomenti del programma e/o la discussione di articoli scientifici presentati durante il corso. Per il superamento della verifica lo studente deve dimostrare di conoscere e di aver compreso i concetti fondamentali della materia di studio e di essere in grado di esporli in modo comprensibile e scientificamente corretto.
Oral exam. The oral exam includes few questions on the main topics of the program and/or the discussion of scientific articles presented during the course. To pass the exam the student is required to know and understand the fundamental concepts of the subject and be able to explain them in an understandable and scientifically correct way.
Programma esteso/Content
Descrizione delle principali piattaforme di Next Generation Sequencing (NGS) e format dei file dati NGS. Introduzione alla metagenomica e metatrascrittomica, e loro potenziali applicazioni nella fisiopatologia umana. Sequenziamento del 16S rRNA: applicazioni, vantaggi e svantaggi Sequenziamento shotgun: applicazioni, vantaggi e svantaggi Post-processing di genomi di assemblaggio de novo: controlli di qualità e ulteriori analisi (metaproteomica) Metatrascrittomica: analogie e differenze rispetto alla metagenomica (cenni) Cenni sui principali strumenti per l'analisi dei dati di metagenomica
Description of the main Next Generation Sequencing (NGS) platforms and format of the files of NGS data. Introduction to metagenomics and metatranscriptomics and their potential applications on human physiopathology. 16S rRNA sequencing: applications, pro and cons. Shotgun sequencing: applications, pro and cons. Post-processing of de novo assembly genomes: quality controls and further analyses (metaproteomics). Metatranscriptomics: analogies and differences compared to metagenomics (hints). Hints on the principal tools for the analysis of metagenomics data
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
"Comprendere" l’importanza della metagenomica per rilevare la diversità genetica e tassonomica delle comunità microbiche, con particolare riferimento al microbiota intestinale umano e alle sue possibili implicazioni sulla salute. "Conoscere" le tecniche di sequenziamento high-throughput, quelle di analisi dei dati e, teoricamente, saperle applicare. "Abilità comunicative": capacità di esporre gli argomenti del corso in modo chiaro e comprensibile e con l’uso della corretta terminologia scientifica. "Capacità di apprendimento": approfondire le proprie conoscenze della metagenomica sulle pubblicazioni scientifiche, per seguire con atteggiamento critico l'avanzamento della disciplina.
"Understanding" the importance of metagenomics to detect genetic and taxonomic diversity of microbial communities, in particular of the human gut microbiota and its possible implications on health. "Know" the techniques of high-throughput sequencing, those of data analysis and, in theory, be able to apply them. "Communication skills": ability to expose the topics of the course in a clear and understandable way and with the use of appropriate scientific terminology. "Learning skills": to deepen the knowledge of metagenomics on scientific publications, to follow the advancement of the discipline with a critical attitude.
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Course
Molecular virology
Course ID
MS0468
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
SYSTEM BIOMEDICINE
Teaching leader
GARIGLIO Marisa
CFU
6
Teaching duration (hours)
36
Individual study time
90
SSD
MED/07 - MICROBIOLOGIA E MICROBIOLOGIA CLINICA
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
The general content of the course is the interplay between viruses and their host organisms
The general content of the course is the interplay between viruses and their host organisms
Testi di riferimento/Textbooks
The recommended textbooks are: Brooks “Jawetz, Melnick, & Adelberg's Medical Microbiology” Levinson “Review of Medical Microbiology and Immunology” Ryan “Sherris Medical Microbiology” ON ARRIVAL: David M Knipe,Peter Howley“Fields Virology” 6th edition Additional material can be found at: http://www.virology.ws/course/
The recommended textbooks are: Brooks “Jawetz, Melnick, & Adelberg's Medical Microbiology” Levinson “Review of Medical Microbiology and Immunology” Ryan “Sherris Medical Microbiology” ON ARRIVAL: David M Knipe,Peter Howley“Fields Virology” 6th edition Additional material can be found at: http://www.virology.ws/course/
Obiettivi formativi/Mission
Understanding the interplay between viruses and their host organisms giving to students a view of innate defenses and viral pathogenesis focusing on medically important viruses.
Understanding the interplay between viruses and their host organisms giving to students a view of innate defenses and viral pathogenesis focusing on medically important viruses.
Prerequisiti/Required background knowledge
The students are expected to know basic virology and fundamentals of molecular and cellular biology.
The students are expected to know basic virology and fundamentals of molecular and cellular biology.
Metodi didattici/Teaching methods
All the slides of each lesson will be available to the students.
All the slides of each lesson will be available to the students.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
6 questions with true or false answer and explanation An oral exam will be following in order to discuss and complete (if necessary) the written exam.
6 questions with true or false answer and explanation An oral exam will be following in order to discuss and complete (if necessary) the written exam.
Programma esteso/Content
The course deals with basic virology and virological terminology. The effect of virus infection at organism level is addressed. The focus of the course is on molecular virology, especially on virus replication in the infected cell and the molecular mechanisms of this. A selected set of relevant human viruses, differing in their genome structure (RNA versus DNA, circular versus linear) and in their virion architecture will be discussed, the content of the course being specialised with respect to molecular biology, molecular genetics, recombinational events, virus-host interactions and innate immunity. The focus is on medically important viruses, such as tumour viruses, hepatitis viruses, HIV and herpesviruses.
The course deals with basic virology and virological terminology. The effect of virus infection at organism level is addressed. The focus of the course is on molecular virology, especially on virus replication in the infected cell and the molecular mechanisms of this. A selected set of relevant human viruses, differing in their genome structure (RNA versus DNA, circular versus linear) and in their virion architecture will be discussed, the content of the course being specialised with respect to molecular biology, molecular genetics, recombinational events, virus-host interactions and innate immunity. The focus is on medically important viruses, such as tumour viruses, hepatitis viruses, HIV and herpesviruses.
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Course
Principles of Regenerative Medicine and Tissue Engineering
Course ID
MS2135
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
Teaching leader
BOCCAFOSCHI FRANCESCA
CFU
6
Teaching duration (hours)
36
SSD
BIO/16 - ANATOMIA UMANA, BIO/17 - ISTOLOGIA, MED/50 - SCIENZE TECNICHE MEDICHE APPLICATE, MED/04 - PATOLOGIA GENERALE
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS2136Functional Human Anatomy BIO/16 - ANATOMIA UMANA Boccafoschi Francesca
MS2137Tissue Regeneration by Stem Cells BIO/17 - ISTOLOGIA Borsotti Chiara
MS2138Mechanobiology and Mechanotransduction MED/50 - SCIENZE TECNICHE MEDICHE APPLICATE Cochis Andrea
MS2139Basic Principles of Applied Immunology MED/04 - PATOLOGIA GENERALE Chiocchetti Annalisa
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Course
Principles of Regenerative Medicine and Tissue Engineering: Functional Human Anatomy
Course ID
MS2136
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
Teaching leader
BOCCAFOSCHI FRANCESCA
CFU
1
Teaching duration (hours)
6
Individual study time
15
SSD
BIO/16 - ANATOMIA UMANA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Lezioni di anatomia umana funzionale
Functional human anatomy classes
Testi di riferimento/Textbooks
Presentazioni utilizzate in aula e fornite su piattaforma DIR
Presentations used during classes and provided on the DIR platform
Obiettivi formativi/Mission
Fornire le basi di anatomia funzionale del sistema osteoartromuscolare e cardiocircolatorio
Provide the basics of functional anatomy of the osteoarthromuscular and cardiovascular system
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base di anatomia umana
Basic knowledges on human anatomy
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali e video didattici
Frontal lectures and didactic videos
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Esame scritto con domande vero/falso (10) e aperte (2)
Written exam with true/false (10) and open questions (2)
Programma esteso/Content
1. biomeccanica sistema osteoartroarticolare 2. anatomia funzionale del cuore e del sistema cardiocircolatorio
1. biomechanics of the osteoarthroarticular system 2. functional anatomy of the heart and cardiovascular system
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
acquisire le informazioni di base sugli argomenti del corso
acquire basic information on the topics of the course
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Course
Principles of Regenerative Medicine and Tissue Engineering: Tissue Regeneration by Stem Cells
Course ID
MS2137
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
Teaching leader
BOCCAFOSCHI FRANCESCA
CFU
2
Teaching duration (hours)
12
Individual study time
30
SSD
BIO/17 - ISTOLOGIA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
- Spiegazione dei tipi di cellule staminali e loro localizzazione - Descrizione di metodi per l'isolamento, la crescita e il mantenimento delle cellule staminali in coltura - Introduzione alla terapie a base di cellule staminali in ambito preclinico e clinico
- Explanation of stem cell types and localization - Description of methods for stem cell isolation, growth and maintenance in culture - Introduction to stem cell-based therapy in preclinical and clinical settings
Testi di riferimento/Textbooks
Materiale (diapositive e articoli scientifici) messo a disposizione dal docente
Material (slides and scientific articles) made available by the teacher
Obiettivi formativi/Mission
Al termine del corso lo studente sarà in grado di indicare dove si trovano le cellule staminali; riconoscere i diversi tipi di cellule staminali; descrivere la funzione delle cellule staminali nell'uomo; descrivere il processo di differenziazione cellulare; descrivere i potenziali benefici e rischi dell'uso delle cellule staminali in medicina
At the end of the course the student will be able to state where the stem cells are found; recognize the different stem cell types; describe the function of stem cells in humans; describe the process of cell differentiation; describe the potential benefits and risks of using stem cells in medicine
Prerequisiti/Required background knowledge
Nozioni di base di Chimica, Biochimica, Biologia Cellulare e Molecolare
Basic notions of Chemistry, Biochemistry, Cell and Molecular Biology
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni in classe e Presentazioni in formato Power Point (caricate su DIR alla fine delle singole lezioni)
Classroom lessons and Power Point presentations (uploaded to DIR at the end of each lesson)
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Quiz con domande a scelta multipla (15 – 20 domande)
Written assay with 15-20 questions (multiple choice)
Programma esteso/Content
- Breve riassunto dell'organizzazione del corpo umano (cellule, tessuti, organi) - Cellule staminali e rigenerazione - Principali caratteristiche e funzioni delle cellule staminali: cellule staminali embrionali e adulte, cellule staminali pluripotenti indotte - Localizzazione e differenziazione delle cellule staminali nei diversi tessuti (divisione simmetrica e asimmetrica) - Isolamento, caratterizzazione e mantenimento delle cellule staminali in coltura - Regolazione del differenziamento delle cellule staminali - Terapie a base di cellule staminali: applicazioni attuali e future
- Brief summary of body organization (cells, tissues, organs) - Stem cells and regeneration - Main stem cells characteristics and functions: embryonic and adult stem cells, induced pluripotent stem cells - Stem cell localization and differentiation in different tissues (symmetric and asymmetric division) - Stem cell isolation, characterization and maintenance in culture - Regulation of stem cell differentiation - Stem cell-based therapies: nowadays and future applications
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Conoscenze di base di biologia delle cellule staminali, localizzazione, funzioni e loro potenziale applicazione nella medicina rigenerativa
Basic knowledge of stem cell biology, localization, functions and their potential application in regenerative medicine
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Course
Principles of Regenerative Medicine and Tissue Engineering: Mechanobiology and Mechanotransduction
Course ID
MS2138
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
Teaching leader
BOCCAFOSCHI FRANCESCA
CFU
1
Teaching duration (hours)
6
Individual study time
15
SSD
MED/50 - SCIENZE TECNICHE MEDICHE APPLICATE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Descrizione approfondita dei principi di base biologici e genetici della meccanobiologia e meccanotrasduzione per applicazioni in medicina rigenerativa ed ingegneria tissutale
In-depth description of the biological and genetic basic principles of mechanobiology and mechanotransduction for applications in regenerative medicine and tissue engineering
Testi di riferimento/Textbooks
Pubblicazioni scientifiche (fornite dal docente)
Research articles (provided by the teacher)
Obiettivi formativi/Mission
Conoscere i principi biologici e genetici alla base delle terapie che prevedono la stimolazione meccanica come mezzo per la guarigione dei tessuti danneggiati
Know the biological and genetic principles underlying therapies that involve mechanical stimulation as a means of healing damaged tissues
Prerequisiti/Required background knowledge
Nozioni di base di biologia, genetica ed anatomia. Conoscenza basilare di fisica e matematica.
Basics of biology, genetics and anatomy.
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni basate su slides power point inerenti a recenti e significativi articoli di letteratura scientifica (materiale didattico disponibile su DIR).
Lectures based on powerpoint slides relating to recent and significant scientific literature articles (teaching material available on DIR).
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Test scritto a risposte aperte
Written test with open answers
Programma esteso/Content
-Principi base di meccanobiologia e meccanotrasduzione -La meccanobiologia delle articolazioni (osso e cartilagine) e di altri tessuti (cuore, cervello, tendini e legamenti) -Biomateriali impiantabili rispondenti a stimoli meccanici -Tecnologie innovative per l'applicazione clinica dei principi di meccanobiologia
-Basic principles of mechanobiology and mechanotransduction -The mechanobiology of the joints (bone and cartilage) and other tissues (heart, brain, tendons and ligaments) -Implantable biomaterials responding to mechanical stimuli -Innovative technologies for the clinical application of the principles of mechanobiology
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Corretta ed approfondita conoscenza di come la stimolazione biomeccanica possa essere utilizzata come terapia alternativa per la guarigione di tessuti danneggiati
Correct and in-depth knowledge of how biomechanical stimulation can be used as an alternative therapy for the healing of damaged tissues
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Course
Principles of Regenerative Medicine and Tissue Engineering: Basic Principles of Applied Immunology
Course ID
MS2139
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
Teaching leader
BOCCAFOSCHI FRANCESCA
CFU
2
Teaching duration (hours)
12
Individual study time
30
SSD
MED/04 - PATOLOGIA GENERALE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Panoramica sui meccanismi immunitari alla base della rigenerazione tissutale. Approcci basati sui biomateriali e sistemi di rilascio di trattamenti terapeutici La medicina rigenerativa di futura generazione
Overview of the basic immune mechanisms involved in tissue repair and regeneration approaches based on biomaterials and drug delivery systems the next generation of regenerative therapies
Testi di riferimento/Textbooks
Nessuno
None
Obiettivi formativi/Mission
Lo studente dovrà acquisire conoscenze sui meccanismi con cui le cellule del sistema immunitario promuovono la rigenerazione dei tessuti e sui metodi per modulare tali processi
Student should acquire knowledge on how the immune system regulate tissue regeneration and about new approaches to modulate it
Prerequisiti/Required background knowledge
Sono necessarie conoscenze di base di immunologia
Basic knowledge of Immunology
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali con apprendimento attivo
Fontal lessons with active learning
Altre informazioni/Further information
Nessuna
none
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L’esame consiste in un test composto da 3 affermazioni cui va risposto vero/falso fornendo poi una breve spiegazione che giustifichi la scelta. Ogni risposta può valere un massimo di 11 punti, garantendo il raggiungimento del 30 lode (33 punti)
The exam consists of 3 statements (true or false) + the explanation. Each statements accounts for a maximum of 11 points, so that the student can reach 33 corresponding to 30 cum laude.
Programma esteso/Content
Il ruolo del Sistema immunitario nella rigenerazione tissutale. Ruolo dell’immunità innata ed adattativa. Le fasi della rigenerazione tissutale e il ruolo della polarizzazione immunitaria. Metodi per promuovere la rigenerazione dei tessuti: cellule staminali, biomateriali, e sistemi per il rilascio di terapeutici
The role of immune system in tissue regeneration. Innate and adaptive immunity. The phases of tissue healing and immune cell polarization. Tissue regeneration: methods involving stem cells, biomaterials, drug delivery systems
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Lo studente approfondirà le conoscenze sui meccanismi del sistema immunitario nella rigenerazione dei tessuti e i nuovi approcci per raggiungere tali obiettivi
The student will deepen their knowledge of the mechanisms of immune cells, mediating tissue regeneration and novel approaches to reach this goal
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Course
Applied Biomaterials and Nanotechnologies
Course ID
MS2140
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
Teaching leader
RIMONDINI Lia
CFU
6
Teaching duration (hours)
36
SSD
MED/50 - SCIENZE TECNICHE MEDICHE APPLICATE, ING-IND/34 - BIOINGEGNERIA INDUSTRIALE
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Inglese
English
Contenuti/Content Summary
Il corso è finalizzato a fornire informazioni essenziali sulla scienza dei biomateriali e dei dispositivi per la rigenerazione dei tessuti e la medicina rigenerativa. Il corso include nozioni di fisica e chimica e di bioingegneria nonchè le nozioni fondamentali per lo sviluppo e caratterizzazione di costrutti ingegnerizzati per ingegneria e rigenerazione dei tessuti
The course is aimed at providing essential information on the science of biomaterials and devices for tissue regeneration and regenerative medicine. The course includes notions of physics and chemistry and bioengineering as well as the fundamental notions for the development and characterization of engineered constructs for engineering and tissue regeneration
Testi di riferimento/Textbooks
Revisioni e articoli scientifici disponibili su DIR all'inizio e durante il corso
Reviews and scientific articles available on DIR at the beginning and during the course
Obiettivi formativi/Mission
Dotare lo studente delle conoscenze necessarie per lo sviluppo di una tecnologia per l'ingegneria e la rigenerazione dei tessuti
To equip the student with the knowledge necessary for the development of a technology for tissue engineering and regeneration
Prerequisiti/Required background knowledge
Fondamenti di chimica. fisica e biologia
Fundaments of chemistry, physics and biology
Metodi didattici/Teaching methods
Lezione in aula, presentazione di diapositive e video.
Slide presentation, videos, classes
Altre informazioni/Further information
Nessuna
None
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Scritto, basato sulla verifica e il commento di statment e domande aperte. I voti dei singoli moduli sono estressi in 33/33 (33=lode) Il test è superato se la media dei voti dei moduli è superiore o uguale a 18/30 e non più di due moduli sono inferiori a 15/30
Written, based on statment verification and commentary and open questions. The marks of the individual modules are extracted in 33/33 (33 = honors) The test is passed if the average of the scores of the modules is greater than or equal to 18/30 and no more than two modules are less than 15/30
Programma esteso/Content
Vedi programma dei singoli moduli
See content of the single modules
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine del corso lo studente deve essere in grado di pianificare lo sviluppo di una tecnologia per ingegneria dei tessuti
At the end of the course the student must be able to plan the development of a technology for tissue engineering
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS2141Applied Nanotechnologies for Regenerative Medicine MED/50 - SCIENZE TECNICHE MEDICHE APPLICATE Rimondini Lia
MS2142Biomaterials development and analytical technologies ING-IND/34 - BIOINGEGNERIA INDUSTRIALE Serra Tiziano
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Course
Applied Biomaterials and Nanotechnologies: Applied Nanotechnologies for Regenerative Medicine
Course ID
MS2141
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
Teaching leader
RIMONDINI Lia
Teachers
CFU
1
Teaching duration (hours)
6
Individual study time
15
SSD
MED/50 - SCIENZE TECNICHE MEDICHE APPLICATE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso si focalizza sulle opportunità che le nanotecnologie offrono nell'ambito della ingegneria tissutale e della medicina rigenerativa. Sono in particolare discusse le modifiche superficiali degli scaffolds e i sistemi intelligenti di rilascio di principi attivi
The course focuses on the opportunities that nanotechnologies offer in the field of tissue engineering and regenerative medicine. In particular, surface modifications of scaffolds and smart systems for release of active release systems of active agents are discussed
Testi di riferimento/Textbooks
Articoli scientifici, capitoli di testo
Papers, reviews, chapters provided during classes
Obiettivi formativi/Mission
Sviluppo di conoscenza e comprensione delle principali tecnologie per promuovere la rigenerazione dei tessuti attarverso la relizzazione di scaffolds biomimetici. Conoscenza dei principali metodi basati su nanotecnologie per migliorare o inibire l'adesione delle cellule e per il rilascio di principi attivi
Knowledge and understanding of the main technologies to promote tissue regeneration through the creation of biomimetic scaffolds. Knowledge of the main methods based on nanotechnologies to improve or inhibit cell adhesion and for the release of active agents
Prerequisiti/Required background knowledge
Fondamenti di chimica. fisica e biologia
Fundaments of chemistry, physics and biology
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni in aula. Presentazione di dispositive e video
Classes. Slide presentation and videos
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Test scritto: verifica e commento di enunciati
Written test: Statments assessment and comments
Programma esteso/Content
Particelle e materiali nanostrutturati, nano e micro porosità, texture superficiali e i loro effetti sulla ingegnerizazione e rigenerazione dei tessuti. Sensori Sitemi per il rilascio di farmaci Sistemi per il gene delivering
Nano-structured particles and materials, nano and micro porosity, surface textures and their effects on tissue engineering and regeneration. Sensors Drug Delivery Systems Systems for gene delivering
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine del corso, lo studente deve conoscere le principali proprietà della materia alla nanodimensione. Lo studente deve conoscere meccanismi attraverso i quali la materia alla nanodimensione interagisce favorendo o sfavorendo l'ingegnerizzazione e la rigenerazione dei tessuti
At the end of the course, the student must know the main properties of nanosized matter. The student must know the mechanisms through which nanodimensional matter interacts, favoring or disadvantaging the engineering and tissue regeneration
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Course
Applied Biomaterials and Nanotechnologies: Biomaterials development and analytical technologies
Course ID
MS2142
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
Teaching leader
SERRA Tiziano
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
75
SSD
ING-IND/34 - BIOINGEGNERIA INDUSTRIALE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso è finalizzato a fornire informazioni essenziali sulla scienza dei biomateriali e dei dispositivi per la rigenerazione dei tessuti e la medicina rigenerativa. Il corso include nozioni di fisica e chimica e di bioingegneria
232 / 5.000 Risultati della traduzione The course is aimed at providing essential information on the science of biomaterials and devices for tissue regeneration and regenerative medicine. The course includes notions of physics and chemistry and bioengineering
Testi di riferimento/Textbooks
Reviews e articolo scientifici
Reviews and scientific papers
Obiettivi formativi/Mission
Fornire allo studente le informazioni chiave per sviluppare uno scaffold per ingegneria tissutale e medicina rigenerativa
To provide the student with the key information to develop a scaffold for tissue engineering and regenerative medicine
Prerequisiti/Required background knowledge
Fondamentali di biologia, chimica e fisica
Fundamentals of biology, chemistry and physics
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni e training pratici
Lectures and practical training
Altre informazioni/Further information
Nessuna
None
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Written test
Written test
Programma esteso/Content
Classificazione dei biomateriali: metalli, ceramici, polimeri, compositi. Proprietà chimiche, fisiche e biologiche. Polveri, matrici 2D e scaffolds Proprietà del bulk e delle superfici.Tecnologie per la caratterizzazione chimico-fisica dei materiali. Scaffolds degradabili e non degradabili.
Classification of biomaterials: metals, ceramics, polymers, composites. Chemical, physical and biological properties. Powders, 2D matrices and scaffolds Properties of bulk and surfaces. Technologies for the physico-chemical characterization of materials. Degradable and non-degradable scaffolds.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Al termine del corso lo studente deve conoscere le principali categorie di scaffolds, i processi di fabbricazione, le metodologie di caratterizazzione fisico, chimico e biologica e gli utilizzi principali in ingegneria tissutale e medicina rigenerativa. Al termine del corso lo studente deve essere in grado di pianificare il set base di caratterizzazione per uno scaffold per medicina rigenerativa
At the end of the course the student must know the main categories of scaffolds, the manufacturing processes, the methodologies of physical, chemical and biological characterization and the main uses in tissue engineering and regenerative medicine. At the end of the course the student must be able to plan the basic characterization set for a scaffold for regenerative medicine
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Course
3D models and Technologies for Tissue Engineering
Course ID
MS2143
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
Teaching leader
COCHIS Andrea
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
75
SSD
MED/50 - SCIENZE TECNICHE MEDICHE APPLICATE
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Caratteristiche e potenzialità dell'utilizzo di modelli avanzati 3D di tessuti per studi in vitro. Utilizzo di piattaforme avanzate (bioreattori, organ-on-chip, stampa 3D) per studi in vitro.
Characteristics and potential of using advanced 3D tissue models for in vitro studies. Use of advanced platforms (bioreactors, organ-on-chip, 3D printing) for in vitro studies.
Testi di riferimento/Textbooks
Articoli scientifici (forniti dal docente)
Research articles (provided by the teacher)
Obiettivi formativi/Mission
Apprendere le potenzialità di modelli avanzati 3D e piattaforme biotecnologiche per studi pre-clinici in vitro
Learn the potential of advanced 3D models and biotechnology platforms for pre-clinical in vitro studies
Prerequisiti/Required background knowledge
Biologia di base, genetica di base, principi di fisica/matematica, fondamenti di chimica
Basic biology, basic genetics, principles of physics / mathematics, fundamentals of chemistry
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni basate su proiezione di slides del docente (disponibili su DIR) ed articoli di ricerca (forniti dal docente)
Lessons based on the projection of slides by the teacher (available on DIR) and research articles (provided by the teacher)
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Esame scritto a risposte aperte
Written exam with open answers
Programma esteso/Content
- Modelli 3D in vitro (osso, cartilagine, pelle) - Principi di sviluppo e caratteristiche di biomateriali come supporto - Bioreattori (perfusione, stimolazione meccanica, stimolazione piazoelettrica) - Advanced manufacturing mediante stampa 3D ed organ-on-chip
- 3D in vitro models (bone, cartilage, skin) - Principles of development and characteristics of biomaterials as support - Bioreactors (perfusion, mechanical stimulation, piazoelectric stimulation) - Advanced manufacturing through 3D printing and organ-on-chip
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
- Conoscenza delle carartteristiche (biologiche e biomeccaniche) ed utilizzo di modelli 3D per studi pre-clinici in vitro - Conoscenza dell'applicazione di piattaforme complesse (bioreattori, stampa 3D, organ-on-chip) per studi pre-clinici in vitro
- Knowledge of the characteristics (biological and biomechanical) and use of 3D models for pre-clinical in vitro studies - Knowledge of the application of complex platforms (bioreactors, 3D printing, organ-on-chip) for pre-clinical in vitro studies
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Course
Molecular therapy
Course ID
MS0465
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
CFU
11
Teaching duration (hours)
66
SSD
BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA, BIO/14 - FARMACOLOGIA
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS0466Biotechnological applications BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA Ellis Steven Robert
MS0467Pharmacology BIO/14 - FARMACOLOGIA Cargnin Sarah
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Course
Molecular therapy: Biotechnological applications
Course ID
MS0466
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
CFU
6
Teaching duration (hours)
36
Individual study time
90
SSD
BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso indagherà applicazioni innovative delle biotecnologie alla medicina con particolare attenzione allo sviluppo di farmaci. Questo corso fornirà agli studenti una formazione nelle tecniche delle moderne biotecnologie per prepararli a lavorare nel campo delle biotecnologie o ad affrontare ulteriori studi universitari.
The course will investigate state-of-the-art applications of the biotechnology field to medicine will a focus on drug development. This course will provide students with a background in modern biotechnology techniques for work in the biotechnology field or further graduate studies.
Testi di riferimento/Textbooks
Il corso si basa sulla letteratura scientifica. Verranno forniti i riferimenti alla bibliografia essenziale. Tutti gli altri materiali saranno forniti su powerpoint del docente.
The course is based on primary scientific literature. Citations will be provided for key references. All other materials will be provided on instructor powerpoints.
Obiettivi formativi/Mission
Questo corso fornirà agli studenti una formazione nelle tecniche delle moderne biotecnologie per prepararli a lavorare nel campo delle biotecnologie o ad affrontare ulteriori studi universitari.
This course will provide students with a background in modern biotechnology techniques for work in the biotechnology field (academics or industry) or further graduate studies.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base in biochimica, genetica e immunologia sono utili ma non assolutamente necessarie.
A background knowledge of biochemistry, genetics, and immunology is helpful but now absolutely required.
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali ed esercitazioni in gruppo.
Lectures and team-based learning exercises.
Altre informazioni/Further information
Il corso si focalizza sulle applicazioni biotecnologiche nello sviluppo di farmaci, ma gli studenti saranno anche preparati sugli studi clinici di fase I, II e III e sull'analisi complessiva dell'efficacia dei farmaci nelle popolazioni umane.
The major focus is biotechnicaacl applications in drug development, but students will also be exposed to phase I, II, and III clinical trials and the overall analysis drug efficacy in human populations.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Autovalutazione dell'apprendimento durante il corso tramite esercitazioni in gruppo. Verifica dell'apprendimento complessivo tramite esame finale.
Formative assessments: team-based learning exercises. Summative assessments: final exam
Programma esteso/Content
Macromolecole biologiche usate come farmaci per cancro, disturbi infiammatori, malattie infettive e altre patologie. Le macromolecole biologiche studiate includono anticorpi monoclonali, cellule T ingegnerizzate e terapie immunomodulatorie.
Biological macromolecules as drugs for cancer, inflammatory disorders, infectious disease, and other diseases. Biological macromolecules studied include monoclonal antibodies, engineered T cells, and immunomodulatory therapies.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Gli obiettivi di apprendimento previsti includono: scoperta di nuove applicazioni biotecnologiche alle malattie umane, confronto di terapie biologiche con terapie classiche, indagine sui parametri di uno studio clinico controllato, analisi dei dati sull'efficacia a breve e lungo termine dei farmaci biologici.
Intended learning objectives include: discovery of novel biotechnology applications to human disease, compare and contract biologic therapies with classical therapies, investigate parameters of a well-controlled clinical trial, analysis data on short-term and long-term efficacy of biologic drugs.
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Course
Molecular therapy: Pharmacology
Course ID
MS0467
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
Teaching leader
CARGNIN Sarah
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
75
SSD
BIO/14 - FARMACOLOGIA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
The course integrates Pharmacology with Biotechnological applications. It will focus mainly on the rational bases for the development of target therapies. The course will also analyze relevant molecular and diagnostic properties useful for the preclinical development of new biotech drugs.
Testi di riferimento/Textbooks
Textbooks will be suggested during the course according to students’ needs. The lecturers will also provide additional learning material to students on their D.I.R pages.
Obiettivi formativi/Mission
The course is intended to provide knowledge of pharmacology and biotechnological applications of drugs developed with biotech methodologies.
Prerequisiti/Required background knowledge
Basic knowledge of Immunology, Biochemistry, Anatomy, Physiology and Pathology which is necessary to understand the rationale behind the development of drugs, their specific mechanisms of action as well as their benefit-risk profiles.
Metodi didattici/Teaching methods
Traditional lessons (ex cathedra teaching). Learning material will be uploaded on the DIR pages of the lecturers.
Altre informazioni/Further information
Student meetings with lecturers of the Course are subject to prior appointment agreed via e-mail.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Multiple-choice written exam. For the assessment of the student learning achievements, a score ranging from 18 (minimum) to 30 with laude (maximum) will be used. More precisely, with a score ranging from 18 to 23 the student will show a sufficient but limited knowledge; from 24 to 26 the student will show a satisfactory knowledge; from 27 to 28 the student will demonstrate to have achieved a good knowledge and sufficient ability to allocate the information learned in the scientific landscape. From 29 to 30 the student will demonstrate that he/she has acquired a very good knowledge and a good ability to allocate the information learned in the scientific landscape. Lastly, students achieving 30 cum laude will demonstrate to have an excellent knowledge.
Programma esteso/Content
The course will focus on the analysis of the rational bases for the development of targeted drugs, with a focus on specific drug classes. Furthermore, the course integrates basic pharmacology and biotech applications for preclinical development of new biotech drugs.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
The students are expected to acquire the knowledge, skills and competence on the basics of Pharmacology and Biotechnological applications. They will also understand the rationale underlying the conception and design of in vitro and in vivo experiments.
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Course
Internship 1
Course ID
MS0495
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CELL THERAPY, TISSUE ENGINEERING AND REGENERATIVE MEDICINE
CFU
4
Teaching duration (hours)
100
Individual study time
60
SSD
NN -
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
F
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
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Course
Molecular Basis of Neoplastic and proliferative disorders
Course ID
MS2116
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
CFU
13
Teaching duration (hours)
98
SSD
MED/04 - PATOLOGIA GENERALE, MED/15 - MALATTIE DEL SANGUE
Course type
Attività formativa integrata
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS2117Experimental oncology MED/04 - PATOLOGIA GENERALE Isidoro Ciro
MS2118Hematoncology MED/15 - MALATTIE DEL SANGUE Gaidano Gianluca
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Course
Molecular Basis of Neoplastic and proliferative disorders: Experimental oncology
Course ID
MS2117
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
ISIDORO Ciro
Teachers
CFU
8
Teaching duration (hours)
48
Individual study time
120
SSD
MED/04 - PATOLOGIA GENERALE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course category
B
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
1. la rilevanza epidemiologica del cancro; L'influenza dell'ambiente e dello stile di vita; 2. le principali caratteristiche istopatologiche dei tumori e la loro classificazione; 3. le alterazioni molecolari responsabili del comportamento maligno delle cellule tumorali (perdita del controllo proliferativo, resistenza all'apoptosi, invasività, metabolismo alterato del glucosio, aminoacidi e acidi grassi, alterazione dell'omeostasi proteomica); Il ruolo dell'autofagia e della morte cellulare nel cancro; 4. il ruolo della genetica e dell'epigenetica nello sviluppo e nella progressione del cancro; I difetti genetici che predispongono al cancro; Alterazioni genomiche (traslocazione cromosomica) e mutazioni gene (oncogeni, oncosoppressori) associati a cancro; 5. L'origine e le caratteristiche fenotipiche delle cellule staminali del cancro; La ri-programmazione genetica e metabolica che porta al cancro; 6. I meccanismi di formazione delle metastasi; Il ruolo degli enzimi proteolitici; 7. I rapporti tra cellule tumorali e lo stroma tumorale, con particolare riguardo al ruolo dei fibroblasti associati al cancro e delle cellule immunitarie; 8. I meccanismi molecolari e fisiopatologici responsabili della sindrome cachettica. 9. Le tecniche attuali per la diagnosi (imaging, biomarcatori) e i trattamenti terapeutici disponibili (chemioterapia chimica, terapia biomolecolare). 10. Nuovo approccio terapeutico (epigenetica); Nuovi paradigmi di carcinogenesi (microbioma)
1. the epidemiologic relevance of Cancer; the influence of the environment and of the life style. 2. the main histopathologic characteristics of the tumours and their classification 3. the molecular alterations responsible for the malignant behaviour of tumour cells (loss of proliferative control; resistance to apoptosis; invasiveness; altered metabolism of glucose, aminoacids and fatty acids; altered proteome homeostasis); the role of autophagy and of cell death in cancer 4. the role of genetics and epigenetics in cancer development and progression; the genetic defects that predispose to cancer; genome (chromosomal translocation) alterations and gene mutations (oncogenes, oncosuppressors) associated with cancer 5. the origin and phenotypic characteristics of Cancer Stem Cells; the genetic and metabolic re-programming leading to cancer 6. the mechanisms of metastasis formation; the role of proteolytic enzymes 7. the inter-relationship between tumour cells and the tumour stroma, with particular regard to the role of cancer associated fibroblasts and of ruolo delle mutazioni genomiche, genetiche e epigenetiche; le alterazioni del metabolismo (glicidico, aminoacidico e lipidico) della cellula tumorale; le basi molecolari e metaboliche della cachessia neoplastica; nuovi approcci diagnostici e terapeutici. Il punteggio massimo è 30 + Laude / 30. NOTA: 1. il punteggio finale è concordato tra i due docenti dei moduli A e B, tenuto conto delle valutazioni complessive; 2. se solo uno dei due moduli (A o B) non è superato, lo studente deve ripetere l'esame per entrambi i moduli (A e B) in una nuova sessione. Per accedere all'esame lo studente deve aver compilato il form di valutazione del docente. Programma esteso Le malattie neoplastiche: definizioni e terminologia, classificazione e derivazione istogenetica. Epidemiologia. Eziologia multifattoriale. Fattori di rischio di natura chimica, fisica e biologica. Cancerogeni chimici. Radiazioni e tumori. Virus oncogeni. Storia naturale delle neoplasie. La cancerogenesi come processo multifasico. Ormoni nella cancerogenesi. Stile di vita (alimentazioni, obesità, abitudini voluttuarie) e cancro. Eventi genetici ed epigenetici nella cancerogenesi. STROMA E CANCRO. Ruolo del processo infiammatorio. Ipossia. Angiogenesi nelle neoplasie. Accrescimento infiltrativo/invasivo dei tumori maligni (adesione-motilità). Le metastasi (proteasi). Transizione epitelio-mesenchima. CANCRO E OSPITE La progressione neoplastica. Effetti sistemici del tumore sull’ospite: la cachessia neoplastica. Immunità e Cancro. ONCOLOGIA CELLULARE E MOLECOLARE Le Telomerasi e Cancro, MicroRNAs e Cancro, La Riparazione del DNA e Cancro. Determinanti molecolari della trasformazione neoplastica: oncogeni e geni oncosoppressori. METABOLISMO DELLA CELLULA NEOPLASTICA Alterazioni del metabolismo glicidico nelle cellule neoplastiche (l’effetto Warburg e la proliferazione cellulare). Alterazioni del turnover proteico: Ubiquitina, autofagia e cancro. CICLO CELLULARE – PROLIFERAZIONE – MORTE CELLULARE apoptosi, senescenza cellulare e ‘dormancy’ . La cellula staminale tumorale. Meccanismi di chemio resistenza Le terapie antineoplastiche:convenzionali, molecolari. Risultati di apprendimento attesi Conoscere le cause e i meccanismi di cancerogenesi e di progressione tumorale. Saper interpretare, discutere e presentare i risultati sperimentali di laboratorio o presenti in letteratura specificamente volti alla descrizione e comprensione della trasformazione neoplastica e del comportamento delle cellule tumorali. immune cells; 8. the molecular and patho-physiological mechanisms responsible for the cachexia syndrome. 9. the current techniques for Diagnosis (imaging, biomarkers) and the therapeutic treatments available (chemical chemotherapy, biomolecular therapy). 10. Novel therapeutic approach (epigenetics); novel paradigms for carcinogenesis (microbioma);
Testi di riferimento/Textbooks
The Molecular Biology of Cancer S-Pelengaris and M. Khan (Wiley-Blackwell edition) Chapter 7 NEOPLASIA by Thomas P Stricker and V Kumar (from Robbins, The molecular Basis of Disease) Siti internet di interesse: http://www.insidecancer.org; http://www.http://www.oncolink.com/; http://www.http://www.medlib.med.utah.edu/WebPath/LIVEHTML/LIVERIDX.html#5 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..
The Molecular Biology of Cancer S-Pelengaris and M. Khan (Wiley-Blackwell edition) Chapter 7 NEOPLASIA by Thomas P Stricker and V Kumar (from Robbins, The molecular Basis of Disease) A copy of the slides will be provided http://www.insidecancer.org http://www.oncolink.com/ http://www.cancer.gov
Obiettivi formativi/Mission
Riconoscere le caratteristiche istopatologiche delle principali neoplasie umane;Comprendere quali alterazioni molecolari e cellulari determinano il fenotipo neoplastico; Ragionare sulle cause naturali della carcinogenesi e i fattori che possono determinare la recidiva tumorale tenendo in mente il ruolo del sistemi difensivi a livello molecolare, cellulare e organismico; Descrivere le caratteristiche distintive (morfologiche, metaboliche, comportamentali) delle cellule staminali neoplastiche. Conoscere i meccanismi responsabili dell’infiltrazione e metastatizzazione dei tumori; Saper illustrare come si modifica il microambiente stromale che circonda il tumore e come queso possa favorire la crescita neoplastica Riconoscere i segni clinici e saper descrivere i meccanismi molecolari e fisiopatologici della cachessia neoplastica. CONOSCENZE ED ABILITÀ ATTESE Alla fine del corso lo studente dovrà essere in grado di affrontare la lettura e l’analisi di articoli scientifici sulla biologia cellulare e molecolare delle neoplasie (durante il corso ogni studente dovrà presentare un articolo scientifico inerente un argomento svolto). Risultati dell'apprendimento: Conoscenze riguardo ai meccanismi cellulari e molecolari alla base del processo di cancerogenesi. Dinamica delle popolazioni neoplastiche. Storia naturale delle neoplasie. Fattori di rischio per lo sviluppo delle neoplasie.
The course will provide students with fundaments of general oncology and knowledge about cellular and molecular mechanisms involved in carcinogenesis, as well as about experimental approaches in the field of oncological research.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base di Biologia Cellulare e Istologia, di Biologia Molecolare e Biochimica.
The students must possess the basic knowledge in cell and molecular biology and in biochemistry.
Metodi didattici/Teaching methods
Lezione interattiva coinvolgendo continuamente gli student con domande per stimolare la curiosità e verificare la comprensione dei concetti. Illustrazione dei processi con esempi pratici. Discussione di articoli scientifici rilevanti. Copia delle diapositive (selezione) mostrate a lezione sarà fornita in anticipo agli studenti
Interactive lesson continuously involving students with questions to stimulate curiosity and verify the understanding of concepts. Process illustration with practical examples. Discussion of relevant scientific articles.
Altre informazioni/Further information
Gli studenti possono contattare il docente e chiedere spiegazioni previo appuntamento via email. Gli studenti possono contattare il docente e chiedere spiegazioni previo appuntamento via email. Gli studenti hanno la possibilità di frequentare il laboratorio di Patologia Molecolare e NanoBioImaging. I crediti sono assegnati in base alle ore di frequenza. Nell’ambito del corso integrato sono inoltre organizzati attività interattive di ricerca bibliografica a piccoli gruppi riguardati tematiche pertinenti al corso.
Students are welcome to spend a period in the laboratory of Molecular Pathology to participate in the design, execution and discussion of experiments. CFU will be assigned based on the duration of the stage. Students will be involved in Journal Club meetings in which scientific papers relevant for their preparation will be discussed.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Lo studente può scegliere tra due formati di esame (“Basic” o “Advanced”), secondo il livello di preparazione che ritiene di aver raggiunto. Tutte le domande di scritto e orale sono scelte da una lista di domande resa disponibile sul sito del docente al fine di consentire allo studente un test di autovalutazione. Il formato “Basic” consiste in un compito scritto cui non segue l’esame orale. Il compito consiste di 5 “statements true or false” (affermazioni vera o falsa) e lo studente dovrà rispondere a 4 domande giustificando la risposta con una spiegazione di supporto in circa 10 righe. Ha a disposizione 1 ora. La risposta corretta ed esaustiva vale 6 punti (punteggio massimo conseguibile 24/30). Gli argomenti del programma “Basic” includono la nomenclatura, l’epidemiologia, le caratteristiche citologiche e istologiche, le caratteristiche del fenotipo maligno, la cancerogenesi chimica e da radiazioni, il metabolismo glicidico. Il formato “Advanced” prevede un compito scritto a 3 domande (30 minuti di tempo) cui segue il colloquio orale (3 domande) e la discussione di un articolo scientifico (a piacere, da una lista predisposta dal docente). Il programma d’esame “Advanced” integra il “basic” con l’approfondimento delle alterazioni delle vie di segnalazione molecolare; la cellula staminale del cancro; controllo del ciclo cellulare; telomerasi; il ruolo delle mutazioni genomiche, genetiche e epigenetiche; le alterazioni del metabolismo (glicidico, aminoacidico e lipidico) della cellula tumorale; le basi molecolari e metaboliche della cachessia neoplastica; nuovi approcci diagnostici e terapeutici. Il punteggio massimo è 30 + Laude / 30. NOTA: 1. il punteggio finale è concordato tra i due docenti dei moduli A e B, tenuto conto delle valutazioni complessive; 2. se solo uno dei due moduli (A o B) non è superato, lo studente deve ripetere l'esame per entrambi i moduli (A e B) in una nuova sessione. Per accedere all'esame lo studente deve aver compilato il form di valutazione del docente.
The student can choose between two exam formats (“Basic” or “Advanced”), according to the level of preparation they believe they have reached. All written and oral questions are chosen from a list of questions made available on the teacher's website, in order to allow the student to take a self-assessment test. The "Basic" format consists of a written test which is not followed by the oral exam. The assignment consists of 5 “true or false statements” and the student will have to answer 4 questions justifying the answer with a supporting explanation in about 10 lines. You have 1 hour at your disposal. The correct and exhaustive answer is worth 6 points (maximum achievable score 24/30). The topics of the "Basic" program include nomenclature, epidemiology, cytological and histological characteristics, characteristics of the malignant phenotype, chemical and radiation carcinogenesis, glucose metabolism. The "Advanced" format includes a written assignment with 3 questions (30 minutes) followed by an oral exam (3 questions) and the discussion of a scientific article (as desired, from a list prepared by the teacher). The "Advanced" exam program integrates the "basic" with an in-depth study of the alterations of the molecular signaling pathways; cell cycle control; telomerase; cancer stem cell; the role of genomic, genetic, and epigenetic mutations; alterations in the (glucose, amino acid and lipid) metabolism of the cancer cell; the molecular and metabolic bases of neoplastic cachexia; new diagnostic and therapeutic approaches. The maximum score is 30 + Laude / 30. NOTE: 1. the final score is agreed between the two teachers of modules A and B, taking into account the overall assessments; 2. if only one of the two modules (A or B) is not passed, the student must repeat the exam for both modules (A and B) in a new session. NOTE: To access the exam the student must have filled up the course evaluation form.
Programma esteso/Content
Le malattie neoplastiche: definizioni e terminologia, classificazione e derivazione istogenetica. Epidemiologia. Eziologia multifattoriale. Fattori di rischio di natura chimica, fisica e biologica. Cancerogeni chimici. Radiazioni e tumori. Virus oncogeni. Storia naturale delle neoplasie. La cancerogenesi come processo multifasico. Ormoni nella cancerogenesi. Stile di vita (alimentazioni, obesità, abitudini voluttuarie) e cancro. Eventi genetici ed epigenetici nella cancerogenesi. STROMA E CANCRO. Ruolo del processo infiammatorio. Ipossia. Angiogenesi nelle neoplasie. Accrescimento infiltrativo/invasivo dei tumori maligni (adesione-motilità). Le metastasi (proteasi). Transizione epitelio-mesenchima. CANCRO E OSPITE La progressione neoplastica. Effetti sistemici del tumore sull’ospite: la cachessia neoplastica. Immunità e Cancro. ONCOLOGIA CELLULARE E MOLECOLARE Le Telomerasi e Cancro, MicroRNAs e Cancro, La Riparazione del DNA e Cancro. Determinanti molecolari della trasformazione neoplastica: oncogeni e geni oncosoppressori. METABOLISMO DELLA CELLULA NEOPLASTICA Alterazioni del metabolismo glicidico nelle cellule neoplastiche (l’effetto Warburg e la proliferazione cellulare). Alterazioni del turnover proteico: Ubiquitina, autofagia e cancro. CICLO CELLULARE – PROLIFERAZIONE – MORTE CELLULARE apoptosi, senescenza cellulare e ‘dormancy’ . La cellula staminale tumorale. Meccanismi di chemio resistenza Le terapie antineoplastiche:convenzionali, molecolari
Lesson 1 (2h) Introduction to Cancer. Definition, Epidemiology. Features overview of benign and malignant tumors. Solid tumors: parenchyma and stroma. Examples of tumors. Lesson 2 (2h) Introduction to Cancer. Natural history of cancer: multistage carcinogenesis, genetic and epigenetic modifications; clonal expansion; mutations, risk factors. Lesson 3 (2 h) Nomenclature, Histopathology. Classification, Staging, Grading. Lesson 4 (2h) Genetic and chromosome instability. DNA repair. Lesson 5 (2h) Familial and Genetic syndromes predisposing to cancer. Recap Lesson 6 (2h) Molecular Oncology 1: Oncogenes (classification). Main Oncogenes: c-MYC, RAS, BCL-2, BRAF, and others. Oncogene addiction. Signaling pathways Lesson 7 (2h) Molecular Oncology 2: Tumour Suppressors. Main Tumour Suppressor genes: TP53, PTEN, BECLIN1, BRCA1, TSC, and others. Signaling pathways Lesson 8 (2h) Epigenetics and Cancer. DNMT, HDAC, microRNAs. Recap Lesson 9 (2h) Cancer cell biology1: Control of cell proliferation, cell cycle; Telomerase Lesson 10 (2h) Cancer cell biology 2: Control of cell homeostasis; control of macromolecular turnover; Autophagy; Cancer cell biology 3: Control of Cell death (Apoptosis, Necrosis, Autophagic cell death). Lesson 11 (2h) Tumor Dormancy, cancer cell dormancy, cell senescence, Cancer Stem Cells. Recap Lesson 12 (2h) Cancer cell metabolism: Glucose (Warburg effect), Amino Acids, Lipids. Lesson 13 (2h) Oncogenes and oncosuppressors and cancer cell metabolism. Recap of previous chapters Lesson 14 (2h) Tumour stroma. Cancer associated fibroblasts. Cancer inflammation. Immune response. Lesson 15 (2h) Cell adhesion. Invasion and Metastasis. Angiogenesis. Lesson 16 (2h) Aetiology; Gene – environment interaction; Lifestyle and Cancer (smoke, diet, alcohol). Recap Lesson 17 (2h) Aetiology of Cancer 2: Genotoxic and NON-genotoxic carcinogenesis (examples). Chemical Carcinogenesis. Indirect and Direct chemical carcinogens. DMS activation/excretion of chemical carcinogens. Nitrous Bases adducts. Lesson 18 (2h) Multistage carcinogenesis (initiation, promotion, progression. Cancer progression and Concept of clonal evolution Lesson 19 (2h) Infections and cancer; parasite infestation and cancer. Virus and carcinogenesis. Physical causes of cancer. Mineral fibers (Asbestos and mesothelioma pathogenesis). Radiation and cancer: direct and indirect effects. Ionizing radiation. UV radiation. Lesson 20 (2h) Chemotherapy and Mechanisms of chemoresistance. Recap Lesson 21 (2h) Cachexia and Anorexia in cancer patients. Cori’s cycle; adipose tissue metabolism. Recap
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Conoscere le cause e i meccanismi di cancerogenesi e di progressione tumorale. Saper interpretare, discutere e presentare i risultati sperimentali di laboratorio o presenti in letteratura specificamente volti alla descrizione e comprensione della trasformazione neoplastica e del comportamento delle cellule tumorali.
Knowing the causes and mechanisms of carcinogenesis and tumor progression. Knowing how to interpret, discuss and present the experimental laboratory results or found in literature, specifically aimed at describing and understanding the neoplastic transformation and behavior of tumor cells.
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Course
Molecular Basis of Neoplastic and proliferative disorders: Hematoncology
Course ID
MS2118
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
GAIDANO Gianluca
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
50
Individual study time
75
SSD
MED/15 - MALATTIE DEL SANGUE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course category
B
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso tratterà gli aspetti molecolari delle principali malattie oncoematologiche analizzando in particolar modo i punti rilevanti per la professione di Biotecnologo Medico. Durante il corso verranno anche proposti esercizi di autovalutazione, materiale aggiuntivo per approfondimenti e presentazioni di gruppo su argomenti di particolare interesse.
The course will deal with the molecular pathology of the main haematological malignancies, especially by analysing the topics relevant for the profession of Medical Biotechnologist. During the course, self-evaluation exercises will also be proposed, as well as additional material for in-depth study and group presentations on topics of particular interest.
Testi di riferimento/Textbooks
Testo per la consultazione: Williams Hematology, 9e Author(s): Kenneth Kaushansky, Marshall A. Lichtman, Josef T. Prchal, Marcel M. Levi, Oliver W. Press, Linda J. Burns and Michael Caligiuri (disponibile su UPO off campus library via AccessMedicine)
Reference textbook: Williams Hematology, 9e Author(s): Kenneth Kaushansky, Marshall A. Lichtman, Josef T. Prchal, Marcel M. Levi, Oliver W. Press, Linda J. Burns and Michael Caligiuri (available on UPO off campus library via AccessMedicine)
Obiettivi formativi/Mission
L'obiettivo del corso e' di rendere lo studente capace di conoscere, interpretare ed analizzare le principali tematiche ematologiche inerenti al corso e rilevanti per un Biotecnologo Medico, in maniera critica, come richiesto dal descrittore di Dublino 3.
The aim of the course is to render the student able to know, interpret and analyse the main hematological topics of the course, that are are relevant for a Medical Biotechnologist, with a critical attitude, as requested by the Dublin descriptor 3.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di base di biologia cellulare e molecolare
Basic knowledge of cell and molecular biology
Metodi didattici/Teaching methods
A) Lezioni frontali con presentazioni di diapositive disponibili sul sito DIR dell'universita' (https://www.dir.uniupo.it/); B) Test di autovalutazione dopo ogni lezione; C) Presentazioni a gruppo da parte degli studenti su argomenti concordati con il docente
A) Taught (frontal) classes with slide presentations available on the UPO DIR website (https://www.dir.uniupo.it/); B) Self-assessment tests after each class; C) Group presentations by the students on topics agreed upon with the professor
Altre informazioni/Further information
La partecipazione ai test di autovalutazione dopo ogni lezione è fortemente raccomandata
Participation in the self-assessment activitities after each class is strongly recommended
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L'esame si svolge nell'ambito del corso integrato. L'esame di Hematoncology consiste in 4 affermazioni, per le quali il candidato deve: i) definire vero/falso; ii) scrivere 5-10 righe di commento per giustificare la scelta. Esempi di questi testsono forniti come test di autovalutazione dopo ogni lezione
The exam will be in the context of the exam of the integrated course. The exam of Hematoncology will be based on 4 statements, for which the candidate has to: i) assign true/false; ii) write 5-10 lines of comment to justify the choice. Examples of these tests are provided as self-assessment tests after each class.
Programma esteso/Content
A. L'emopoiesi e la cellula staminale ematopoietica B. Le neoplasie mieloidi ed in particolare la leucemia mieloide cronica: concetti generali, patologia molecolare, diagnosi molecolare e terapie target. C. Le neoplasie mieloproliferative BCR/ABL negative: concetti generali, patologia molecolare, diagnosi molecolare e terapie target. D. Le neoplasie linfoidi, l'analisi della clonalità dei linfociti B e il linfoma mantellare: concetti generali, patologia molecolare, diagnosi molecolare e terapie target. E. Il linfoma follicolare: concetti generali, patologia molecolare, diagnosi molecolare e terapie target. F. La leucemia a cellule capellute e il linfoma di Burkitt: concetti generali, patologia molecolare, diagnosi molecolare e terapie target. G. Il linfoma linfoplasmocitico e il linfoma splenico della zona marginale: concetti generali, patologia molecolare, diagnosi molecolare e terapie target. H. La leucemia linfatica cronica: concetti generali, patologia molecolare, diagnosi molecolare e terapie target. . La leucemia linfoblastica acuta e le cellule CAR-T: concetti generali, patologia molecolare, diagnosi molecolare e terapie target. J. Malattia minima residua, medicina di precisione, sperimentazione clinica e concetto di “benefit sharing” in ematologia.
A. Hematopoiesis and hematopoietic stem cell B. General concepts of myeloid neoplasia and chronic myeloid leukemia: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment C. BCR/ABL negative myeloproliferative neoplasia (MPN): general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment D. General concepts on lymphoid neoplasia, Analysis of B-cell clonality, and Mantle cell lymphoma: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment E. Follicular lymphoma: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment F. Hairy cell leukemia and Burkitt lymphoma: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment G. Lymphoplasmacytic lymphoma and Splenic marginal zone lymphoma: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment H. Chronic lymphocytic leukemia: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment I. Acute lymphoblastic leukemia and CAR T-cells: general concepts, molecular pathology, molecular diagnostics and target treatment J. Minimal residual disease (MRD); Precision Medicine, Clinical Trials and Benefit Sharing in Hematoncology
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Alla fine del corso, lo studente sarà in grado di: i) analizzare criticamente la patologia molecolare di vari modelli di neoplasie ematologiche; ii) apprezzare l'importanza della patologia molecolare per migliorare la medicina di precisione, la diagnosi molecolare e la terapia mirata delle neoplasie ematologiche
At the end of the course, the student will be able to: i) critically analyse the molecular pathology of several models of hematologic malignancies; ii) appreciate the importance of molecular pathology for improving precision medicine, molecular diagnosis and target treatment in hematologic neoplasia
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Course
Molecular Basis of Regenerative Medicine
Course ID
MS2119
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
FOLLENZI Antonia
CFU
10
Teaching duration (hours)
60
SSD
BIO/17 - ISTOLOGIA, BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE
Course type
Attività formativa integrata
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS2120Histology, Gene and Cell Therapy BIO/17 - ISTOLOGIA Merlin Simone
MS2121Molecular Regenerative Medicine BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE Orso Francesca
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Course
Molecular Basis of Regenerative Medicine: Histology, Gene and Cell Therapy
Course ID
MS2120
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
MERLIN Simone
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
75
SSD
BIO/17 - ISTOLOGIA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
il principio della terapia cellulare e genica Cellule staminali Trasferimento genico da vettori virali e non virali
the principle of Cell and Gene Therapy Stem cells Gene transfer by viral and non viral vectors
Testi di riferimento/Textbooks
Per gli italiani: Mauro Giacca, Terapia genica, Springer. Corso di terapia genica animata, Utah University, USA Riviste: Terapia genica umana Terapia genetica Terapia genica del cancro Giornale di medicina genetica Terapia molecolare Natura Scienza Banche dati: NCBI - MEDLINE, GenBank, Genomi, ecc. Sistema informativo per la ricerca clinica sulla modificazione genetica (GeMCRIS) Sperimentazioni cliniche USA Database degli studi clinici Wiley
For italians: Mauro Giacca, Terapia genica, Springer. Animated gene therapy course, Utah University, USA Journals: Human Gene Therapy Gene Therapy Cancer Gene Therapy Journal of Gene Medicine Molecular Therapy Nature Science Databases: NCBI - MEDLINE, GenBank, Genomi, ecc. Genetic Modification Clinical Research Information System (GeMCRIS) Clinicaltrials USA Wiley clinical trial database
Obiettivi formativi/Mission
Gli studenti dovrebbero essere in grado di discutere gli articoli pubblicati sulla terapia cellulare e genica e la vettorelogia fondamentale utilizzata nella terapia genica negli studi preclinici e negli studi clinici.
The students should be come able to discuss cell and gene therapy published articles and fundamental vectorology used in gene therapy in preclinical studies and clinical trials.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze di Biologia Cellulare e Molecolare da corsi precedenti
Knowledge of Cell and Molecular biology from previous courses
Metodi didattici/Teaching methods
Presentazione in power point e articoli in PDF
Power point presentation and PDF articles
Altre informazioni/Further information
Seminario di gruppo preparato dagli studenti su un tema a scelta.
Group seminar prepared by the students on a chosen topic.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Prova scritta sugli argomenti del programma, con diverse domande a risposta multipla. Inoltre gli studenti in gruppo devono presentare un articolo con commento e discussione seminariale su un elaborato di terapia cellulare e genica scelto da ciascun gruppo
Written test on the topics of the program, with several multiple choice questions. Moreover the students in groups they have to present an article with a commentary and a seminar discussion on a cell and gene therapy paper chosen by each group
Programma esteso/Content
Cellule staminali, riprogrammazione cellulare e utilizzo di queste cellule nei protocolli di terapia cellulare in ambito preclinico e potenziali applicazioni in ambito clinico. Isolamento, espansione in vitro e preparazione di cellule per terapia cellulare sperimentale. Vettori utilizzati per il trasferimento genico: vettori virali e non virali. Origine, costruzione e modifica. Modulazione delle cassette di espressione: espressione costitutiva e regolata. regolazione dell'espressione trascrizionale o post-trascrizionale Risposta immunitaria a vettori e transgeni utilizzati nel trasferimento genico. Concetti di terapia genica ex vivo e in vivo. Sperimentazioni cliniche che utilizzano strategie di terapia cellulare e genica delle malattie bersaglio.
Stem cells, cellular reprogramming and use of these cells in cell therapy protocols in preclinical and potential applications in the clinic. Isolation, in vitro expansion and preparation of cells for experimental cell therapy. Vectors used for gene transfer: viral vectors and non-viral. Origin, construction and modification. Modulation of Expression cassettes: Constitutive and regulated expression. transcriptional or post-transcriptional expression regulation Immune response to vectors and transgenes used in gene transfer. Concepts of ex vivo and in vivo gene therapy. Clinical trials using cell and gene therapy strategies of target diseases.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Capacità di leggere e commentare un articolo scientifico sulla terapia cellulare e genica
Capacity to read and comment a scientific paper on cell and gene therapy
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Course
Molecular Basis of Regenerative Medicine: Molecular Regenerative Medicine
Course ID
MS2121
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
ORSO Francesca
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
75
SSD
BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course category
B
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Ripasso di argomenti generali di Biologia Molecolare rilevanti per la comprensione del corso. Rimodellamento della cromatina: modificazioni degli istoni, metilazione del DNA Fattori di trascrizione (Myc, Fos) Definizione epigenetica: malattie epigenetiche e terapie epigenetiche. Oncogeni e geni oncosoppressori. Funzione di P53 nelle cellule normali e tumorali. MDM2 come oncogene. Funzione di pRb. Eterogeneità dei tumori, teorie stocastiche e gerarchiche, proprietà delle cellule staminali tumorali, loro isolamento, divisioni asimmetriche e simmetriche. Vie di segnalazione attivate nelle cellule staminali tumorali, implicazioni terapeutiche delle cellule staminali tumorali. Riprogrammazione di cellule somatiche a pluripotenza mediante trasferimento nucleare di cellule somatiche (SCNT) in ovociti. Fusione tra cellule somatiche e pluripotenti ed espressione ectopica di fattori di trascrizione definiti. Pecore clonate mediante trasferimento nucleare (pecora Dolly). Cellule staminali pluripotenti indotte (cellule iPS); papers di Yamanaka; riprogrammazione da fattori di trascrizione; cause di bassa efficienza di riprogrammazione. Parallelismi tra riprogrammazione epigenetica e cancro. Uso terapeutico delle cellule iPS e delle cellule staminali embrionali.
Review of general topics of Molecular Biology relevant to the understanding of the course. Chromatin Remodeling: Histone Modifications, DNA methylation Structural classes of transcription factors (Myc, Fos) Epigenetic definition: epigenetic diseases and epigenetic therapies. Oncogenes and tumor suppressor genes. P53 function in normal and tumoral cells. MDM2 as an oncogene. pRb function. Heterogeneity of tumors, stochastic and hierarchical theories, properties of cancer stem cells, their isolation, asymmetric and symmetric divisions. Signaling Pathways activated in cancer stem cells, therapeutic implications of cancer stem cells. Reprogramming of somatic cells to pluripotency by somatic cell nuclear transfer (SCNT) into oocytes. Fusion between somatic and pluripotent cells and ectopic expression of defined transcription factors. Sheep cloned by nuclear transfer (Dolly sheep). Induced pluripotent stem cells (iPS cells); Yamanaka papers; reprogramming by transcription factors; causes of low reprogramming efficiency. Parallelisms between epigenetic reprogramming and cancer. Therapeutic use of iPS Cells and embryonic stem cells.
Testi di riferimento/Textbooks
Molecular Biology of the Cell Alberts Scientific Papers
Molecular Biology of the Cell Alberts Scientific Papers
Obiettivi formativi/Mission
Fornire conoscenze di base di biologia, riprogrammazione e pluripotenza delle cellule staminali con particolare riferimento alle applicazioni biomediche e alla comprensione dei principali processi cellulari.
Provide basic knowledge of stem cell biology, reprogramming and pluripotency with particular reference to bio-medical applications, their research perspectives and the understanding of the major cellular processes.
Prerequisiti/Required background knowledge
Nozioni di base di biologia cellulare e biologia molecolare
A basic understanding of cell biology and molecular biology.
Metodi didattici/Teaching methods
Presentazioni power-points e articoli scientifici selezionati
PowerPoint presentations of lessons and articles provided by the lecturer
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Esame scritto e presentazione orale di articoli scientifici.
Written Examination and oral presentation of a scientific journal article.
Programma esteso/Content
Ripasso di argomenti generali di Biologia Molecolare rilevanti per la comprensione del corso. Rimodellamento della cromatina: modificazioni degli istoni, metilazione del DNA Fattori di trascrizione (Myc, Fos) Definizione epigenetica: malattie epigenetiche e terapie epigenetiche. Oncogeni e geni oncosoppressori. Funzione di P53 nelle cellule normali e tumorali. MDM2 come oncogene. Funzione di pRb. Eterogeneità dei tumori, teorie stocastiche e gerarchiche, proprietà delle cellule staminali tumorali, loro isolamento, divisioni asimmetriche e simmetriche. Vie di segnalazione attivate nelle cellule staminali tumorali, implicazioni terapeutiche delle cellule staminali tumorali. Riprogrammazione di cellule somatiche a pluripotenza mediante trasferimento nucleare di cellule somatiche (SCNT) in ovociti. Fusione tra cellule somatiche e pluripotenti ed espressione ectopica di fattori di trascrizione definiti. Pecore clonate mediante trasferimento nucleare (pecora Dolly). Cellule staminali pluripotenti indotte (cellule iPS); papers di Yamanaka; riprogrammazione da fattori di trascrizione; cause di bassa efficienza di riprogrammazione. Parallelismi tra riprogrammazione epigenetica e cancro. Uso terapeutico delle cellule iPS e delle cellule staminali embrionali.
Review of general topics of Molecular Biology relevant to the understanding of the course. Chromatin Remodeling: Histone Modifications, DNA methylation Structural classes of transcription factors (Myc, Fos) Epigenetic definition: epigenetic diseases and epigenetic therapies. Oncogenes and tumor suppressor genes. P53 function in normal and tumoral cells. MDM2 as an oncogene. pRb function. Heterogeneity of tumors, stochastic and hierarchical theories, properties of cancer stem cells, their isolation, asymmetric and symmetric divisions. Signaling Pathways activated in cancer stem cells, therapeutic implications of cancer stem cells. Reprogramming of somatic cells to pluripotency by somatic cell nuclear transfer (SCNT) into oocytes. Fusion between somatic and pluripotent cells and ectopic expression of defined transcription factors. Sheep cloned by nuclear transfer (Dolly sheep). Induced pluripotent stem cells (iPS cells); Yamanaka papers; reprogramming by transcription factors; causes of low reprogramming efficiency. Parallelisms between epigenetic reprogramming and cancer. Therapeutic use of iPS Cells and embryonic stem cells.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Fornire conoscenze di base di biologia, riprogrammazione e pluripotenza delle cellule staminali con particolare riferimento alle applicazioni biomediche, alle prospettive di ricerca e alla comprensione dei principali processi cellulari.
Provide basic knowledge of stem cell biology, reprogramming and pluripotency with particular reference to bio-medical applications, their research perspectives and the understanding of the major cellular processes.
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Course
Functional Genomics
Course ID
MS0455
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
GIORDANO Mara
CFU
11
Teaching duration (hours)
58
SSD
MED/03 - GENETICA MEDICA, BIO/10 - BIOCHIMICA, BIO/18 - GENETICA
Course type
Attività formativa integrata
Course mandatoriety
OBB
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
ENGLISH
Modules
Course ID Course SSD Teachers Agenda web
MS0456Genomic analysis MED/03 - GENETICA MEDICA Giordano Mara
MS0457Regulation of gene expression BIO/10 - BIOCHIMICA Baldanzi Gianluca
MS0458Genetics BIO/18 - GENETICA Gagliardi Mara
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Course
Functional Genomics: Genomic analysis
Course ID
MS0456
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
GIORDANO Mara
Teachers
CFU
5
Teaching duration (hours)
30
Individual study time
95
SSD
MED/03 - GENETICA MEDICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
Inglese
English
Contenuti/Content Summary
Progetto Genoma umano . Struttura e Evoluzione del genoma umano. Metodi di studio delle malattie monogeniche e multifattoriali. Analisi di riarrangiamenti genomici mediante CGH array. Tecniche di Sequenziamento di Nuova generazione (NGS). Imprintig genomico. Metodi per studiare le variazioni epigenetiche nel genoma Umano.
Human Genome Project. Structure and Evolution of the Human Genome. Methods of studying monogenic and multifactorial diseases. Analysis of genomic rearrangements by CGH array. Next Generation Sequencing Techniques (NGS). Genomic imprintig. Methods for studying epigenetic variations in the Human genome.
Testi di riferimento/Textbooks
Articoli su riviste scelti dal docente
Articles in Juornals chosen by the Professor
Obiettivi formativi/Mission
Il corso mira ad illustrare i principali approcci di analisi genomica. La prima parte del corso sarà impiegata per far comprendere la struttura e l’evoluzione del genoma che sono i requisiti principali per poi passare ai metodi di analisi genomica. Gli studenti impareranno poi ad applicare le tecnologie basate sui DNA microarrays e sul sequenziamento di nuova generazione affrontandone i problemi e comprendendone le prospettive. Lo studente dovrà conoscere la genetica di base, le modalità di trasmissione delle malattie mendeliane. Inoltre dovrà anche essere a conoscenza delle principali tecniche di genetica molecolare. Lezioni frontali con diapositive . Seminari degli studenti come approfondimento di argomenti trattati a lezione. Esercitazioni mediante quiz interattivi. Esercitazioni in aula computer Esame finale scritto con domande aperte Esame orale Progetto Genoma Umano : le tappe principali del progetto e la metodologia Struttura e Evoluzione del genoma umano. Struttura della cromatina e del cromosoma. Elementi trasponibili nel genoma. Funzione dei trasposoni durante l’evoluzione. Sequenze ripetute nel genoma. Significato delle Copy Number Variations. Analisi del genoma. Metodi di studio delle malattie monogeniche e multifattoriali. Analisi di riarrangiamenti genomici mediante CGH array. Tecniche di Sequenziamento di Nuova generazione (NGS).
The course aims to illustrate the main approaches of genomic analysis. The first part of the course will be used to understand the structure and evolution of the genome that are the main requirements and then move on to genomic analysis methods. Students will then learn to apply DNA-based microarrays and next-generation sequencing technologies, addressing their problems and understanding their perspectives.
Prerequisiti/Required background knowledge
Il corso mira ad illustrare i principali approcci di analisi genomica. La prima parte del corso sarà impiegata per far comprendere la struttura e l’evoluzione del genoma che sono i requisiti principali per poi passare ai metodi di analisi genomica. Gli studenti impareranno poi ad applicare le tecnologie basate sui DNA microarrays e sul sequenziamento di nuova generazione affrontandone i problemi e comprendendone le prospettive. Lo studente dovrà conoscere la genetica di base, le modalità di trasmissione delle malattie mendeliane. Inoltre dovrà anche essere a conoscenza delle principali tecniche di genetica molecolare.
The student is supposed to know the basic genetics and the modalities of transmission of Mendelian diseases. Moreovere the students must know the main molecular genetic techniques.
Metodi didattici/Teaching methods
Lezioni frontali con diapositive . Seminari degli studenti come approfondimento di argomenti trattati a lezione. Esercitazioni mediante quiz interattivi. Esercitazioni in aula computer
Frontal lessons with slides. Student seminars as an in-depth study of topics covered in class. Tutorials through interactive quizzes. Exercises in the computer classroom
Altre informazioni/Further information
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Esame finale scritto con domande aperte Esame orale
The final exam for the comprehensive course will consist in a written exam including all the three subjects of the course, namely Genomic Analysis, Regulation of gene expression and Genetics. For each subjects there will be four statements requiring the answer true/false and eventually a brief comment of maximum 10 lines. The maximum time allowed will be 90 minutes. The results will be given within three-four days and if the student wishes to increase the grade he/she can do an oral exam.
Programma esteso/Content
Progetto Genoma Umano : le tappe principali del progetto e la metodologia Struttura e Evoluzione del genoma umano. Struttura della cromatina e del cromosoma. Elementi trasponibili nel genoma. Funzione dei trasposoni durante l’evoluzione. Sequenze ripetute nel genoma. Significato delle Copy Number Variations. Analisi del genoma. Metodi di studio delle malattie monogeniche e multifattoriali. Analisi di riarrangiamenti genomici mediante CGH array. Tecniche di Sequenziamento di Nuova generazione (NGS).
Human Genome Project: the main stages of the project and the methodology Structure and Evolution of the Human Genome. Chromatin and chromosome structure. Transposable elements in the genome. Transposons function during evolution. Repeated sequences in the genome. Function of Copy Number Variations. Genome analysis. Methods of studying monogenic and multifactorial diseases. Analysis of genomic rearrangements by CGH array. New Generation Sequencing Techniques (NGS). Genome sequencing. Exome sequencing. Sequencing of the transcriptome. Genomic imprintig. Methods for studying epigenetic variations in the Human genome. Analysis of genomic methylation. Identification of genes that cause genetic diseases in humans through NGS. Study of multifactorial diseases by GWAS (Genome wide association study).
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Ampia conoscenza del genoma Umano e dei metodi di analisi genomica di nuova generazione con particolare riferimento all'identificazione dei geni coinvolti in malattie genetiche.
Extensive knowledge of the Human genome and of new generation genomic analysis methods with particular attention to the identification of genes involved in genetic diseases.
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Course
Functional Genomics: Regulation of gene expression
Course ID
MS0457
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
GIORDANO Mara
CFU
5
Teaching duration (hours)
20
Individual study time
95
SSD
BIO/10 - BIOCHIMICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
B
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
ENGLISH
Contenuti/Content Summary
Dopo una rapida revisione della struttura del gene in eucarioti e procarioti, sarà presentato il problema della regolazione dell'espressione genica. La prima parte del corso si occuperà di espressione genica procarioti e dal suo regolamento. Una serie di esempi illustrerà la possibilità di ingegneria promotori e geni per scopi biotecnologici. La seconda parte del corso tratterà con l'espressione genica eucarioti e i livelli multipli del suo regolamento. Problemi: 1) cromatina e struttura, funzione di fattore di trascrizione 2), 3) pre-iniziazione complesso, terminazione 4) trascrizione, 5) RNA stabilità e traduzione 6) RNA. La terza parte del corso tratterà con i meccanismi da cui segnali extracellulari e intracellulari spunti regola l'espressione genica negli eucarioti. Un particolare porrà l'accento sulle alterazioni dell'espressione genica nel cancro e sulla regolazione dell'espressione genica in funzione delle sostanze nutrienti e condizione metabolica della cellula. Verranno anche presentate tecniche biochimiche e biologico molecolari di base.
After a quick review of gene structure in eukaryotes and prokaryotes, the issue of gene expression regulation will be presented. The first part of the course will deal with prokaryotes gene expression and its regulation. A series of examples will illustrate the possibility of engineering promoters and genes for biotechnological purposes. The second part of the course will deal with the eukaryotes gene expression and the multiple levels of its regulation. Issues: 1) chromatin organization and structure, 2) transcription factor function, 3) pre-initiation complex, 4) transcription termination, 5) RNA stability and 6) RNA translation. The third part of the course will deal with the mechanisms by which extracellular signals and intracellular cues regulates gene expression in eukaryotes. A particular emphasis will be placed on the alterations of gene expression in cancer and on the regulation of gene expression in function of nutrients and metabolic status of the cell. Basic molecular biochemical and biological techniques will also be presented.
Testi di riferimento/Textbooks
Per rinfrescare le basi: - Harper's Illustrated Biochemistry, 29e, Robert K. Murray, David A. Bender, Kathleen M. Botham, Peter J. Kennelly, Victor W. Rodwell, P. Anthony Weil Please note: available on Access Medicine for our students - Molecular Biology of the Cell - Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter Edition:5th Please note: the 4th edition is available for free on NCBI bookshelf http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21054/ Testi per il corso: - Genomes 3 By Terence A. Brown Please note: the 2nd edition is available for free on NCBI bookshelf http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21128/ - Cell Signalling Biology Professor Sir Michael Berridge http://www.biochemj.org/csb/ - An extended series of reviews as evidenced during the course.
For the improvement of students background - Harper's Illustrated Biochemistry, 29e, Robert K. Murray, David A. Bender, Kathleen M. Botham, Peter J. Kennelly, Victor W. Rodwell, P. Anthony Weil Please note: available on Access Medicine for our students - Molecular Biology of the Cell - Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter Edition:5th Please note: the 4th edition is available for free on NCBI bookshelf http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21054/ Suggested textbook - Genomes 3 By Terence A. Brown Please note: the 2nd edition is available for free on NCBI bookshelf http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21128/ - Cell Signalling Biology Professor Sir Michael Berridge http://www.biochemj.org/csb/ - An extended series of reviews as evidenced during the course.
Obiettivi formativi/Mission
Potenziare le conoscenze e le abilità operative in biologia molecolare applicata allo studio dell'espressione genica. Fornire gli strumenti conoscitivi per la lettura critica della letteratura. Fornire le basi operative nel laboratorio biologico molecolare.
Enhance knowledge and operational skills in molecular biology applied to the study of gene expression. Provide the cognitive tools for the critical reading of literature. Provide the operational bases in the molecular biological laboratory.
Prerequisiti/Required background knowledge
• Biologia di base: organizzazione intracellulare procarioti e negli eucarioti. • Basi di biochimica: convenienze di enzima struttura e metabolismo, sintesi delle proteine, DNA e RNA. • Basi di biologia molecolare: concetto di gene, espressione genica, promotore, fattore di trascrizione, sintesi di RNA e degradazione. Per gli studenti a cui manca un forte background nelle scienze della vita una serie di letture saranno proposte per migliorare le loro abilità su tali argomenti.
Basic Biology: Prokaryotes and Eukaryotes intracellular organization. Basic biochemistry: DNA and RNA structure and metabolism, protein synthesis, enzyme proprieties, major metabolic pathways. Basic molecular biology: concept of gene, gene expression, promoter, transcription factor, RNA synthesis and degradation. For the students lacking a strong background in life sciences a series of readings will be proposed to improve their skills on those topics.
Metodi didattici/Teaching methods
Durante il corso verranno ampiamente utilizzate diapositive e webinar. Il lavoro di classe sarà integrato da un'introduzione in laboratorio. Gli studenti intraprenderanno inoltre attività di ricerca / presentazione / lavoro di squadra guidate dagli insegnanti.
During the course, slides and webinars will be extensively used. Classwork will be complemented by an introduction in the laboratory. Students will also undertake teacher driven research/presentation/teamwork.
Altre informazioni/Further information
Una copia delle diapositive e dei siti Web utilizzati durante il corso sarà disponibile sul sito DIR.
A copy of the slides and the websites used during the course will be available on the DIR site.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
L'esame finale per il corso completo consisterà in una prova orale con possibilità di realizzare grafici alla lavagna. L'esame comprende tutte e tre le materie del corso, vale a dire l'analisi genomica, la regolazione dell'espressione genica e la genetica. La lista degli argomenti per l'esame sarà discussa con gli studenti a lezione ed il voto integrato con eventuali lavori di gruppo svolti dallo studente.
The final exam for the complete course will consist of an oral exam with the possibility of creating graphs on the blackboard. The exam covers all three course subjects, namely genomic analysis, gene expression regulation and genetics. The list of topics for the exam will be discussed with the students in class and the vote integrated with any group work carried out by the student.
Programma esteso/Content
Argomento 1 Regolazione dell'espressione genica. Richiamo dell'organizzazione dei geni negli eucarioti (enhancers, promotori, sito di inizio della trascrizione, introni/esoni, siti di terminazione della trascrizione). Controllo della trascrizione genica a livello di: a) tasso di inizio di trascrizione, 2) splicing e splicing alternativoi , 3) stabilità del mRNA, 4) interferenza tra RNA e microRNA. Organizzazione di fattori di trascrizione: struttura dei domini di associazione al DNA e di trans-attivazione. Principali sequenze regolatrici del DNA. Assemblaggio del complesso d'inizio di trascrizione della RNApolII e cenni per altre polimerasi. Metodi di studio degli elementi regolatori sul DNA, della struttura dei promotori e dei siti di legame dei fattori di trascrizione. Fattori di trascrizione e struttura della cromatina, espressione di gene e di rimodellamento della cromatina. Mdificazioni Post trascrizionali degli istoni e il codice istonico. Metilazione del DNA. Altri modi per regolare l'espressione genica: promotori alternativi, splicing alternativo, controllo di stabilità del mRNA, controllo della traduzione degli mRNA, miRNA e RNA interference. Argomento 2 Controllo dell'espressione genica da segnali extracellulari ed intracellulari. Come le vie di trasduzione del segnale regolano l'espressione genica: - la famiglia dei recettori nucleari -la famiglia STAT - ERK signaling per gli elementi di risposta del siero, NF-kB. Metodi di studio della trasduzione del segnale. Argomento 3 mutazioni in fattori di trascrizione e cancro Le mutazioni di P53 e tumorigenesi, formazione di Hif in risposta all'ipossia, amplificazione di myc e tumore. Casi studio: 1) fattori di trascrizione ed il metabolismo tumorale, 2) come alterazioni del metabolismo (cioè abitudini o stato energetico cellulare) influenzano l'espressione dei geni e lo stato della cromatina. Brevi esperienze di laboratorio simulate od in presenza sulle tecniche di base.
Topic 1 Regulation of gene expression. Recall of the organization of genes in eukaryotes (enhancers, promoters, transcription initiation site, introns / exons, transcription termination sites). Control of gene transcription at the level of: a) transcription initiation rate, 2) alternative splicing and splicing, 3) mRNA stability, 4) interference between RNA and microRNA. Organization of transcription factors: structure of DNA binding and transactivation domains. Main DNA regulatory sequences. Assembly of the RNApolII transcription initiation complex and hints for other polymerases. Methods for studying the regulatory elements on DNA, the structure of the promoters and the binding sites of transcription factors. Transcription factors and chromatin structure, gene expression and chromatin remodeling. Post transcriptional modifications of histones and the histone code. DNA methylation. Other ways to regulate gene expression: alternative promoters, alternative splicing, mRNA stability control, mRNA translation control, miRNA and RNA interference. Topic 2 Control of gene expression by extracellular and intracellular signals. How the signal transduction pathways regulate gene expression: - the nuclear receptor family - the STAT family - ERK signaling for the serum response elements, NF-kB. Methods of studying signal transduction. Topic 3 mutations in transcription factors and cancer Mutations of P53 and tumorigenesis, Hif formation in response to hypoxia, myc and tumor amplification. Case studies: 1) transcription factors and tumor metabolism, 2) how alterations in metabolism (ie habits or cellular energy status) influence gene expression and chromatin status. Short simulated or face-to-face laboratory experiences on basic techniques.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
Comprensione dei meccanismi di regolazione dell'espressione genica. Utilizzo operativo di tale conoscenza per la valutazione della letteratura. Ideazione guidata di percorsi sperimentali utilizzabili per la ricerca teorica od applicativa.
Understanding of the mechanisms of regulation of gene expression. Operational use of this knowledge for the evaluation of the literature. Guided design of experimental paths that can be used for theoretical or applicative research.
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Course
Functional Genomics: Genetics
Course ID
MS0458
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
GIORDANO Mara
CFU
1
Teaching duration (hours)
8
Individual study time
17
SSD
BIO/18 - GENETICA
Course type
Modulo di sola Frequenza
Course mandatoriety
OBB
Course category
C
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Frequenza obbligatoria
1
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
ENGLISH
Testi di riferimento/Textbooks
No textbook. Students will study on the scientific papers discussed during the classes and made available from the professor.
Obiettivi formativi/Mission
The aim of this course is to learn most recent data on non-coding elements in the genome and in mammalian transcriptome. Specifically, the course will focus on long non-coding RNAs (lncRNAs) their structure and functions. Moreover, the students will know about antisense transcription, its main features and its function in the cell. Examples will be provided on possible therapeutic applications of lncRNAs. An additional aim of the course is the discussion of a recent published paper focusing on recently discovered lncRNA and its function. Experimental details will be discussed.
Prerequisiti/Required background knowledge
The students must have a solid background in Molecular Biology, Genetics and Cell Biology
Metodi didattici/Teaching methods
The students receive copy of PDF files of scientific papers discussed in the course.
Altre informazioni/Further information
nputs from the professor on bibliographic search in the field of lncRNAs.
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
The final exam for the comprehensive course will consist in a written exam including all the three subjects of the course, namely Genomic Analysis, Regulation of gene expression and Genetics. For each subjects there will be four statements requiring the answer true/false and eventually a brief comment of maximum 10 lines. The maximum time allowed will be 90 minutes. The results will be given within three-four days and if the student wishes to increase the grade he/she can do an oral exam.
Programma esteso/Content
Complexity of the human genome and role of non-coding elements in contributing to genome complexity Definition of mammalian transcriptome and history of the discovery of lncRNAs Features of lncRNAs in comparison with those of protein-coding mRNAs Description of the experimental procedures used to discover lncRNA features Antisense transcription Description of lncRNA functions Therapeutic applications of lncRNAs: present and future prospects Seminar-type discussion on a newly discovered lncRNA: features and function (experimental details will also be discussed)
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Course
Optional Activities 1
Course ID
MS0497
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
CFU
4
Teaching duration (hours)
32
SSD
NN -
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course mandatoriety
OBB
Course category
D
Year
1
Period
Secondo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
G
×
Print
Course
1st year Basic courses
Course ID
MS2002
Academic Year
2022/2023
Year of rule
2022/2023
Degree
MEDICAL BIOTECHNOLOGY
Curriculum
CORSO GENERICO
Teaching leader
CAPPELLANO GIUSEPPE
SSD
NN -
Course type
Attività formativa monodisciplinare
Course category
D
Year
1
Period
Primo Semestre
Site
NOVARA
Grading type
V
Lingua insegnamento/Teaching language
INGLESE
English
Contenuti/Content Summary
Il corso si propone di fornire agli studenti le conoscenze basilari sul funzionamento del sistema immunitario, sull'infiammazione, sulla risposta immunitaria agli agenti infettivi e sulle cause e patogenesi delle malattie umane. Questo corso è non solo per quei studenti laureati (laurea triennale) che dovrebbero aver completato con successo i corsi di immunologia di base, ma anche per studenti che entrano approcciano l'immunologia per la prima volta.
The course aims to provide to the students basic knowledge about the functioning of the immune system, inflammation, immune response against infectious agents and the causes and pathogenesis of human diseases. This course is designed not only for graduate students (bachelor) that are expected to have successfully completed basic immunology course(s), but also for students that come in contact with immunology for the first time.
Testi di riferimento/Textbooks
Kuby Immunology Eighth Edition| ©2019
Kuby Immunology Eighth Edition| ©2019
Obiettivi formativi/Mission
- Gli studenti apprenderanno i concetti base dell'immunologia; - Gli studenti saranno in grado di descrivere il ruolo del sistema immunitario sia nel mantenimento dello stato di salute che nel contribuire alla malattia.
- The students will learn the basic concepts of immunology; - The students will be able to describe the roles of the immune system in both maintaining health and contributing to disease.
Prerequisiti/Required background knowledge
Conoscenze basilari di biologia cellulare e molecolare
Basic knowledge of molecular and biology
Metodi didattici/Teaching methods
Diapositive in power poitn
PowerPoint slides
Altre informazioni/Further information
Nessuna
None
Modalità di verifica dell'apprendimento/Assessment methods
Nessuna
None
Programma esteso/Content
- Introduzione: concetti di base dell'immunità, sistema di difesa (barriere meccaniche, chimiche, biologiche); - Immunità innata: componente cellulare e umorale. Immunità adattativa: linfociti T (helper e citotossici) e linfociti B; - Sistema linfoide. Riconoscimento dell'antigene da parte dei linfociti B: la struttura di un anticorpo, ricombinazione VDJ, switch isotipico; memoria immunologica - Riconoscimento dell'antigene da parte dei linfociti T: struttura del TCR e dei corecettori, ricombinazione VDJ, maturazione dei linfociti T ( selezione positiva e negativa), molecole del complesso maggiore di istocompatibilità (MHC I e II); - L'interazione tra immunità innata e adattativa; - Ripasso generale
- Introduction: basic concepts of immune system, mechanical, chemicals and microbiological defensive barriers; - Innate immunity: cellular and humoral component. Adaptive immunity: T (helper and cytotoxic) and B cells; - Lymphoid system. Antigen Recognition by B-cell: the structure of a typical antibody: diversity of Immunoglobulins, VDJ recombination, isotypic switch;immunological memory, effector mechanisms antibody-mediated; - Antigen recognition by T cells: the structure of TCR and coreceptors, VDJ recombination, maturation of T cells (negative and positive selection), MHC I and II molecules; - The interaction between innate and adaptive immunity, refresh of key concepts.
Risultati di apprendimento attesi/Intended learning objectives
- Conoscenze del sistema immunitario sia nel mantenimento dello stato di salute che nel contribuire alla malattia; - Conoscenza delle basi cellulari e molecolari della risposta immunitaria; - Conoscenza di come viene attivata e regolata la risposta immunologica.
- Knowledge of the immune system in both maintaining health and contributing to disease; - Knowledge of the cellular and molecular basis of immune responsiveness; - Knowledge about how immunological response is triggered and regulated.
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Year Course ID Course Teachers SSD Curriculum Site CFU
1 MS2002 1st year Basic courses Giordano Mara, Capello Daniela, Cappellano Giuseppe, Borsotti Chiara NN All NOVARA 0
1 MS2143 3D models and Technologies for Tissue Engineering Cochis Andrea MED/50 Cell Therapy, Tissue Engineering And Regenerative Medicine NOVARA 5
1 MS2140 Applied Biomaterials and Nanotechnologies Rimondini Lia, Serra Tiziano MED/50, ING-IND/34 Cell Therapy, Tissue Engineering And Regenerative Medicine NOVARA 6
1 MS1864 Big Data Analysis Cora' Davide BIO/11 System Biomedicine NOVARA 5
1 MS0452 Fertility, reproduction and endocrine system biotechnologies Marzullo Paolo, Remorgida Valentino MED/13, MED/40 The Molecular Basis Of Disease NOVARA 4
1 MS1868 Forensomics and biotechnological applications Ellis Steven Robert, Gino Sarah BIO/13, MED/43 System Biomedicine NOVARA 11
1 MS0455 Functional Genomics Giordano Mara, Baldanzi Gianluca, Gagliardi Mara MED/03, BIO/10, BIO/18 All NOVARA 11
1 MS0459 Internal Medicine Bellan Mattia MED/09 The Molecular Basis Of Disease NOVARA 5
1 MS0495 Internship 1 NN Cell Therapy, Tissue Engineering And Regenerative Medicine NOVARA 4
1 MS0495 Internship 1 NN The Molecular Basis Of Disease NOVARA 4
1 MS1879 Internship 1 NN System Biomedicine NOVARA 3
1 MS2116 Molecular Basis of Neoplastic and proliferative disorders Isidoro Ciro, Gaidano Gianluca MED/04, MED/15 All NOVARA 13
1 MS2119 Molecular Basis of Regenerative Medicine Merlin Simone, Orso Francesca, Follenzi Antonia BIO/17, BIO/11 All NOVARA 10
1 MS0465 Molecular therapy Ellis Steven Robert, Cargnin Sarah BIO/13, BIO/14 The Molecular Basis Of Disease NOVARA 11
1 MS0465 Molecular therapy Ellis Steven Robert, Cargnin Sarah BIO/13, BIO/14 Cell Therapy, Tissue Engineering And Regenerative Medicine NOVARA 11
1 MS0468 Molecular virology Gariglio Marisa, Lo Cigno Irene MED/07 System Biomedicine NOVARA 6
1 MS0468 Molecular virology Gariglio Marisa, Lo Cigno Irene MED/07 The Molecular Basis Of Disease NOVARA 6
1 MS0497 Optional Activities 1 NN All NOVARA 4
1 MS2135 Principles of Regenerative Medicine and Tissue Engineering Boccafoschi Francesca, Borsotti Chiara, Cochis Andrea, Chiocchetti Annalisa BIO/16, BIO/17, MED/50, MED/04 Cell Therapy, Tissue Engineering And Regenerative Medicine NOVARA 6
1 MS1865 Structural genomics Giordano Mara, Persichetti Francesca, Favero Francesco BIO/18 System Biomedicine NOVARA 5
2 MS1874 Clinical Omics Gennari Alessandra, Cantaluppi Vincenzo, Gaidano Gianluca, Chiocchetti Annalisa MED/06, MED/14, MED/15, MED/04 System Biomedicine NOVARA 11
2 MS0451 Experimental thesis PROFIN_S All NOVARA 14
2 MS0496 Internship 2 NN The Molecular Basis Of Disease NOVARA 6
2 MS1880 Internship 2 NN System Biomedicine NOVARA 3
2 MS0461 Molecular diagnostics Mahmoud Abdurraouf Mokhtar Saleh, Capello Daniela, Cappellano Giuseppe, Boldorini Renzo Luciano MED/08, BIO/12, MED/05 The Molecular Basis Of Disease NOVARA 11
2 MS0473 Public health and regulatory aspects Faggiano Fabrizio, Ferrante Daniela, Gattei Valter MED/42, SECS-P/07, MED/01 All NOVARA 11
2 MS2001 Scientific English Course for the thesis Kalinina Irina NN All NOVARA 0
2 MS1871 Synthetic Biology and Proteomics Cotella Diego, Manfredi Marcello BIO/13, BIO/10 System Biomedicine NOVARA 10
2 MS0480 Transplantation and Biocompatibility Patriarca Andrea, Cantaluppi Vincenzo, Chiocchetti Annalisa, Boccafoschi Francesca, Rimondini Lia, Mantovani Diego MED/15, MED/14, MED/04, BIO/16, MED/28, BIO/11 The Molecular Basis Of Disease NOVARA 7
Data synched: 28/04/2024, 01:05